p-nitrophenyl β-D-fucopyranosyl-(1,3)-α-D-mannopyranoside | 1283768-40-0

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机氧化合物
• 英文名称: p-nitrophenyl β-D-fucopyranosyl-(1,3)-α-D-mannopyranoside
• CAS: 1283768-40-0
• 化学式: C₁₈H₂₅NO₁₂
• 分子量: 447.396
• InChiKey: PLCOQGCLEGKJIR-MMXPSQPFSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -2.37
• 重原子数：
  31.0
• 可旋转键数：
  6.0
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.67
• 拓扑面积：
  201.44
• 氢给体数：
  6.0
• 氢受体数：
  12.0

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  4-硝基苯-BETA-D-吡喃半乳糖苷 、 对硝基苯-Alpha-D-吡喃甘露糖苷 在 recombinant β-D-galactosidase from Paenibacillus thiaminolyticus, histidine-tagged protein 作用下， 反应 5.0h， 以69%的产率得到p-nitrophenyl β-D-fucopyranosyl-(1,3)-α-D-mannopyranoside
  参考文献：
  名称：

   -D-Galactosidase from Paenibacillus thiaminolyticus catalyzing transfucosylation reactions

  摘要：

  构建了细菌株Paenibacillus thiaminolyticus的基因组文库，并对克隆中包含编码具有β-d-岩藻糖苷酶活性的β-d-半乳糖苷酶基因的质粒DNA进行了测序。采用大肠杆菌BL21（DE3）细胞生产该酶，形式为带有组氨酸标签的蛋白质。使用Ni-NTA琼脂糖亲和层析纯化了该重组融合蛋白，并通过使用对硝基苯基β-d-岩藻糖吡喃苷（Km值为(1.18 ± 0.06) mmol/L）、对硝基苯基β-d-半乳糖吡喃苷（Km值为(250 ± 40) mmol/L）、对硝基苯基β-d-葡萄糖吡喃苷（Km值为(77 ± 6) mmol/L）和乳糖（Km值为(206 ± 5) mmol/L）作为底物进行特征分析。最佳pH和温度分别估计为5.5和65°C。根据氨基酸序列计算，该融合蛋白的分子量为68.6 kDa，凝胶过滤层析确认该酶以单体形式存在。在接下来的步骤中，测试其催化转岩藻糖化反应的能力。该酶能够催化将岩藻糖基转移到不同的对硝基苯基糖吡喃苷上（生成对硝基苯基β-d-岩藻糖苷-(1,3)-β-d-岩藻糖苷、对硝基苯基β-d-岩藻糖苷-(1,3)-α-d-葡萄糖苷、对硝基苯基β-d-岩藻糖苷-(1,3)-α-d-甘露糖苷和对硝基苯基β-d-岩藻糖苷-(1,6)-α-d-半乳糖苷）和醇类（生成甲基β-d-岩藻糖苷、乙基β-d-岩藻糖苷、1-丙基β-d-岩藻糖苷、2-丙基β-d-岩藻糖苷、1-辛基β-d-岩藻糖苷和2-辛基β-d-岩藻糖苷）。这些结果表明使用该酶作为酶促合成β-d-岩藻糖化分子的有希望工具的可能性。

  DOI：

  10.1093/glycob/cwp196