2-[4-[2-acetamido-3-oxo-3-[[(3S)-2-oxo-1-[(4-phenylphenyl)methyl]azepan-3-yl]amino]propyl]-2-carboxyphenyl]propanedioic acid | 439904-23-1

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 英文名称: 2-[4-[2-acetamido-3-oxo-3-[[(3S)-2-oxo-1-[(4-phenylphenyl)methyl]azepan-3-yl]amino]propyl]-2-carboxyphenyl]propanedioic acid
• CAS: 439904-23-1
• 化学式: C₃₄H₃₅N₃O₉
• 分子量: 629.667
• InChiKey: CGOGPQNYHFBUEF-MBMZGMDYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  3.2
• 重原子数：
  46
• 可旋转键数：
  12
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.29
• 拓扑面积：
  190
• 氢给体数：
  5
• 氢受体数：
  9

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  2-[4-[2-acetamido-3-oxo-3-[[(3S)-2-oxo-1-[(4-phenylphenyl)methyl]azepan-3-yl]amino]propyl]-2-carboxyphenyl]propanedioic acid 在 甲醇 作用下， 反应 3.0h， 以99%的产率得到4-[2-(acetylamino)-3-[[(3S)-1-[[1,1'-(biphenyl)-4-yl]methyl]-2-oxohexahydro-1H-azepin-3-yl]amino]-3-oxo-1-propenyl]-2-carboxybenzenacetic acid
  参考文献：
  名称：

  SAR和X射线。一种结合基于片段的筛选和合理药物设计的新方法：应用于Src SH2纳摩尔抑制剂的发现。

  摘要：

  （pp60）Src是一种参与信号转导的蛋白质，主要在神经元，血小板和破骨细胞中表达。最近在Soriano的KO实验中发现了其确切的生物学作用，除了骨质疏松症外没有其他明显的表型，这种疾病导致骨形成过多。Src家族的SH2结构域特异性识别在+1和+3位置具有磷酸酪氨酸和亲脂氨基酸特征的四肽序列。最近，我们通过该四肽的模块化肽模拟来寻找SH2配体。这产生了数个纳摩尔抑制剂家族。最好的是结合己内酰胺支架，联苯部分和磷酸酪氨酸。但是，这些抑制剂仍然结合了磷酸基团，赋予了与蛋白质良好的结合亲和力。磷酸盐对于候选药物具有不良的特征，即磷酸酶使磷酸基团的高水解速率和高电荷含量阻止了细胞渗透。因此，在寻找Src SH2的最佳非肽配体时，我们寻找了磷酸盐替代物。为此，我们通过碎片晶体学方法设计了SAR。这项工作的开始源于两个实验观察。首先，磷酸苯酯本身对Src SH2表现出可检测的结合亲和力，这一事实使我们

  DOI：

  10.1021/jm010927p
• 作为产物：
  描述：

  2,5-二碘苯甲酸 在 10percent Pd/C palladium diacetate 、 lithium hydroxide 、 sodium hydroxide 、 氯化亚砜 、 氢气 、 sodium hydride 、 1-羟基苯并三唑 、 盐酸-N-乙基-Nˊ-(3-二甲氨基丙基)碳二亚胺 、 三乙胺 、 三(邻甲基苯基)磷 作用下， 以 四氢呋喃 、 1,4-二氧六环 、 甲醇 、 二氯甲烷 、 N,N-二甲基甲酰胺 、 乙腈 为溶剂， 20.0~50.0 ℃ 、176.0 kPa 条件下， 反应 193.25h， 生成 2-[4-[2-acetamido-3-oxo-3-[[(3S)-2-oxo-1-[(4-phenylphenyl)methyl]azepan-3-yl]amino]propyl]-2-carboxyphenyl]propanedioic acid
  参考文献：
  名称：

  SAR和X射线。一种结合基于片段的筛选和合理药物设计的新方法：应用于Src SH2纳摩尔抑制剂的发现。

  摘要：

  （pp60）Src是一种参与信号转导的蛋白质，主要在神经元，血小板和破骨细胞中表达。最近在Soriano的KO实验中发现了其确切的生物学作用，除了骨质疏松症外没有其他明显的表型，这种疾病导致骨形成过多。Src家族的SH2结构域特异性识别在+1和+3位置具有磷酸酪氨酸和亲脂氨基酸特征的四肽序列。最近，我们通过该四肽的模块化肽模拟来寻找SH2配体。这产生了数个纳摩尔抑制剂家族。最好的是结合己内酰胺支架，联苯部分和磷酸酪氨酸。但是，这些抑制剂仍然结合了磷酸基团，赋予了与蛋白质良好的结合亲和力。磷酸盐对于候选药物具有不良的特征，即磷酸酶使磷酸基团的高水解速率和高电荷含量阻止了细胞渗透。因此，在寻找Src SH2的最佳非肽配体时，我们寻找了磷酸盐替代物。为此，我们通过碎片晶体学方法设计了SAR。这项工作的开始源于两个实验观察。首先，磷酸苯酯本身对Src SH2表现出可检测的结合亲和力，这一事实使我们

  DOI：

  10.1021/jm010927p

文献信息

• SAR and X-ray. A New Approach Combining Fragment-Based Screening and Rational Drug Design:  Application to the Discovery of Nanomolar Inhibitors of Src SH2
  作者：Dominique Lesuisse、Gudrun Lange、Pierre Deprez、Didier Bénard、Bernard Schoot、Georges Delettre、Jean-Pierre Marquette、Pierre Broto、Véronique Jean-Baptiste、Paulette Bichet、Edoardo Sarubbi、Eliane Mandine

  DOI：10.1021/jm010927p

  日期：2002.6.1

  ligands for Src SH2, we looked for phosphate replacements. For this, we have designed an SAR by fragment crystallography approach. The start of this work resulted from two experimental observations. First, the fact that phenyl phosphate itself displayed detectable binding affinity for Src SH2 permitted us to perform a screening of small aromatic compounds as phenyl phosphate surrogates. Second, the obtention

  （pp60）Src是一种参与信号转导的蛋白质，主要在神经元，血小板和破骨细胞中表达。最近在Soriano的KO实验中发现了其确切的生物学作用，除了骨质疏松症外没有其他明显的表型，这种疾病导致骨形成过多。Src家族的SH2结构域特异性识别在+1和+3位置具有磷酸酪氨酸和亲脂氨基酸特征的四肽序列。最近，我们通过该四肽的模块化肽模拟来寻找SH2配体。这产生了数个纳摩尔抑制剂家族。最好的是结合己内酰胺支架，联苯部分和磷酸酪氨酸。但是，这些抑制剂仍然结合了磷酸基团，赋予了与蛋白质良好的结合亲和力。磷酸盐对于候选药物具有不良的特征，即磷酸酶使磷酸基团的高水解速率和高电荷含量阻止了细胞渗透。因此，在寻找Src SH2的最佳非肽配体时，我们寻找了磷酸盐替代物。为此，我们通过碎片晶体学方法设计了SAR。这项工作的开始源于两个实验观察。首先，磷酸苯酯本身对Src SH2表现出可检测的结合亲和力，这一事实使我们