[(R)-2-(9H-fluoren-9-ylmethoxycarbonylamino)-3-methylbutyrylamino]-acetic acid methyl ester | 916525-92-3

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 英文名称: [(R)-2-(9H-fluoren-9-ylmethoxycarbonylamino)-3-methylbutyrylamino]-acetic acid methyl ester
• 英文别名: methyl 2-[[(2R)-2-(9H-fluoren-9-ylmethoxycarbonylamino)-3-methylbutanoyl]amino]acetate
• CAS: 916525-92-3
• 化学式: C₂₃H₂₆N₂O₅
• 分子量: 410.47
• InChiKey: DGTIJZFYBYMGGQ-OAQYLSRUSA-N

物化性质

• 熔点：
  148-150 °C(Solv: acetonitrile (75-05-8))
• 沸点：
  614.9±40.0 °C(Predicted)
• 密度：
  1.205±0.06 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  3.7
• 重原子数：
  30
• 可旋转键数：
  9
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.35
• 拓扑面积：
  93.7
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  5

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  [(R)-2-(9H-fluoren-9-ylmethoxycarbonylamino)-3-methylbutyrylamino]-acetic acid methyl ester 在 二乙胺 作用下， 以 乙腈 为溶剂， 反应 3.0h， 生成 H-Val-Gly-OMe
  参考文献：
  名称：

  FK228的首个具有生物活性的合成类似物，即脱肽组蛋白组蛋白脱乙酰基酶抑制剂。

  摘要：

  FK228和螺旋藻抑素双环二肽天然产物是已知最有效的组蛋白脱乙酰基酶（HDAC）抑制剂。尽管FK228处于高级临床试验中，但是天然产物的复杂性阻碍了机理研究和结构-活性关系的发现。通过全合成，我们制备了第一种二肽肽类似物。我们的结果证明FK228中的脱氢丁酸残基不是必需的，并且其他残基可以被取代而不会丧失HDAC抑制活性。大环支架的构象限制很重要，因为线性肽是无活性的。只要保护锌结合的硫醇以确保良好的细胞利用率，就可以除去由半胱氨酸侧链形成的分子内二硫键。像天然产品一样

  DOI：

  10.1021/jm0703800
• 作为产物：
  描述：

  甘胺酸甲酯 在 1-羟基苯并三唑 、 盐酸-N-乙基-Nˊ-(3-二甲氨基丙基)碳二亚胺 、 N,N-二异丙基乙胺 作用下， 以 二氯甲烷 为溶剂， 反应 4.25h， 以86%的产率得到[(R)-2-(9H-fluoren-9-ylmethoxycarbonylamino)-3-methylbutyrylamino]-acetic acid methyl ester
  参考文献：
  名称：

  WO2006/129105

  摘要：

  公开号：

文献信息

• FK 228 derivates as HDAC inhibitors
  申请人：Ganesan Arasu

  公开号：US20090131390A1

  公开（公告）日：2009-05-21

  Compounds which are FK228 analogues of the general formula (I) or (I′), isosteres thereof and pharmaceutically acceptable salts thereof are found to inhibit HDAC wherein R 1 , R 2 , R 3 and R 4 are the same or different and represent an amino acid side chain moiety and each R 6 is the same or different and represents hydrogen or C 1 -C 4 alkyl.

  具有一般式(I)或(I′)的FK228类似物、其同分异构体和药学上可接受的盐被发现可以抑制HDAC，其中R1、R2、R3和R4相同或不同，代表氨基酸侧链基团，每个R6相同或不同，代表氢或C1-C4烷基。
• Triisobutylaluminium-Mediated Regioselective Protection of Sterically Hindered Amide NH of Cyclo-(AA-Gly): Key Building Block for Next-Generation Peptide Synthesis
  作者：Isai Ramakrishna、Tomohiro Hattori、Hisashi Yamamoto、Tomomi Ishiguro

  DOI：10.1055/a-2210-0749

  日期：——

  regioselective Boc protection in the more sterically hindered amide NH of unsymmetrical 2,5-diketopiperazines (DKPs) formed from glycine and various amino acids. Our research introduces a novel technique utilizing cost-effective triisobutylaluminium and trimethoxysilane. Notably, trimethoxysilane selectively reacts with the less hindered amide NH, facilitating the regioselective Boc protection of the

  在这项研究中，我们解决了由甘氨酸和各种氨基酸形成的不对称 2,5-二酮哌嗪 (DKP) 的空间位阻更大的酰胺 NH 中的区域选择性 Boc 保护的挑战。我们的研究介绍了一种利用经济高效的三异丁基铝和三甲氧基硅烷的新技术。值得注意的是，三甲氧基硅烷选择性地与受阻较小的酰胺 NH 反应，促进 DKP 中更拥挤的酰胺 NH 的区域选择性 Boc 保护。我们工作的主要目标是开发一种简单且可扩展的方法来合成 Boc 保护的 DKP，重点是解决这些化合物带来的空间挑战。我们成功证明了该方法的可扩展性，能够合成各种单 Fmoc、Cbz、Alloc 和 EtOCO 保护的 DKP。此外，我们通过双重肽延伸过程将其用于五肽的构建，从而扩展了该策略的适用性。我们的研究结果揭示了这种区域选择性 Boc 保护方法的多功能性和效率。总体而言，这项研究为 DKP 中的区域选择性 Boc 保护挑战引入了一种有价值的解决
• FK 228 DERIVATES AS HDAC INHIBITORS
  申请人：UNIVERSITY OF SOUTHAMPTON

  公开号：EP1888097A1

  公开（公告）日：2008-02-20
• US7977304B2
  申请人：——

  公开号：US7977304B2

  公开（公告）日：2011-07-12
• [EN] FK 228 DERIVATES AS HDAC INHIBITORS<br/>[FR] DERIVES DE FK 228 UTILISES EN TANT QU'INHIBITEURS D'HDAC
  申请人：UNIV SOUTHAMPTON

  公开号：WO2006129105A1

  公开（公告）日：2006-12-07

  [EN] Compounds which are FK228 analogues of the general formula (I) or (I^/), isosteres thereof and pharmaceutically acceptable salts thereof are found to inhibit HDAC wherein R₁, R₂, R₃ and R₄ are the same or different and represent an amino acid side chain moiety and each R₆ is the same or different and represents hydrogen or C₁-C₄ alkyl.
  [FR] L'invention concerne des composés qui sont des analogues de FK228 représentés par la formule générale (I) ou (I^/), des isostères de ces derniers et des sels pharmaceutiquement acceptables de ces derniers qui se sont avérés inhiber l'HDAC. Dans ladite formule, R₁, R₂, R₃ et R₄ sont identiques ou différents et représentent un fragment de chaîne latérale d'un acide aminé et chaque R₆ est identique ou différent et représente hydrogène ou alkyle C₁-C₄.