6-(benzyloxy)-9-((2R,4S,5R)-4-((tert-butyldimethylsilyl)oxy)-5-(((tert-butyldimethylsilyl)oxy)methyl)tetrahydrofuran-2-yl)-9H-purine | 1159397-35-9

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘌呤核苷
• 英文名称: 6-(benzyloxy)-9-((2R,4S,5R)-4-((tert-butyldimethylsilyl)oxy)-5-(((tert-butyldimethylsilyl)oxy)methyl)tetrahydrofuran-2-yl)-9H-purine
• CAS: 1159397-35-9
• 化学式: C₂₉H₄₆N₄O₄Si₂
• 分子量: 570.88
• InChiKey: RKNTXFUXZVVREZ-RBZQAINGSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  7.11
• 重原子数：
  39.0
• 可旋转键数：
  9.0
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.62
• 拓扑面积：
  80.52
• 氢给体数：
  0.0
• 氢受体数：
  8.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  6-(benzyloxy)-9-((2R,4S,5R)-4-((tert-butyldimethylsilyl)oxy)-5-(((tert-butyldimethylsilyl)oxy)methyl)tetrahydrofuran-2-yl)-9H-purine 在 氨 、 水 作用下， 生成 9-((2R,4S,5R)-4-((叔丁基二甲基硅烷基)氧基)-5-(((叔丁基二甲基硅烷基)氧基)甲基)四氢呋喃-2-基)-9H-嘌呤-6-胺
  参考文献：
  名称：

  yr甲基脱氧腺苷：通用DNA杂交探针的3'帽

  摘要：

  PAH对碱基配对的影响：与寡核苷酸悬挂的脱氧腺苷残基的N 6位共价连接的多环芳香烃（PAH）（参见方案）可增加靶标亲和力，但会降低碱基配对的选择性。观察到熔点升高到28°C（每个残基14°C），并且与完全匹配的PAH取代基相比，PAH取代基在24个含错配的双链中更稳定了20个。

  DOI：

  10.1002/chem.200801587
• 作为产物：
  描述：

  O⁶-(benzotriazol-1-yl)-3',5'-bis-O-(tert-butyldimethylsilyl)-2'-deoxyinosine 、 苯甲醇 在 1,8-二氮杂双环[5.4.0]十一碳-7-烯 作用下， 以37%的产率得到6-(benzyloxy)-9-((2R,4S,5R)-4-((tert-butyldimethylsilyl)oxy)-5-(((tert-butyldimethylsilyl)oxy)methyl)tetrahydrofuran-2-yl)-9H-purine
  参考文献：
  名称：

  yr甲基脱氧腺苷：通用DNA杂交探针的3'帽

  摘要：

  PAH对碱基配对的影响：与寡核苷酸悬挂的脱氧腺苷残基的N 6位共价连接的多环芳香烃（PAH）（参见方案）可增加靶标亲和力，但会降低碱基配对的选择性。观察到熔点升高到28°C（每个残基14°C），并且与完全匹配的PAH取代基相比，PAH取代基在24个含错配的双链中更稳定了20个。

  DOI：

  10.1002/chem.200801587