and its cofactor pyridoxal 5-phosphate (PLP) and functions by competing with the ODC substrate ornithine for binding to the catalytic site. We have revisited the mechanism of APA binding and ODC inhibition through a new crystal structure of APA-bound ODC, which we solved at 2.49 Å resolution. The structure unambiguously shows the presence of a covalent oxime between APA and PLP in the catalytic site
鸟氨酸脱羧酶 (ODC) 是
多胺 (PA) 合成的限速酶。PA 是增殖所需的癌代谢物,药物 ODC 抑制用于治疗过度增殖性疾病,包括癌症和传染病。最有效的 ODC
抑制剂是 1-
氨基-氧基-3-
氨基
丙烷 (APA)。ODC-APA 复合物的先前晶体结构表明 APA 非共价结合 ODC 及其辅因子
5-磷酸吡哆醛 (PLP),并通过与 ODC 底物
鸟氨酸竞争结合催化位点发挥作用。我们通过 APA 结合的 ODC 的新晶体结构重新审视了 APA 结合和 ODC 抑制的机制,我们以 2.49 Å 的分辨率解决了这一问题。该结构清楚地表明在催化位点 APA 和 PLP 之间存在共价
肟,我们通过质谱在溶液中证实了这一点。稳定的
肟与 ODC 发生广泛的相互作用,但不能被分解代谢,这解释了 APA 在 ODC 抑制中的高效力。此外,我们解决了在底物结合袋处结合
柠檬酸盐的 ODC/PLP 复合结构。这两种结构为开发更有效的药物