(2S,3R)-2-[(benzyloxy)carbonyl]-1-[(tert-butoxy)carbonyl]piperidin-3-carboxylic acid | 176388-79-7

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 英文名称: (2S,3R)-2-[(benzyloxy)carbonyl]-1-[(tert-butoxy)carbonyl]piperidin-3-carboxylic acid
• CAS: 176388-79-7
• 化学式: C₁₉H₂₅NO₆
• 分子量: 363.411
• InChiKey: LUHJGOZUMZHDCB-CABCVRRESA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  2.83
• 重原子数：
  26.0
• 可旋转键数：
  4.0
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.53
• 拓扑面积：
  93.14
• 氢给体数：
  1.0
• 氢受体数：
  5.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  (2S,3R)-2-[(benzyloxy)carbonyl]-1-[(tert-butoxy)carbonyl]piperidin-3-carboxylic acid 在 10% palladium on active carbon N-甲基吗啉 、 氢气 、 O-(benzotriazol-1-yl)-N,N,N',N'-tetramethyluronium tetrafluoroborate 作用下， 以 甲醇 、 乙腈 为溶剂， 反应 2.0h， 生成 (2S,3R)-3-(methylcarbamoyl)-1-[(2-methylpropan-2-yl)oxycarbonyl]piperidine-2-carboxylic acid
  参考文献：
  名称：

  Ureido-Based Peptidomimetic Inhibitors of Herpes Simplex Virus Ribonucleotide Reductase:  An Investigation of Inhibitor Bioactive Conformation

  摘要：

  We have been investigating peptidomimetic inhibitors of herpes simplex virus (HSV) ribonucleotide reductase (RR). These inhibitors bind to the HSV RR large subunit and consequently prevent subunit association and subsequent enzymatic activity. This report introduces a new series of compounds that contain an extra nitrogen (a ureido function) at the inhibitor N-terminus. This nitrogen improves inhibitor binding potency 50-fold over our first published inhibitor series. Evidence supports that this improvement in potency results from a new hydrogen-bonding contact between the inhibitor and the RR large subunit. This report also provides evidence for the bioactive conformation around two important amino acid residues contained in our inhibitors. A tert-butyl group, which contributes 100-fold to inhibitor potency but does not directly bind to the large subunit, favors an extended beta-strand conformation that is prevalent in solution and in the bound state. More significantly, the bioactive conformation around a pyrrolidine-modified asparagine residue, which contributes over 30 000-fold to inhibitor potency, is elucidated through a series of conformationally restricted analogues.

  DOI：

  10.1021/jm950825x
• 作为产物：
  描述：

  (2S,3R)-3-(methoxycarbonyl)piperidin-2-carboxylic acid 在 碳酸氢钠 、 1,8-二氮杂双环[5.4.0]十一碳-7-烯 、 lithium hydroxide 作用下， 以 四氢呋喃 、 1,4-二氧六环 、 水 为溶剂， 反应 18.25h， 生成 (2S,3R)-2-[(benzyloxy)carbonyl]-1-[(tert-butoxy)carbonyl]piperidin-3-carboxylic acid
  参考文献：
  名称：

  Nrf2-Keap1复合体直接抑制剂周围的结合模式和结构-活性关系。

  摘要：

  与（1 S，2 R）-2-[（1 S）-1-[（1,3-dioxo-2,3 ）共结晶的类Kelch ECH相关蛋白（Keap1）的X射线晶体结构获得了[二氢-1 H-异吲哚-2-基）甲基] -1,2,3,4-四氢异喹啉-2-羰基]环己烷-1-羧酸（化合物（S，R，S）-1 a） 。这种X射线晶体结构为命中化合物（S，R，S）-1 a的真正结合模式提供了突破性的实验证据，因为发现配体方向不同于初始对接模型，该对接模型可在项目开始时使用。对这种结合模式的晶体学解释有助于更有效和有效地集中和推动药物设计过程。

  DOI：

  10.1002/cmdc.201300525