7-(N^α-benzyloxycarbonyl-N^ε-t-butoxycarbonyl-L-lysyl)amino-4-methylcoumarin | 236414-37-2

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 英文名称: 7-(N^α-benzyloxycarbonyl-N^ε-t-butoxycarbonyl-L-lysyl)amino-4-methylcoumarin
• 英文别名: benzyl N-(5-{[(tert-butoxy)carbonyl]amino}-1-[(4-methyl-2-oxo-2H-chromen-7-yl)carbamoyl]pentyl)carbamate；benzyl tert-butyl(6-((4-methyl-2-oxo-2H-chromen-7-yl)-amino)-6-oxohexane-1,5-diyl) (S)-dicarbamate；benzyl N-[(2S)-1-[(4-methyl-2-oxochromen-7-yl)amino]-6-[(2-methylpropan-2-yl)oxycarbonylamino]-1-oxohexan-2-yl]carbamate
• CAS: 236414-37-2
• 化学式: C₂₉H₃₅N₃O₇
• 分子量: 537.613
• InChiKey: XWISPLALORKAFY-QHCPKHFHSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  5.03
• 重原子数：
  39.0
• 可旋转键数：
  10.0
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.38
• 拓扑面积：
  135.97
• 氢给体数：
  3.0
• 氢受体数：
  7.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  7-(N^α-benzyloxycarbonyl-N^ε-t-butoxycarbonyl-L-lysyl)amino-4-methylcoumarin 在 三氟乙酸 作用下， 以 二氯甲烷 为溶剂， 反应 3.0h， 以71%的产率得到benzyl N-{5-amino-1-[(4-methyl-2-oxo-2H-chromen-7-yl)carbamoyl]pentyl}carbamate
  参考文献：
  名称：

  sirtuins与荧光小分子底物之间的相互作用为抑制剂设计提供了见识†

  摘要：

  Sirtuins是依赖烟酰胺腺嘌呤二核苷酸（NAD +）的赖氨酸脱酰基酶，可调节代谢和应激反应，并参与人类病变，如神经退行性变。在这项研究中，合成了四个荧光小分子底物，即乙酰基-（AcBKA），巴豆酰基-（CrBKA），丁二酰基-（SuBKA）和肉豆蔻酰基-（MyBKA）包含的底物，并针对三种代表性的sirtuin同工型进行了测试。 （即，SIRT2，SIRT5和SIRT6）。酶动力学结果表明，与肽底物相比，荧光小分子底物具有类似的沉默调节蛋白同工型。ITC分析表明，AcBKA或MyBKA与SIRT2的结合主要是由熵驱动的，而SuBKA与SIRT5的结合是由焓驱动的。SIRT5：SuBKA复杂的晶体结构揭示了一种新的底物结合模式，该模式不同于肽底物结合模式，但涉及Loop S上的Tyr102，Arg105和其他催化重要残基。这表明SuBKA可能是通过SIRT5脱琥珀酰化的，可能是通过提出了

  DOI：

  10.1039/c7ra05824a
• 作为产物：
  描述：

  7-氨基-4-甲基香豆素 在 哌啶 、 吡啶 、 sodium carbonate 、 三氯氧磷 作用下， 以 四氢呋喃 、 1,4-二氧六环 、 水 、 乙腈 为溶剂， 反应 31.0h， 生成 7-(N^α-benzyloxycarbonyl-N^ε-t-butoxycarbonyl-L-lysyl)amino-4-methylcoumarin
  参考文献：
  名称：

  sirtuins与荧光小分子底物之间的相互作用为抑制剂设计提供了见识†

  摘要：

  Sirtuins是依赖烟酰胺腺嘌呤二核苷酸（NAD +）的赖氨酸脱酰基酶，可调节代谢和应激反应，并参与人类病变，如神经退行性变。在这项研究中，合成了四个荧光小分子底物，即乙酰基-（AcBKA），巴豆酰基-（CrBKA），丁二酰基-（SuBKA）和肉豆蔻酰基-（MyBKA）包含的底物，并针对三种代表性的sirtuin同工型进行了测试。 （即，SIRT2，SIRT5和SIRT6）。酶动力学结果表明，与肽底物相比，荧光小分子底物具有类似的沉默调节蛋白同工型。ITC分析表明，AcBKA或MyBKA与SIRT2的结合主要是由熵驱动的，而SuBKA与SIRT5的结合是由焓驱动的。SIRT5：SuBKA复杂的晶体结构揭示了一种新的底物结合模式，该模式不同于肽底物结合模式，但涉及Loop S上的Tyr102，Arg105和其他催化重要残基。这表明SuBKA可能是通过SIRT5脱琥珀酰化的，可能是通过提出了

  DOI：

  10.1039/c7ra05824a

文献信息

• Development of Peptide-Based Sirtuin Defatty-Acylase Inhibitors Identified by the Fluorescence Probe, SFP3, That Can Efficiently Measure Defatty-Acylase Activity of Sirtuin
  作者：Mitsuyasu Kawaguchi、Naoya Ieda、Hidehiko Nakagawa

  DOI：10.1021/acs.jmedchem.9b00315

  日期：2019.6.13

  Sirtuins (SIRTs) are a family of nicotinamide adenine dinucleotide-dependent histone deacetylases that serve as epigenetic regulators of many physiological processes. Recent studies have shown that in addition to their well-known deacetylase activity, sirtuins also exhibit deacylase activity, such as demyristoylase activity. Here, we show that our previously reported sirtuin fluorescence probe, SFP3

  Sirtuins（SIRT）是烟酰胺腺嘌呤二核苷酸依赖性组蛋白脱乙酰基酶的一个家族，可作为许多生理过程的表观遗传调节剂。最近的研究表明，除了其众所周知的脱乙酰基酶活性外，沉默调节蛋白还表现出脱酰基酶活性，例如脱肉豆蔻酰化酶活性。在这里，我们显示了我们先前报道的沉默调节蛋白荧光探针SFP3，可以测量SIRT1-3的脂肪酰基转移酶活性，从而能够选择性检测脂肪酰基转移酶活性。我们进一步利用这一发现来开发SIRT2脂肪酸酶活性的首批抑制剂。值得注意的是，大多数先前报道的sirtuin抑制剂，包括化合物TM，AGK2和SirSir2，几乎没有显示SIRT2脱脂酰基转移酶抑制活性，但基本上是特异性的脱乙酰基酶抑制剂。
• Slow-binding inhibition of peptide deformylase by cyclic peptidomimetics as revealed by a new spectrophotometric assay
  作者：Kiet T. Nguyen、Xubo Hu、Dehua Pei

  DOI：10.1016/j.bioorg.2004.01.001

  日期：2004.6

  UV-Vis spectrophotometer or a fluorimeter in a continuous fashion. The utility of the assay was demonstrated by determining the catalytic activity of PDF and the inhibition constants of PDF inhibitors. These studies revealed the slow-binding behavior of a previously reported macrocyclic PDF inhibitor. This method offers several advantages over the existing PDF assays and should be particularly useful

  通过将PDF反应与二肽基肽酶I（DPPI）偶联并使用N-甲酰基-Met-Lys-AMC作为底物，开发了一种新的分光光度法/荧光法测定肽去甲酰基酶（PDF）。通过PDF去除N-末端甲酰基使二肽成为DPPI的有效底物，其随后去除二肽基单元以释放7-氨基-4-甲基香豆素作为生色团/荧光团。PDF反应可在UV-Vis分光光度计或荧光计上以连续方式方便地进行监控。通过测定PDF的催化活性和PDF抑制剂的抑制常数证明了该测定法的实用性。这些研究揭示了以前报道的大环PDF抑制剂的慢结合行为。
• Inhibitors of the NAD⁺-Dependent Protein Desuccinylase and Demalonylase Sirt5
  作者：Benjamin Maurer、Tobias Rumpf、Michael Scharfe、Diana A. Stolfa、Martin L. Schmitt、Wenjuan He、Eric Verdin、Wolfgang Sippl、Manfred Jung

  DOI：10.1021/ml3002709

  日期：2012.12.13

  NAD(+)-dependent histone deacetylases (sirtuins) play important roles in epigenetic regulation but also through nonhistone substrates for other key cellular events and have been linked to the pathogenesis of cancer, neuro-degeneration, and metabolic diseases. The subtype Sirt5 has been shown recently to act as a desuccinylating and demalonylating enzyme. We have established an assay for biochemical testing of Sirt5 using a small labeled succinylated lysine derivative. We present a comparative study on the profiling of several established sirtuin inhibitors on Sirt1-3 as well as Sirt5 and also present initial results on a screening for new compounds that block Sirt5. Thiobarbiturates were identified as new Sirt5 inhibitors in the low micromolar range, which are selective over Sirt3 that can be found in the same cell compartment as Sirt5.