dimethyl 2-(3-(1-methyl-1H-imidazol-2-yl)-3-oxo-1-phenylpropyl)malonate | 1007843-83-5

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 唑类
• 英文名称: dimethyl 2-(3-(1-methyl-1H-imidazol-2-yl)-3-oxo-1-phenylpropyl)malonate
• 英文别名: (R)-dimethyl 2-(3-(1-methyl-1H-imidazol-2-yl)-3-oxo-1-phenylpropyl)malonate；2-[3-(1-methyl-1H-imidazol-2-yl)-3-oxo-1-phenyl-propyl]-malonic acid dimethyl ester；dimethyl 2-[(1R)-3-(1-methylimidazol-2-yl)-3-oxo-1-phenylpropyl]propanedioate
• CAS: 1007843-83-5
• 化学式: C₁₈H₂₀N₂O₅
• 分子量: 344.367
• InChiKey: VXFQUUDYAJMNGR-ZDUSSCGKSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  1.7
• 重原子数：
  25
• 可旋转键数：
  9
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.33
• 拓扑面积：
  87.5
• 氢给体数：
  0
• 氢受体数：
  6

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  苯甲醛 在 potassium chloride 、 AGGGTLTGGGTTAGGGTLLGGG G-quadruplexe (L=(R)-1-O-(2-(1H-imidazol-1-yl)ethoxy)glycerol nucleic acid) 、 copper(II) sulfate 、 sodium hydroxide 作用下， 以 水 、 二甲基亚砜 为溶剂， 反应 80.0h， 生成 dimethyl 2-(3-(1-methyl-1H-imidazol-2-yl)-3-oxo-1-phenylpropyl)malonate
  参考文献：
  名称：

  G-Quadruplex MetalloDNAzyme 的模块化设计，用于催化 C-C 键形成，具有可切换的对映选择性

  摘要：

  具有催化功能的金属结合 DNA 结构越来越受到关注。尽管据报道许多金属DNA酶是高效的，但其催化金属中心的确切配位/位置通常是未知的。在这里，我们提出了一种合理开发用于路易斯酸催化反应（例如对映选择性迈克尔加成）的金属脱氧核糖核酸酶的新方法。我们的策略依赖于单分子 DNA G-四链体的可预测折叠模式，并结合金属介导的碱基配对概念。过渡金属配位环境是在 G-四链环区域中创建的，可通过基板进入。因此，受蛋白质启发的咪唑配体L通过固相合成共价结合到一系列富含 G 的 DNA 链中。DNA 序列设计和催化分析的迭代轮次使我们能够选择定制的金属 DNA 酶，提供高转化率和出色的对映选择性 (≥99%)。基于它们的初级序列、折叠模式和金属配位模式，可以提取有关结构-活性关系的有价值的信息。序列中配体L的数量和位置的变化使我们能够分别控制 ( S ) 和 ( R ) 对映体反应产物的形成。

  DOI：

  10.1021/jacs.0c13251

文献信息

• Catalysis of Michael Additions by Covalently Modified G-Quadruplex DNA
  作者：Surjendu Dey、Carmen L. Rühl、Andres Jäschke

  DOI：10.1002/chem.201700632

  日期：2017.9.7

  catalysis utilizing G‐quadruplex DNA‐based artificial metalloenzymes has emerged as a new approach in the field of aqueous‐phase homogeneous catalysis. Recently, a catalytic asymmetric Michael addition employing a covalently modified G‐quadruplex in combination with CuII ions has been reported. Here we assess, by systematic chemical variation and using various spectrometric techniques, a variety of parameters

  利用基于G-四链体DNA的人工金属酶的对映选择性催化已经成为水相均相催化领域中的一种新方法。最近，催化不对称迈克尔加成使用共价修饰的G-四链体与Cu II结合离子已被报道。在这里，我们通过系统的化学变化并使用各种光谱技术来评估控制反应速率加速和立体选择性的各种参数，例如修饰的位置，四链体的拓扑结构，配体的性质，配体与DNA之间的连接子，一价离子的化学特性和过渡金属络合物。与在位置12（dU12）衍生的DNA链相比，在10位（dU10）上用己炔基连接的bpy配体修饰的DNA四链体显示出两倍的初始反应速率。立体选择性对接头长度的依赖性截然不同，以及它们不同的光谱特性表明，dU10衍生化和dU12修饰的四链体之间催化中心的结构存在很大差异。在添加铜时II，两种类型的bpy衍生DNA链均形成了定义为1：1的Cu-DNA复合物，足以用于质谱分析，而未衍生化的DNA链则显示出弱的和非特异性的结合，并与
• Modular quadruplex–duplex hybrids as biomolecular scaffolds for asymmetric Michael addition reactions
  作者：Ji Hye Yum、Hiroshi Sugiyama、Soyoung Park

  DOI：10.1039/d0ob01362e

  日期：——

  conformation, thermal stability, and metal-binding ability of modified QD hybrid DNA were characterized using spectroscopy. The QD hybrid-based DNA catalysts were successfully applied to asymmetric Michael addition reactions (86% conversion and 76% ee). This study describes a new type of DNA hybrid catalyst produced by the construction of a cooperative active site with a Lewis acid and a H-bond donor.

  由于 DNA 具有多种三级结构、化学稳定性和易于处理等优点，基于 DNA 支架的不对称合成已被积极利用。由于基于双链 DNA 的杂化催化剂已经证明了这种卓越的能力，因此人们努力研究新的生物分子支架。在此，我们报告了含有联吡啶配体和氢供体部分的模块化四链体-双链体 (QD) 杂化 DNA 催化剂。使用光谱学表征了修饰的 QD 杂合 DNA 的构象、热稳定性和金属结合能力。基于 QD 杂化的 DNA 催化剂成功地应用于不对称迈克尔加成反应（86% 转化率和 76% ee）。
• Enantioselective Artificial Metalloenzymes Based on a Bovine Pancreatic Polypeptide Scaffold
  作者：David Coquière、Jeffrey Bos、Joris Beld、Gerard Roelfes

  DOI：10.1002/anie.200901134

  日期：2009.6.29

  Site creation: Enantioselective artificial metalloenzymes have been created by grafting a new active site onto bovine pancreatic polypeptide through the introduction of an amino acid capable of coordinating a copper(II) ion. This hybrid catalyst gave good enantioselectivities in the Diels–Alder and Michael addition reactions in water (see scheme) and displayed a very high substrate selectivity.

  产生位点：通过引入能够配位铜（II）离子的氨基酸，将新的活性位点嫁接到牛胰腺多肽上，从而产生了对映选择性的人工金属酶。这种杂化催化剂在水中的Diels–Alder和Michael加成反应中具有良好的对映选择性（参见方案），并显示出很高的底物选择性。
• An ATP–Cu(<scp>ii</scp>) catalyst efficiently catalyzes enantioselective Michael reactions in water
  作者：Xingchen Dong、Zijian Yuan、Yao Qu、Yuxin Gao、Xue Pei、Qianqian Qi、Yujuan Pei、Jiaqi Li、Yashao Chen、Changhao Wang

  DOI：10.1039/d1gc03259c

  日期：——

  achieve enantioselective reactions in aqueous media. Enantioselective Michael reactions are one of the most important carbon–carbon bond formation reactions in organic synthesis, yet their aqueous-phase catalysis remains challenging. Herein, a single nucleotide-based catalyst (ATP·Cu2+) has been constructed using ATP and Cu2+ ions and catalyzes Michael reactions in aqueous media with high reactivities

  生物杂化催化剂已成为在水性介质中实现对映选择性反应的有前途的方法。对映选择性迈克尔反应是有机合成中最重要的碳-碳键形成反应之一，但它们的水相催化仍然具有挑战性。在此，使用ATP 和Cu 2+离子构建了一种基于单核苷酸的催化剂(ATP·Cu 2+ )，并在水性介质中催化迈克尔反应，具有高反应性和良好的对映选择性，可达83% ee。ATP·Cu 2+的对映选择性催化性能源于ATP与Cu 2+离子之间的特异性结合，表现出pH依赖性和温度依赖性行为。ATP·Cu 2+ 已被证明可成功应用于广泛的烯酮底物和碳亲核试剂。
• Enantioselective CuII-Catalyzed Diels-Alder and Michael Addition Reactions in Water Using Bio-Inspired Triazacyclophane-Based Ligands
  作者：H. Bauke Albada、Fiora Rosati、David Coquière、Gerard Roelfes、Rob M. J. Liskamp

  DOI：10.1002/ejoc.201001522

  日期：2011.3

  triazacyclophane (TAC) scaffold decorated with three histidine amino acid residues was used as a tridentate ligand in asymmetric copper(II)-catalysed Diels–Alder and Michael addition reactions in water. Enantiomeric excesses up to 55 % were obtained in Diels–Alder reactions using ligands in which the histidine residues were directly attached to the TAC scaffold. Additional amino acid residues on the N-termini

  用三个组氨酸残基修饰的三氮杂环芳 (TAC) 支架用作不对称铜 (II) 催化的水中狄尔斯-阿尔德和迈克尔加成反应中的三齿配体。使用组氨酸残基直接连接到 TAC 支架上的配体在 Diels-Alder 反应中获得了高达 55% 的对映体过量。在组氨酸残基的 N 端或位于组氨酸残基和 TAC 支架之间的额外氨基酸残基导致对映选择性几乎完全丧失。对最特异性配体的配位复合物的建模研究表明，在催化活性中心附近存在底物结合袋。