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psedouridine | 955-13-5

中文名称
——
中文别名
——
英文名称
psedouridine
英文别名
6-β-D-Ribofuranosyluracil;6-β-D-ribofuranosyl-1H-pyrimidine-2,4-dione
psedouridine化学式
CAS
955-13-5
化学式
C9H12N2O6
mdl
——
分子量
244.204
InChiKey
PNOJJMHMLVSJFV-JBBNEOJLSA-N
BEILSTEIN
——
EINECS
——
  • 物化性质
  • 计算性质
  • ADMET
  • 安全信息
  • SDS
  • 制备方法与用途
  • 上下游信息
  • 反应信息
  • 文献信息
  • 表征谱图
  • 同类化合物
  • 相关功能分类
  • 相关结构分类

物化性质

  • 密度:
    1.641±0.06 g/cm3(Predicted)

计算性质

  • 辛醇/水分配系数(LogP):
    -2.78
  • 重原子数:
    17.0
  • 可旋转键数:
    2.0
  • 环数:
    2.0
  • sp3杂化的碳原子比例:
    0.56
  • 拓扑面积:
    135.64
  • 氢给体数:
    5.0
  • 氢受体数:
    6.0

上下游信息

  • 上游原料
    中文名称 英文名称 CAS号 化学式 分子量
  • 下游产品
    中文名称 英文名称 CAS号 化学式 分子量

反应信息

  • 作为反应物:
    描述:
    psedouridine吡啶盐酸四丁基氟化铵potassium carbonate对甲苯磺酸 作用下, 以 1,4-二氧六环甲醇二甲基亚砜丙酮乙腈 为溶剂, 20.0~130.0 ℃ 、1.5 MPa 条件下, 反应 14.67h, 生成 3-[2-(4-Chloro-phenyl)-2-oxo-ethyl]-6-((2S,3R,4S,5S)-5-fluoromethyl-3,4-dihydroxy-tetrahydro-furan-2-yl)-1H-pyrimidine-2,4-dione
    参考文献:
    名称:
    Rapid microwave-assisted fluorination yielding novel 5′-deoxy-5′-fluorouridine derivatives
    摘要:
    The preparation of (18)F-labeled ligands for positron emission tomography (PET) and the subsequent imaging have to be completed within a half-life of the neutron-deficient isotope ((18)F=110 min). In this paper, we report a rapid fluorination approach to obtain 5'-deoxy-5'-fluoro-substituted uracil nucleoside analogues. Nucleophilic substitution at the 5'-position of the nucleosides was achieved within 45 min providing excellent yields of 75-92% by application of microwaves.
    DOI:
    10.1016/j.bmcl.2006.08.093
  • 作为产物:
    参考文献:
    名称:
    Nucleosides. 113. Synthesis of 6-(.beta.-D-ribofuranosyl)pyrimidines. A new class of pyrimidine C-nucleosides
    摘要:
    DOI:
    10.1021/jo00394a024
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文献信息

  • Synthesis of C -pyrimidyl nucleosides starting from alkynyl ribofuranosides
    作者:Grégory Legrave、Ramzi Ait Youcef、Damien Afonso、Angélique Ferry、Jacques Uziel、Nadège Lubin-Germain
    DOI:10.1016/j.carres.2018.04.005
    日期:2018.6
    The synthesis of four C-pyrimidyl nucleosides is described by condensation of small nitrogen molecules (amidines and ureas) onto alkynyl riboside derivatives. These last compounds were obtained by indium mediated stereoselective alkynylation of suitably protected ribose derivatives and the condensation reaction conditions were studied in order to favor the N-attack of the nitrogen molecules leading
    四个C-嘧啶核苷的合成是通过将小氮分子(am和尿素)缩合到炔基核糖核苷衍生物上来描述的。通过适当保护的核糖生物介导的立体选择性炔基化反应,获得了这些最后的化合物,并研究了缩合反应条件,以促进氮原子对氮的进攻,从而导致嘧啶环的形成。
  • N3-Methyluridine and 2′-O-Alkyl/2′-Fluoro-N3-methyluridine functionalized nucleic acids improve nuclease resistance while maintaining duplex geometry
    作者:Avijit Sahoo、Gourav Das、Atanu Ghosh、Siddharam Shivappa Bagale、Nishant Kumar Choudhary、S. Harikrishna、Surajit Sinha、Kiran R. Gore
    DOI:10.1016/j.bmc.2024.117616
    日期:2024.2
    (2′-O-alkyl/2′-F-m3U) phosphoramidites and their incorporation in DNA and RNA oligonucleotides. The duplex binding affinity and base discrimination studies showed that all 2′-O-alkyl/2′-F-m3U modifications significantly decreased the thermal stability and base-pairing discrimination ability. Serum stability study of dT20 with 2′-O-alkyl-m3U modification exhibited excellent nuclease resistance when incubated with
    在此,我们报道了2'- O-烷基/2'--N 3 -甲基尿苷(2'- O-烷基/2'-Fm 3 U)亚酰胺的合成及其在DNA和RNA寡核苷酸中的掺入。双链体结合亲和力和碱基区分研究表明,所有2′- O-烷基/2′-Fm 3 U修饰均显着降低了热稳定性和碱基配对区分能力。与 m 3 U, 2 相比,具有 2'- O -烷基-m 3 U 修饰的 dT 20在与 3'-核酸外切酶 (SVPD) 或 5'-核酸外切酶 (PDE-II) 一起孵育时表现出优异的核酸酶抗性'-F,2'-OMe 修饰的寡核苷酸。 RNA 十四聚体双链体的 MD 模拟研究表明,m 3 U 和 2′- O -甲基-m 3 U 修饰通过破坏 Watson-Crick 氢键和碱基堆积相互作用来降低双链体稳定性。进一步的分子模型研究表明,2′- O-丙基-m 3 U 修饰与 3′- 和 5′- 核酸外切酶活性位点的氨基酸残基表
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