天然产物根瘤菌素和双链酰胺属于高效肌动蛋白结合剂的精英类别。它们通过IC 50对多种肿瘤
细胞系显示出强大的抗增殖活性值在低纳摩尔范围内。在分子
水平上,它们通过特异性结合G-肌动蛋白的几个关键位点来破坏肌动蛋白的细胞骨架,从而导致肌动蛋白丝的稳定。根瘤菌素和双链酰胺的重要
生物学特性,再加上其独特而有趣的分子结构,使其成为吸引人们进一步发展的化合物。但是,这些代谢物的结构复杂性严重阻碍了这一过程。我们在分子建模,有机合成和
化学生物学之间的界面上启动了一种跨学科方法,以支持进一步的
生物学应用。我们还希望扩展结构-活性关系研究,以期获得具有强大
生物学特性的简化类似物。我们报告了涉及分子对接的肌动蛋白-
抑制剂相互作用的计算分析,在已知的肌动蛋白结合
配体上进行了验证,结果表明晶体与模型结构之间存在紧密匹配。根据这些结果,简化了
配体的形状,并设计了更容易获得的根瘤菌素-双链酰胺模拟物。这些化合物的合成采