2',3',5'-Tri-O-acetyl-6-oxocytidine | 23526-06-9

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 英文名称: 2',3',5'-Tri-O-acetyl-6-oxocytidine
• 英文别名: 6-amino-3-(tri-O-acetyl-β-D-ribofuranosyl)-1H-pyrimidine-2,4-dione；6-Amino-3-(2,3,5-tri-O-acetyl-β-D-ribofuranosyl)-1,2,3,4-tetrahydro-pyrimidindion-(2,4)；[(2R,3R,4R,5R)-3,4-diacetyloxy-5-(6-amino-2,4-dioxo-1H-pyrimidin-3-yl)oxolan-2-yl]methyl acetate
• CAS: 23526-06-9
• 化学式: C₁₅H₁₉N₃O₉
• 分子量: 385.331
• InChiKey: OXSHRYCFLFWADC-ICGCDAGXSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -1.6
• 重原子数：
  27
• 可旋转键数：
  8
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.53
• 拓扑面积：
  164
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  10

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  2',3',5'-Tri-O-acetyl-6-oxocytidine 在 吡啶 、 4-二甲氨基吡啶 、 偶氮二异丁腈 、 氨 、 三正丁基氢锡 作用下， 以 甲醇 、 1,2-二氯乙烷 、 甲苯 、 乙腈 为溶剂， 反应 30.17h， 生成 2'-Deoxy-4-N-(dimethylformamidine)-3',5'-O-(1,1,3,3-tetraisopropyldisiloxane-1,3-diyl)-6-oxocytidine
  参考文献：
  名称：

  pH无关的三螺旋形成，其中6-氧代胞苷为胞苷类似物。

  摘要：

  描述了6-氧代胞嘧啶和5-烯丙基-6-氧代胞嘧啶作为N（3）质子化的胞嘧啶类似物的六个不同的亚磷酰胺构件的合成。这些化合物已通过标准固相合成掺入寡核苷酸中。研究了15-mer Hoogsteen链与目标21-mer双链体的杂交。比较不同构件的三链体形成能力发现：i）5-烯丙基取代对三链体稳定性有负面影响； ii）Hoogsteen链的均一骨架相对于混合主链可稳定三链体；iii）带有6-氧代胞嘧啶核苷或5-烯丙基-6-氧代胞苷的RNA链可能不与DNA靶双链体形成三螺旋，这可能是由于骨架扭转限制所致；（iv）具有三个分离的2'的15-mer DNA序列 在这项研究中，所有的胞苷类似物中，-deoxy-6-oxocytidines具有最高的T（m）。CD实验提供了三重结构存在与否的进一步证据。在这些与温度相关的CD测量过程中，我们能够检测到在选定波长处彼此独立的双链和三链融解。在由于光谱重叠而导

  DOI：

  10.1002/1521-3765(20000703)6:13<2409::aid-chem2409>3.0.co;2-h
• 作为产物：
  描述：

  4-氨基-2,6-二羟基嘧啶 、 利巴韦林杂质9 在 ammonium sulfate 、 六甲基二硅氮烷 、 三氟甲磺酸三甲基硅酯 作用下， 以 1,2-二氯乙烷 为溶剂， 反应 48.0h， 以83%的产率得到2',3',5'-Tri-O-acetyl-6-oxocytidine
  参考文献：
  名称：

  pH无关的三螺旋形成，其中6-氧代胞苷为胞苷类似物。

  摘要：

  描述了6-氧代胞嘧啶和5-烯丙基-6-氧代胞嘧啶作为N（3）质子化的胞嘧啶类似物的六个不同的亚磷酰胺构件的合成。这些化合物已通过标准固相合成掺入寡核苷酸中。研究了15-mer Hoogsteen链与目标21-mer双链体的杂交。比较不同构件的三链体形成能力发现：i）5-烯丙基取代对三链体稳定性有负面影响； ii）Hoogsteen链的均一骨架相对于混合主链可稳定三链体；iii）带有6-氧代胞嘧啶核苷或5-烯丙基-6-氧代胞苷的RNA链可能不与DNA靶双链体形成三螺旋，这可能是由于骨架扭转限制所致；（iv）具有三个分离的2'的15-mer DNA序列 在这项研究中，所有的胞苷类似物中，-deoxy-6-oxocytidines具有最高的T（m）。CD实验提供了三重结构存在与否的进一步证据。在这些与温度相关的CD测量过程中，我们能够检测到在选定波长处彼此独立的双链和三链融解。在由于光谱重叠而导

  DOI：

  10.1002/1521-3765(20000703)6:13<2409::aid-chem2409>3.0.co;2-h

文献信息

• Synthesis of 3-substituted 6-aminouracils
  作者：Christa E. Müller

  DOI：10.1016/0040-4039(91)80214-q

  日期：1991.11

  alkyl- and arylalkyl halogenides and with tetraacetylribofuranose regiospecifically to the corresponding 3-substituted-6-aminouracil derivatives 1–10. The reaction is catalyzed by AlCl3 or, with the exception of the ribose derivative, more effectively by iodine. The described new synthesis offers the first general access to 3-substituted 6-aminouracils.

  三（三甲基甲硅烷）-6-氨基尿嘧啶与各种烷基-和芳基烷基卤化物，并与tetraacetylribofuranose区域专一于反应的相应的3-取代的-6-氨基尿嘧啶衍生物1 - 10。该反应由AlCl 3催化，或除核糖衍生物外，由碘更有效地催化。所述的新合成提供了首次普遍获得3-取代的6-氨基尿嘧啶的途径。