N-[1-[(2R,4S,5R)-5-[[tert-butyl(dimethyl)silyl]oxymethyl]-4-[2-cyanoethoxy-[di(propan-2-yl)amino]phosphanyl]oxyoxolan-2-yl]-2-oxopyrimidin-4-yl]benzamide | 1435880-63-9

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 核苷和核苷酸类似物
• 英文名称: N-[1-[(2R,4S,5R)-5-[[tert-butyl(dimethyl)silyl]oxymethyl]-4-[2-cyanoethoxy-[di(propan-2-yl)amino]phosphanyl]oxyoxolan-2-yl]-2-oxopyrimidin-4-yl]benzamide
• CAS: 1435880-63-9
• 化学式: C₃₁H₄₈N₅O₆PSi
• 分子量: 645.811
• InChiKey: CPGHJJORJQXUDX-ITFKEBNGSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  6.47
• 重原子数：
  44
• 可旋转键数：
  15
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.61
• 拓扑面积：
  126
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  8

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  N-[1-[(2R,4S,5R)-5-[[tert-butyl(dimethyl)silyl]oxymethyl]-4-[2-cyanoethoxy-[di(propan-2-yl)amino]phosphanyl]oxyoxolan-2-yl]-2-oxopyrimidin-4-yl]benzamide 、 四丁基氟化铵 、 tetrakis(ω-hydroxybutyl)methylene-bridged cavitand 在 5-(乙硫基)-1H-四唑 、 吡啶 、 碘 作用下， 以 二氯甲烷 、 水 为溶剂， 反应 3.08h， 以34%的产率得到
  参考文献：
  名称：

  通过亚磷酸三酯和亚磷酰胺方法中的5'甲硅烷基醚保护进行多个磷酸酯连接的核苷酸偶联

  摘要：

  描述了亚磷酸三酯和亚磷酰胺的偶联方法，用于在单个cavitand模板分子上执行标准脱氧核苷酸的四重溶液相安装。此处的方法基于适当核苷或核苷亚磷酰胺的5'甲硅烷基醚保护。显示了包含四个共价连接的鸟嘌呤核苷酸的新型水溶性物质的合成。

  DOI：

  10.1016/j.tetlet.2013.04.043
• 作为产物：
  描述：

  2-氰乙基N,N-二异丙基氯亚磷酰胺 、 N⁴-benzoyl-5'-O-tert-butyldimethylsilyl-2'-deoxycytidine 在 N,N-二异丙基乙胺 作用下， 以 四氢呋喃 为溶剂， 反应 4.0h， 以77%的产率得到N-[1-[(2R,4S,5R)-5-[[tert-butyl(dimethyl)silyl]oxymethyl]-4-[2-cyanoethoxy-[di(propan-2-yl)amino]phosphanyl]oxyoxolan-2-yl]-2-oxopyrimidin-4-yl]benzamide
  参考文献：
  名称：

  通过亚磷酸三酯和亚磷酰胺方法中的5'甲硅烷基醚保护进行多个磷酸酯连接的核苷酸偶联

  摘要：

  描述了亚磷酸三酯和亚磷酰胺的偶联方法，用于在单个cavitand模板分子上执行标准脱氧核苷酸的四重溶液相安装。此处的方法基于适当核苷或核苷亚磷酰胺的5'甲硅烷基醚保护。显示了包含四个共价连接的鸟嘌呤核苷酸的新型水溶性物质的合成。

  DOI：

  10.1016/j.tetlet.2013.04.043