2-[2-oxo-2H-6-(4-methoxyphenoxy)acenaphthylen-1-ylidene]malononitrile | 1265828-97-4

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机氧化合物
• 英文名称: 2-[2-oxo-2H-6-(4-methoxyphenoxy)acenaphthylen-1-ylidene]malononitrile
• 英文别名: 2-[6-(4-Methoxyphenoxy)-2-oxoacenaphthylen-1-ylidene]propanedinitrile；2-[6-(4-methoxyphenoxy)-2-oxoacenaphthylen-1-ylidene]propanedinitrile
• CAS: 1265828-97-4
• 化学式: C₂₂H₁₂N₂O₃
• 分子量: 352.349
• InChiKey: GVKROZXKOSQFDA-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  4
• 重原子数：
  27
• 可旋转键数：
  3
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.05
• 拓扑面积：
  83.1
• 氢给体数：
  0
• 氢受体数：
  5

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  2-[2-oxo-2H-6-(4-methoxyphenoxy)acenaphthylen-1-ylidene]malononitrile 在 potassium carbonate 作用下， 以 乙腈 为溶剂， 反应 2.0h， 以85%的产率得到3-(4-methoxyphenoxy)-8-oxo-8H-acenaphtho[1,2-b]pyrrole-9-carbonitrile
  参考文献：
  名称：

  探讨Mcl-1和Bcl-2蛋白的BH3沟的区别：对双重抑制剂设计的启示

  摘要：

  基于我们先前发现的Mcl-1和Bcl-2双重抑制剂，3- thiomorpholin -8-oxo-8 H -ac [1,2 - b ]吡咯-9-腈（1，S1）和通过对具有Mcl-1和Bcl-2的1个复合物的结构了解，我们通过一系列1的类似物利用了这两种蛋白质的BH3沟的空间方向。这些类似物包含具有各种空间位阻的替代物，旨在探索其宽度和长度。 p2口袋的 结构-活性关系（SARs）研究以及对接研究和基于细胞的测定法证明，Mcl-1的p2口袋比Bcl-2的p2口袋相对更宽和更短。新型双重抑制剂6 基于这些新发现，获得了具有对Mcl-1和Bcl-2的纳米蛋白亲和力，以及针对多种癌细胞的纳米蛋白细胞毒性活性的新的发现。

  DOI：

  10.1016/j.ejmech.2011.05.062
• 作为产物：
  描述：

  5-溴萘乙基-1,2-二酮 在 potassium carbonate 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 、 乙腈 为溶剂， 反应 5.0h， 生成 2-[2-oxo-2H-6-(4-methoxyphenoxy)acenaphthylen-1-ylidene]malononitrile
  参考文献：
  名称：

  3-Thiomorpholin-8-oxo-8 H -ac [1,2 - b ]吡咯-9-甲腈（S1）分子为强势，B细胞淋巴瘤2（Bcl-2）和骨髓细胞白血病序列的双重抑制剂。 1（Mcl-1）：基于结构的设计和结构活动关系研究

  摘要：

  我们最近描述了Bcl-2和Mcl-1的双重抑制剂3- thiomorpholin -8-oxo-8 H -ac [1,2 - b ]吡咯-9-腈（3，S1）的发现。在这里，我们报告结构指导的设计与结构活性关系研究相结合，以利用Bcl-2和Mcl-1在p2结合口袋中的差异，从而从中获得新型的双重抑制剂3-（4-氨基苯硫基）-8-获得了oxo-8 H -ac [1,2 - b ]吡咯-9-腈（6h），显示出对Mcl-1（5 nM）的IC 50值显着提高，Mcl-1 / Bak破坏潜力更大，并且因此，细胞毒性比3增加了10倍。

  DOI：

  10.1021/jm101181u

文献信息

• 3-Thiomorpholin-8-oxo-8<i>H</i>-acenaphtho[1,2-<i>b</i>]pyrrole-9-carbonitrile (S1) Based Molecules as Potent, Dual Inhibitors of B-Cell Lymphoma 2 (Bcl-2) and Myeloid Cell Leukemia Sequence 1 (Mcl-1): Structure-Based Design and Structure−Activity Relationship Studies
  作者：Zhichao Zhang、Guiye Wu、Feibo Xie、Ting Song、Xilong Chang

  DOI：10.1021/jm101181u

  日期：2011.2.24

  discovery of a dual inhibitor of Bcl-2 and Mcl-1, 3-thiomorpholin-8-oxo-8H-acenaphtho[1,2-b]pyrrole-9-carbonitrile (3, S1). Here we report a structure-guided design in combination with structure−activity relationship studies to exploit the difference in the p2 binding pocket of Bcl-2 and Mcl-1, from which a novel dual inhibitor 3-(4-aminophenylthio)-8-oxo-8H-acenaphtho[1,2-b]pyrrole-9-carbonitrile (6h) was

  我们最近描述了Bcl-2和Mcl-1的双重抑制剂3- thiomorpholin -8-oxo-8 H -ac [1,2 - b ]吡咯-9-腈（3，S1）的发现。在这里，我们报告结构指导的设计与结构活性关系研究相结合，以利用Bcl-2和Mcl-1在p2结合口袋中的差异，从而从中获得新型的双重抑制剂3-（4-氨基苯硫基）-8-获得了oxo-8 H -ac [1,2 - b ]吡咯-9-腈（6h），显示出对Mcl-1（5 nM）的IC 50值显着提高，Mcl-1 / Bak破坏潜力更大，并且因此，细胞毒性比3增加了10倍。
• Novel soluble myeloid cell leukemia sequence 1 (Mcl-1) inhibitor (E,E)-2-(benzylaminocarbonyl)-3-styrylacrylonitrile (4g) developed using a fragment-based approach
  作者：Zhichao Zhang、Ting Song、Xiangqian Li、Zhiyong Wu、Yingang Feng、Feibo Xie、Chengwu Liu、Jianquan Qin、Hongbo Chen

  DOI：10.1016/j.ejmech.2012.10.050

  日期：2013.1

  Based on a known nanomolar Bcl-2 homology domain 3 (BH3) mimetic 3-thiomorpholin-8-oxo-8H-acenaphtho[1,2-b] pyrrole-9-carbonitrile (SI, MW: 331), we applied a fragment-based approach to obtain BH3 mimetics with improved affinity and improved solubility in a water ethanol (9:1) cosolvent. After the deconstruction of 1 (S1), we obtained fragment cyanoacetamide (4), which was determined to be a ligand efficiency (LE) hot part. After a rational optimization through fragment evolution beginning with fragment 4, a smaller Mcl-1 inhibitor (E,E)-2-(benzylaminocarbonyl)-3-styrylacrylonitrile (4g, MW: 288) with a 6-fold increase in affinity compared to I was obtained, as predicted by our optimization curve and identified by Mcl-1 protein nuclear magnetic resonance (NMR). (C) 2012 Elsevier Masson SAS. All rights reserved.
• Probing the difference between BH3 groove of Mcl-1 and Bcl-2 protein: Implications for dual inhibitors design
  作者：Zhichao Zhang、Hongna Yang、Guiye Wu、Zhiqiang Li、Ting Song、Xiang qian Li

  DOI：10.1016/j.ejmech.2011.05.062

  日期：2011.9

  Based on our previous discovery of a dual inhibitor of Mcl-1 and Bcl-2, 3-thiomorpholin-8-oxo-8H-acenaphtho[1,2-b]pyrrole-9-carbonitrile (1, S1), and guided by structure insight of 1 complex with Mcl-1 and Bcl-2, we exploited the spatial orientation of BH3 groove of the two proteins by a series of analogues of 1. These analogues contain substitutes with various steric hindrance designed to explore

  基于我们先前发现的Mcl-1和Bcl-2双重抑制剂，3- thiomorpholin -8-oxo-8 H -ac [1,2 - b ]吡咯-9-腈（1，S1）和通过对具有Mcl-1和Bcl-2的1个复合物的结构了解，我们通过一系列1的类似物利用了这两种蛋白质的BH3沟的空间方向。这些类似物包含具有各种空间位阻的替代物，旨在探索其宽度和长度。 p2口袋的 结构-活性关系（SARs）研究以及对接研究和基于细胞的测定法证明，Mcl-1的p2口袋比Bcl-2的p2口袋相对更宽和更短。新型双重抑制剂6 基于这些新发现，获得了具有对Mcl-1和Bcl-2的纳米蛋白亲和力，以及针对多种癌细胞的纳米蛋白细胞毒性活性的新的发现。