Diisopropyl-phosphoramidous acid (2R,3S,3aR,9aR)-2-(2,4-dioxo-3,4-dihydro-2H-pyrimidin-1-yl)-5,5,7,7-tetraisopropyl-tetrahydro-1,4,6,8-tetraoxa-5,7-disila-cyclopentacycloocten-3-yl ester methyl ester | 183273-98-5

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机氧化合物
• 英文名称: Diisopropyl-phosphoramidous acid (2R,3S,3aR,9aR)-2-(2,4-dioxo-3,4-dihydro-2H-pyrimidin-1-yl)-5,5,7,7-tetraisopropyl-tetrahydro-1,4,6,8-tetraoxa-5,7-disila-cyclopentacycloocten-3-yl ester methyl ester
• CAS: 183273-98-5
• 化学式: C₂₈H₅₄N₃O₈PSi₂
• 分子量: 647.897
• InChiKey: JZQCUYOLASKOHZ-TXLZZFHBSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  5.77
• 重原子数：
  42.0
• 可旋转键数：
  11.0
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.86
• 拓扑面积：
  113.48
• 氢给体数：
  1.0
• 氢受体数：
  10.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  Diisopropyl-phosphoramidous acid (2R,3S,3aR,9aR)-2-(2,4-dioxo-3,4-dihydro-2H-pyrimidin-1-yl)-5,5,7,7-tetraisopropyl-tetrahydro-1,4,6,8-tetraoxa-5,7-disila-cyclopentacycloocten-3-yl ester methyl ester 在 四氮唑 、 4-二甲氨基吡啶 、 四丁基氟化铵 作用下， 以 四氢呋喃 、 吡啶 、 二氯甲烷 、 乙腈 为溶剂， 反应 7.5h， 生成 5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-arabinouridine-2'-[(O-methyl)-(O-2-(N-methyl)amino phenazine-6-N-hexyl) phosphate]-3'-sodium succinate
  参考文献：
  名称：

  吩嗪连接的阿拉伯糖和木呋喃糖基寡核苷酸偶联物的合成：它们的双链体（DNA-DNA和DNA-RNA）和三链体的热稳定性和荧光性质

  摘要：

  已报告了吩嗪（Pzn）拴系的ara -U和xylo -U寡核苷酸的合成及其作为DNA-DNA，DNA-RNA双链体和三链体的特性。2' - O -Pzn拴系的ara - U酰胺（11）和Pzn联结的酰胺基嵌段（4）以及用2' - O -Pzn拴系的ara - U（10a – 10c）和3功能化的CPG固体载体固相DNA合成中使用' -O -Pzn系木糖-U琥珀酸酯（22a – 22c）制备修饰的9mers 25 – 29、31、41 – 45（用于DNA-DNA和DNA-DRA双链体研究）和18mers 35 – 40、46 – 50（用于DNA三链体研究）。对产生的双链体和三链体的热熔实验表明，除中间修饰的寡核苷酸（31和40）外，所有寡DNA对DNA和RNA靶标（23和52）以及对DNA双链体均具有增强的亲和力目标32·33。PZN -拴系的ARA -U块是在3'末端的寡核苷酸比在双链

  DOI：

  10.1016/s0040-4020(98)00457-8
• 作为产物：
  描述：

  氯(二异丙基氨基)甲氧基膦 、 1-[(6aR,8R,9S,9aS)-9-hydroxy-2,2,4,4-tetraisopropyl-tetrahydro-6H-furo[3,2-f][1,3,5,2,4] trioxadisilocin-8-yl]-3H-pyrimidine-2,4-dione 在 N,N-二异丙基乙胺 作用下， 以 四氢呋喃 为溶剂， 反应 1.0h， 以84%的产率得到Diisopropyl-phosphoramidous acid (2R,3S,3aR,9aR)-2-(2,4-dioxo-3,4-dihydro-2H-pyrimidin-1-yl)-5,5,7,7-tetraisopropyl-tetrahydro-1,4,6,8-tetraoxa-5,7-disila-cyclopentacycloocten-3-yl ester methyl ester
  参考文献：
  名称：

  碳支化精胺束缚寡聚DNA的合成及双链体和三链体的热稳定性

  摘要：

  据报道，新的C-支化精胺衍生物17的首次合成及其稳定DNA双链体和三链体的能力。将C-支化的精胺嵌段17转化为相应的O-（2-氰乙基）-（N，N-二异丙基）亚磷酰胺嵌段18，以掺入DNA的5'端。它还通过磷酸盐桥与ara -U的2'偶联，导致部分受保护的3'-羟基嵌段23，后者被转化为O-（2-氰乙基）-（N，N-二异丙基）亚磷酰胺24或3'-琥珀酸盐嵌段25的合成，导致合成三个模型DNA 14-mers：27 '在5'-末端带有束缚的精胺，28在DNA链的中间带有束缚的精胺，使用标准的自动固相化学和脱保护程序，在2'端用精胺和29精胺。第t米测量结果表明，在用Mg低盐2+的pH范围为5.5内- 7.6，5'-精胺-DNA偶联物27给出了稳定的DNA三链Δ ħ Ť米〜+ 3℃，第Δ ç Ť米S的+ 5.5°至+ 8.5°C和2'-精胺-DNA偶联物29给出了Δ ħ Ť米S的〜+ 5°〜+ 6

  DOI：

  10.1016/0040-4020(96)00731-4