methyl (1S)-1-({[(1S,3S,4S)-4-amino-1-benzyl-3-hydroxy-5-phenylpentyl]amino}carbonyl)-2,2-dimethylpropylcarbamate | 854754-08-8

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 英文名称: methyl (1S)-1-({[(1S,3S,4S)-4-amino-1-benzyl-3-hydroxy-5-phenylpentyl]amino}carbonyl)-2,2-dimethylpropylcarbamate
• 英文别名: methyl N-[(2S)-1-[[(2S,4S,5S)-5-amino-4-hydroxy-1,6-diphenylhexan-2-yl]amino]-3,3-dimethyl-1-oxobutan-2-yl]carbamate
• CAS: 854754-08-8
• 化学式: C₂₆H₃₇N₃O₄
• 分子量: 455.597
• InChiKey: DKOIJSYAYSPNBA-CWBXHPNXSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  3.9
• 重原子数：
  33
• 可旋转键数：
  12
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.46
• 拓扑面积：
  114
• 氢给体数：
  4
• 氢受体数：
  5

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  methyl (1S)-1-({[(1S,3S,4S)-4-amino-1-benzyl-3-hydroxy-5-phenylpentyl]amino}carbonyl)-2,2-dimethylpropylcarbamate 、 地瑞那韦中间体1 在 N,N-二异丙基乙胺 作用下， 以 乙腈 为溶剂， 反应 24.0h， 以0.36 g的产率得到(3R,3aS,6aR)-hexahydrofuro[2,3-b]furan-3-yl ((2S,3S,5S)-3-hydroxy-5-((S)-2-((methoxycarbonyl)amino)-3,3-dimethylbutanamido)-1,6-diphenylhexan-2-yl)carbamate
  参考文献：
  名称：

  假对称二肽等排体中含有双四氢呋喃的强效杂交 HIV-1 蛋白酶抑制剂的结构分析。

  摘要：

  在伪 C 2 中含有双四氢呋喃 (bis-THF) 的混合 HIV-1 蛋白酶抑制剂 (PI) 的设计、合成和 X 射线结构分析描述了-对称二肽等排体。通过在洛匹那韦的 Phe-Phe 等排体的任一侧掺入地瑞纳韦的双 THF，结合相对的 P2/P2' 位置上的疏水性氨基酸，合成了一系列 PI。构效关系研究表明双 THF 部分可以连接在 P2 或 P2' 位置，而不会显着影响效力。然而，根据侧链的大小和形状，相反 P2/P2' 位置上的基团对效力有显着影响。具有野生型 HIV-1 蛋白酶的抑制剂的共晶结构表明，无论 Phe-Phe 等排体上的位置如何，双 THF 部分都保留了与在达芦那韦-蛋白酶复合物中观察到的相似的相互作用。

  DOI：

  10.1021/acs.jmedchem.0c00529
• 作为产物：
  描述：

  N,N-二苄基-L-苯丙氨酸苄酯 在 sodium tetrahydroborate 、 甲烷磺酸 、 palladium 10% on activated carbon 、 甲酸铵 、 sodium amide 、 N,N-二异丙基乙胺 、 N-[(dimethylamino)-3-oxo-1H-1,2,3-triazolo[4,5-b]pyridin-1-yl-methylene]-N-methylmethanaminium hexafluorophosphate 作用下， 以 甲醇 、 甲基叔丁基醚 、 二乙二醇二甲醚 、 N,N-二甲基甲酰胺 、 异丙醇 为溶剂， 反应 38.5h， 生成 methyl (1S)-1-({[(1S,3S,4S)-4-amino-1-benzyl-3-hydroxy-5-phenylpentyl]amino}carbonyl)-2,2-dimethylpropylcarbamate
  参考文献：
  名称：

  假对称二肽等排体中含有双四氢呋喃的强效杂交 HIV-1 蛋白酶抑制剂的结构分析。

  摘要：

  在伪 C 2 中含有双四氢呋喃 (bis-THF) 的混合 HIV-1 蛋白酶抑制剂 (PI) 的设计、合成和 X 射线结构分析描述了-对称二肽等排体。通过在洛匹那韦的 Phe-Phe 等排体的任一侧掺入地瑞纳韦的双 THF，结合相对的 P2/P2' 位置上的疏水性氨基酸，合成了一系列 PI。构效关系研究表明双 THF 部分可以连接在 P2 或 P2' 位置，而不会显着影响效力。然而，根据侧链的大小和形状，相反 P2/P2' 位置上的基团对效力有显着影响。具有野生型 HIV-1 蛋白酶的抑制剂的共晶结构表明，无论 Phe-Phe 等排体上的位置如何，双 THF 部分都保留了与在达芦那韦-蛋白酶复合物中观察到的相似的相互作用。

  DOI：

  10.1021/acs.jmedchem.0c00529

文献信息

• HIV protease inhibiting compounds
  申请人：DeGoey A. David

  公开号：US20050131017A1

  公开（公告）日：2005-06-16

  A compound of the formula is disclosed as an HIV protease inhibitor. Methods and compositions for inhibiting an HIV infection are also disclosed.

  公开了一种公式的化合物作为HIV蛋白酶抑制剂。还公开了用于抑制HIV感染的方法和组合物。
• HIV Protease Inhibiting Compounds
  申请人：DeGoey David A.

  公开号：US20100249181A1

  公开（公告）日：2010-09-30

  A compound of the formula is disclosed as an HIV protease inhibitor. Methods and compositions for inhibiting an HIV infection are also disclosed.

  公开了一种化合物，其化学式为，用作HIV蛋白酶抑制剂。还公开了用于抑制HIV感染的方法和组合物。
• Design and Synthesis of HIV-1 Protease Inhibitors Incorporating Oxazolidinones as P2/P2‘ Ligands in Pseudosymmetric Dipeptide Isosteres
  作者：G. S. Kiran Kumar Reddy、Akbar Ali、Madhavi N. L. Nalam、Saima Ghafoor Anjum、Hong Cao、Robin S. Nathans、Celia A. Schiffer、Tariq M. Rana

  DOI：10.1021/jm070284z

  日期：2007.9.1

  A series of novel HIV-1 protease inhibitors based on two pseudosymmetric dipeptide isosteres have been synthesized and evaluated. The inhibitors were designed by incorporating N-phenyloxazolidinone-5-carboxamides into the hydroxyethylene and (hydroxyethyl)hydrazine dipeptide isosteres as P2 and P2' ligands. Compounds with (S)-phenyloxazolidinones attached at a position proximal to the central hydroxyl group showed low nM inhibitory activities against wild-type HIV-1 protease. Selected compounds were further evaluated for their inhibitory activities against a panel of multidrug-resistant protease variants and for their antiviral potencies in MT-4 cells. The crystal structures of lopinavir (LPV) and two new inhibitors containing phenyloxazolidinone-based ligands in complex with wild-type HIV-1 protease have been determined. A comparison of the inhibitor-protease structures with the LPV-protease structure provides valuable insight into the binding mode of the new inhibitors to the protease enzyme. Based on the crystal structures and knowledge of structure -activity relationships, new inhibitors can be designed with enhanced enzyme inhibitory and antiviral potencies.
• Structural Analysis of Potent Hybrid HIV-1 Protease Inhibitors Containing Bis-tetrahydrofuran in a Pseudosymmetric Dipeptide Isostere
  作者：Linah N. Rusere、Gordon J. Lockbaum、Mina Henes、Sook-Kyung Lee、Ean Spielvogel、Desaboini Nageswara Rao、Klajdi Kosovrasti、Ellen A. Nalivaika、Ronald Swanstrom、Nese Kurt Yilmaz、Celia A. Schiffer、Akbar Ali

  DOI：10.1021/acs.jmedchem.0c00529

  日期：2020.8.13

  analysis of hybrid HIV-1 protease inhibitors (PIs) containing bis-tetrahydrofuran (bis-THF) in a pseudo-C2-symmetric dipeptide isostere are described. A series of PIs were synthesized by incorporating bis-THF of darunavir on either side of the Phe-Phe isostere of lopinavir in combination with hydrophobic amino acids on the opposite P2/P2′ position. Structure–activity relationship studies indicated that the

  在伪 C 2 中含有双四氢呋喃 (bis-THF) 的混合 HIV-1 蛋白酶抑制剂 (PI) 的设计、合成和 X 射线结构分析描述了-对称二肽等排体。通过在洛匹那韦的 Phe-Phe 等排体的任一侧掺入地瑞纳韦的双 THF，结合相对的 P2/P2' 位置上的疏水性氨基酸，合成了一系列 PI。构效关系研究表明双 THF 部分可以连接在 P2 或 P2' 位置，而不会显着影响效力。然而，根据侧链的大小和形状，相反 P2/P2' 位置上的基团对效力有显着影响。具有野生型 HIV-1 蛋白酶的抑制剂的共晶结构表明，无论 Phe-Phe 等排体上的位置如何，双 THF 部分都保留了与在达芦那韦-蛋白酶复合物中观察到的相似的相互作用。