NH2(CH2)6-O-p-5'-d(CCCTTCCT)-3', p = phosphodiester | 1335130-34-1

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 核苷和核苷酸类似物
• 英文名称: NH2(CH2)6-O-p-5'-d(CCCTTCCT)-3', p = phosphodiester
• CAS: 1335130-34-1
• 化学式: C₈₁H₁₁₄N₂₂O₅₂P₈
• 分子量: 2475.7
• InChiKey: MOGWQDHADNHHBZ-VQPLUFHZSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -2.41
• 重原子数：
  163.0
• 可旋转键数：
  53.0
• 环数：
  16.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.6
• 拓扑面积：
  1035.3
• 氢给体数：
  18.0
• 氢受体数：
  63.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  NH2(CH2)6-O-p-5'-d(CCCTTCCT)-3', p = phosphodiester 在 1H-咪唑-1-磺酰叠氮盐酸盐 、 碳酸氢钠 、 copper(II) sulfate 作用下， 以 甲醇 、 水 为溶剂， 反应 2.0h， 生成 N3(CH2)6-O-p-5'-d(CCCTTCCT)-3', p = phosphodiester
  参考文献：
  名称：

  通过重氮转移反应将叠氮基部分多功能引入寡核苷酸

  摘要：

  使用重氮转移（DZT）试剂可以在温和条件下将胺化的寡脱氧核糖核苷酸（ODN）干净有效地转化为其叠氮基对应物。可以以这种方式修饰在3'，5'或任何内部位置带有氨基链的ODN，从而证明该反应的多功能性。对于共轭，尤其是通过铜催化的1,3-偶极环加成反应（CuAAC反应），易于获得此类叠氮基修饰的ODN引起了极大的兴趣。

  DOI：

  10.1021/ol202397e
• 作为产物：
  描述：

  5'-O-DMTr-thymidine-succinyl linker 、 5’-(4,4’-二甲氧基三苯基)-3’-脱氧胸苷 2’-(2-氰乙基-N,N-二异丙基)亚磷酰胺 、 5’-O-(4,4’-二甲氧基三苯基)-N4-苯甲酰基-2’-脱氧胞苷-3’-(2-氰乙基-N,N-二异丙基)亚磷酰胺 、 2-cyanoethyl 6-<(4-monomethoxytrityl)amino>hexyl N,N-diisopropylphosphoramidite 在 三氯乙酸 、 4,5-二氰基咪唑 作用下， 以 二氯甲烷 、 乙腈 为溶剂， 生成 NH2(CH2)6-O-p-5'-d(CCCTTCCT)-3', p = phosphodiester
  参考文献：
  名称：

  通过重氮转移反应将叠氮基部分多功能引入寡核苷酸

  摘要：

  使用重氮转移（DZT）试剂可以在温和条件下将胺化的寡脱氧核糖核苷酸（ODN）干净有效地转化为其叠氮基对应物。可以以这种方式修饰在3'，5'或任何内部位置带有氨基链的ODN，从而证明该反应的多功能性。对于共轭，尤其是通过铜催化的1,3-偶极环加成反应（CuAAC反应），易于获得此类叠氮基修饰的ODN引起了极大的兴趣。

  DOI：

  10.1021/ol202397e