FK506和
雷帕霉素是具有独特作用方式的
免疫抑制药物。在与它们的蛋白质靶标结合之前,这些药物与内源性伴侣FK506结合蛋白12(FK
BP12)形成复合物。所得的复合FK506-FKBP和
雷帕霉素-FKBP结合表面分别以高亲和力和特异性识别
钙调神经
磷酸酶和mTOR的相对平坦的靶表面。为了测试这种作用方式是否可以普遍用于抑制其他蛋白质靶标,特别是那些难以被常规小分子抑制的蛋白质靶标,我们开发了一种平行合成方法来生成具有200个成员的双功能环状肽库,如FK506和
雷帕霉素类似物,被称为“ rapalogs”。每个rapalog由共同的FKBP结合部分和可变的效应子结构域组成。通过荧光偏振竞争测定法测试了rapalog与FK
BP12的结合。我们的结果表明,FK
BP12以高亲和力与大多数rapalog结合(K I值在纳摩尔到低微摩尔范围内),创建了一个大的复合表面库,可潜在地识别大分子靶标,例如蛋白质。