(3S)-N-[2-[[2-[2-acetamidoethyl-[(3S)-3-amino-4-phenyl-butanoyl]amino]acetyl]amino]ethyl]-3-amino-N-[2-[2-[[2-[(3-amino-3-oxo-propyl)amino]-2-oxo-ethyl]-[(3S)-3-amino-4-phenyl-butanoyl]amino]ethylamino]-2-oxo-ethyl]-6-guanidino-hexanamide | 1443997-07-6

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 肽模拟物
• 英文名称: (3S)-N-[2-[[2-[2-acetamidoethyl-[(3S)-3-amino-4-phenyl-butanoyl]amino]acetyl]amino]ethyl]-3-amino-N-[2-[2-[[2-[(3-amino-3-oxo-propyl)amino]-2-oxo-ethyl]-[(3S)-3-amino-4-phenyl-butanoyl]amino]ethylamino]-2-oxo-ethyl]-6-guanidino-hexanamide
• 英文别名: (3S)-N-[2-[[2-[2-acetamidoethyl-[(3S)-3-amino-4-phenylbutanoyl]amino]acetyl]amino]ethyl]-3-amino-N-[2-[2-[[2-[(3-amino-3-oxopropyl)amino]-2-oxoethyl]-[(3S)-3-amino-4-phenylbutanoyl]amino]ethylamino]-2-oxoethyl]-6-(diaminomethylideneamino)hexanamide
• CAS: 1443997-07-6
• 化学式: C₄₄H₇₀N₁₄O₈
• 分子量: 923.129
• InChiKey: DJGORLBWICTNJP-KVBYWJEESA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -4.8
• 重原子数：
  66
• 可旋转键数：
  32
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.52
• 拓扑面积：
  363
• 氢给体数：
  10
• 氢受体数：
  12

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  methyl N-(2-(tert-butyloxycarbonyl)aminoethyl)glycinate 在 水 、 O-(1H-benzotriazol-1-yl)-N,N,N',N'-tetramethyluronium hexafluorophosphate 、 N,N-二异丙基乙胺 、 lithium hydroxide 作用下， 以 四氢呋喃 、 N-甲基吡咯烷酮 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 生成 (3S)-N-[2-[[2-[2-acetamidoethyl-[(3S)-3-amino-4-phenyl-butanoyl]amino]acetyl]amino]ethyl]-3-amino-N-[2-[2-[[2-[(3-amino-3-oxo-propyl)amino]-2-oxo-ethyl]-[(3S)-3-amino-4-phenyl-butanoyl]amino]ethylamino]-2-oxo-ethyl]-6-guanidino-hexanamide
  参考文献：
  名称：

  一系列同源 HIV-1 TAR RNA 配体的热力学研究表明，松散结合剂比紧密结合剂更强的 Tat 竞争者

  摘要：

  RNA 是一个主要的药物靶点，但调节 RNA 功能的小分子的设计仍然是一个巨大的挑战。在这种情况下，研究了一系列结构同源的“聚酰胺氨基酸”（PAA）作为 HIV-1 反式激活反应（TAR）RNA 配体。一项广泛的热力学研究揭示了焓-熵补偿现象的发生，导致所有 PAA 的 TAR 亲和力非常接近。然而，根据它们的结构，它们的结合模式和它们与 Tat 片段竞争的能力有很大不同。令人惊讶的是，与 TAR 形成松散复合物的 PAA 比形成紧密复合物的 PAA 更强，热变性研究表明松散复合物比紧密复合物更稳定。这可能与圆二色性实验揭示的松散和紧密配体诱导不同的 RNA 构象变化有关，尽管核磁共振 (NMR) 实验表明 TAR 结合位点在所有情况下都是相同的。最后，一些松散的 PAA 也显示出对 HIV 感染细胞的有希望的抑制活性。总之，这些结果有助于更好地理解 RNA 相互作用模式，这对于设计相关 RNA

  DOI：

  10.1093/nar/gkt237