tert-butyl (2R,4S)-2-(((tertbutyldimethylsilyl)oxy)methyl)-4-hydroxypyrrolidine-1-carboxylate | 1056969-73-3

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 吡咯烷类
• 英文名称: tert-butyl (2R,4S)-2-(((tertbutyldimethylsilyl)oxy)methyl)-4-hydroxypyrrolidine-1-carboxylate
• 英文别名: (2R,4S)-tert-butyl 2-(((tert-butyldimethylsilyl)oxy)methyl)-4-hydroxypyrrolidine-1-carboxylate；[2R,4S]-1-N-tert-butyloxycarbonyl-2-(tert-butyldimethylsilyloxy)methyl-4-hydroxypyrrolidine；(2R, 4S)-1-Boc-2-(tert-butyldimethylsilyloxymethyl)-4-hydroxypyrrolidine；(2R,4S)-2-(tert-butyldimethylsilanyloxymethyl)-4-hydroxy-pyrrolidine-1-carboxylic acid tert-butyl ester；Tert-butyl (2R,4S)-2-(((tert-butyldimethylsilyl)oxy)methyl)-4-hydroxypyrrolidine-1-carboxylate；tert-butyl (2R,4S)-2-[[tert-butyl(dimethyl)silyl]oxymethyl]-4-hydroxypyrrolidine-1-carboxylate
• CAS: 1056969-73-3
• 化学式: C₁₆H₃₃NO₄Si
• 分子量: 331.528
• InChiKey: TWNQXBYPAUOYPX-OLZOCXBDSA-N

物化性质

• 沸点：
  374.2±27.0 °C(Predicted)
• 密度：
  1.016±0.06 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  3.38
• 重原子数：
  22
• 可旋转键数：
  6
• 环数：
  1.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.94
• 拓扑面积：
  59
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  4

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  tert-butyl (2R,4S)-2-(((tertbutyldimethylsilyl)oxy)methyl)-4-hydroxypyrrolidine-1-carboxylate 在 四丁基氟化铵 、 四丁基硫酸氢铵 、 sodium hydroxide 作用下， 以 四氢呋喃 、 水 、 苯 为溶剂， 生成 (2R,4S)-4-tert-butoxycarbonylmethoxy-2-hydroxymethyl-4-hydroxy-pyrrolidine-1-carboxylic acid tert-butyl ester
  参考文献：
  名称：

  骨架中具有环状结构的四种肽核酸单体的设计和立体选择性合成

  摘要：

  肽核酸（PNA）单体的四个异构体衍生自（2 S，4 R）-4-羟基脯氨酸; 它们在吡咯烷环的C 2和C 4位置具有不同的立体化学。通过组合在吡咯烷环中C 2和C 4位置上的转化，实现了与四个不同立体化学相对应的这些不同的主链构象。将获得的主链骨架与N-苯甲酰基胸腺嘧啶反应，得到相应的PNA单体。所得单体的光谱比较证实了其​​立体化学。J.杂环化​​学。（2011）。

  DOI：

  10.1002/jhet.627
• 作为产物：
  描述：

  N-(tert-butoxycarbonyl)-trans-4-formyloxy-D-proline ethyl ester 在 咪唑 、 锂硼氢 作用下， 以 四氢呋喃 、 二氯甲烷 为溶剂， 生成 tert-butyl (2R,4S)-2-(((tertbutyldimethylsilyl)oxy)methyl)-4-hydroxypyrrolidine-1-carboxylate
  参考文献：
  名称：

  骨架中具有环状结构的四种肽核酸单体的设计和立体选择性合成

  摘要：

  肽核酸（PNA）单体的四个异构体衍生自（2 S，4 R）-4-羟基脯氨酸; 它们在吡咯烷环的C 2和C 4位置具有不同的立体化学。通过组合在吡咯烷环中C 2和C 4位置上的转化，实现了与四个不同立体化学相对应的这些不同的主链构象。将获得的主链骨架与N-苯甲酰基胸腺嘧啶反应，得到相应的PNA单体。所得单体的光谱比较证实了其​​立体化学。J.杂环化​​学。（2011）。

  DOI：

  10.1002/jhet.627

文献信息

• Design, Synthesis, and Antileukemic Activity of Stereochemically Defined Constrained Analogues of FTY720 (Gilenya)
  作者：Rebecca Fransson、Alison N. McCracken、Bin Chen、Ryan J. McMonigle、Aimee L. Edinger、Stephen Hanessian

  DOI：10.1021/ml4002425

  日期：2013.10.10

  sphingosine-1-phosphate receptors. At doses well above those needed for immunosuppression, FTY720 also has antineoplastic actions. Our published work suggests that at least some of FTY720’s anticancer activity is independent of its effects on S1P receptors and due instead to its ability to induce nutrient transporter down-regulation. Compounds that trigger nutrient transporter loss but lack FTY720’s S1P

  FTY720 由于其对 1-磷酸鞘氨醇受体的影响而起到免疫抑制剂的作用。在远高于免疫抑制所需的剂量下，FTY720 还具有抗肿瘤作用。我们已发表的工作表明，至少 FTY720 的某些抗癌活性与其对 S1P 受体的影响无关，而是由于其诱导营养转运蛋白下调的能力。引发营养转运蛋白损失但缺乏 FTY720 的 S1P 受体相关、剂量限制性毒性的化合物有可能成为有效和选择性的抗肿瘤剂。在这项研究中，一系列对映异构纯和立体化学多样化的O生成吡咯烷的-取代苄基醚并测试其杀死人类白血病细胞的能力。发现羟甲基的​​立体化学是化合物活性的关键决定因素。此外，抗白血病活性不需要该基团的磷酸化。
• Discovery of Pyrazolo[1,5-<i>a</i>]pyrimidine B-Cell Lymphoma 6 (BCL6) Binders and Optimization to High Affinity Macrocyclic Inhibitors
  作者：William McCoull、Roman D. Abrams、Erica Anderson、Kevin Blades、Peter Barton、Matthew Box、Jonathan Burgess、Kate Byth、Qing Cao、Claudio Chuaqui、Rodrigo J. Carbajo、Tony Cheung、Erin Code、Andrew D. Ferguson、Shaun Fillery、Nathan O. Fuller、Eric Gangl、Ning Gao、Matthew Grist、David Hargreaves、Martin R. Howard、Jun Hu、Paul D. Kemmitt、Jennifer E. Nelson、Nichole O’Connell、D. Bryan Prince、Piotr Raubo、Philip B. Rawlins、Graeme R. Robb、Junjie Shi、Michael J. Waring、David Whittaker、Marta Wylot、Xiahui Zhu

  DOI：10.1021/acs.jmedchem.7b00359

  日期：2017.5.25

  identified a pyrazolo[1,5-a]pyrimidine series of BCL6 binders from a fragment screen in parallel with a virtual screen. Using structure-based drug design, binding affinity was increased 100000-fold. This involved displacing crystallographic water, forming new ligand–protein interactions and a macrocyclization to favor the bioactive conformation of the ligands. Optimization for slow off-rate constant kinetics

  抑制B细胞淋巴瘤6（BCL6）和共抑制因子之间的蛋白相互作用是在弥漫性大B细胞淋巴瘤（DLBCL）癌症中的治疗目标，有效和选择性BCL6抑制剂的概况分析对于检验该假设至关重要。我们鉴定了吡唑并[1,5- a片段筛选中的] pyrimidine系列BCL6结合物与虚拟筛选平行。使用基于结构的药物设计，结合亲和力增加了100000倍。这包括置换结晶水，形成新的配体-蛋白质相互作用和大环化，以促进配体的生物活性构象。进行了慢速离解速率恒定动力学的优化，并提高了对脱靶激酶CK2的选择性。进一步优化了细胞BCL6分析的效价，以提供高度选择性的探针分子。在许多DLBCL细胞系和多发性骨髓瘤细胞系中仅观察到微弱的抗增殖作用，而与BCL6的效力没有明显的关系。结果，我们得出结论，DLBCL癌症中的BCL6假设仍未得到证实。
• Development of Prolinol Containing Inhibitors of Hypoxanthine–Guanine–Xanthine Phosphoribosyltransferase: Rational Structure-Based Drug Design
  作者：Dianne T. Keough、Magdalena Petrová、Gordon King、Michal Kratochvíl、Radek Pohl、Eva Doleželová、Alena Zíková、Luke W. Guddat、Dominik Rejman

  DOI：10.1021/acs.jmedchem.4c00021

  日期：2024.5.9

  in cell growth. Therefore, inhibitors of this enzyme have potential to control infections, caused by Plasmodium falciparum and Plasmodium vivax, Trypanosoma brucei, Mycobacterium tuberculosis, and Helicobacter pylori. Five compounds synthesized here that contain a purine base covalently linked by a prolinol group to one or two phosphonate groups have Ki values ranging from 3 nM to >10 μM, depending

  抑制次黄嘌呤-鸟嘌呤-黄嘌呤磷酸核糖转移酶活性会减少 DNA 和 RNA 合成所需的 6-氧代和 6-氨基嘌呤核苷单磷酸池，从而导致细胞生长减少。因此，这种酶的抑制剂有可能控制由恶性疟原虫和间日疟原虫、布氏锥虫、结核分枝杆菌和幽门螺杆菌引起的感染。这里合成的五种化合物含有通过脯氨醇基团与一个或两个膦酸酯基团共价连接的嘌呤碱基，其K i值范围为 3 nM 至 > 10 μM，具体取决于抑制剂的结构和酶的生物起源。 X射线晶体结构表明，在结合时，这些含脯氨醇的抑制剂刺激了酶中活性位点环的运动。针对细胞培养中的TBr ，前药的 EC 50为 10 μM。因此，这些化合物是进一步开发的优秀候选物，作为对抗传染病的先导药物以及潜在的抗癌剂。
• Effects of stereochemistry, saturation, and hydrocarbon chain length on the ability of synthetic constrained azacyclic sphingolipids to trigger nutrient transporter down-regulation, vacuolation, and cell death
  作者：Michael S. Perryman、Jérémie Tessier、Timothy Wiher、Heather O’Donoghue、Alison N. McCracken、Seong M. Kim、Dean G. Nguyen、Grigor S. Simitian、Matheus Viana、Susanne Rafelski、Aimee L. Edinger、Stephen Hanessian

  DOI：10.1016/j.bmc.2016.07.038

  日期：2016.9

  Constrained analogs containing a 2-hydroxymethylpyrrolidine core of the natural sphingolipids sphingosine, sphinganine, N, N-dimethylsphingosine and N-acetyl variants of sphingosine and sphinganine (C-2-ceramide and dihydro-C-2-ceramide) were synthesized and evaluated for their ability to down-regulate nutrient transporter proteins and trigger cytoplasmic vacuolation in mammalian cells. In cancer cells, the disruptions in intracellular trafficking produced by these sphingolipids lead to cancer cell death by starvation. Structure activity studies were conducted by varying the length of the hydrocarbon chain, the degree of unsaturation and the presence or absence of an aryl moiety on the appended chains, and stereochemistry at two stereogenic centers. In general, cytotoxicity was positively correlated with nutrient transporter down-regulation and vacuolation. This study was intended to identify structural and functional features in lead compounds that best contribute to potency, and to develop chemical biology tools that could be used to isolate the different protein targets responsible for nutrient transporter loss and cytoplasmic vacuolation. A molecule that produces maximal vacuolation and transporter loss is expected to have the maximal anti-cancer activity and would be a lead compound. (C) 2016 Elsevier Ltd. All rights reserved.