(2S)-2-acetamido-4-methyl-N-[(2S)-4-methyl-1-[[(2S)-4-methyl-1-[(2R)-2-methyloxiran-2-yl]-1-oxopentan-2-yl]amino]-1-oxopentan-2-yl]pentanamide | 254888-28-3

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 英文名称: (2S)-2-acetamido-4-methyl-N-[(2S)-4-methyl-1-[[(2S)-4-methyl-1-[(2R)-2-methyloxiran-2-yl]-1-oxopentan-2-yl]amino]-1-oxopentan-2-yl]pentanamide
• CAS: 254888-28-3
• 化学式: C₂₃H₄₁N₃O₅
• 分子量: 439.596
• InChiKey: PYFWYQINSDMBKY-KEXUJGGDSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  3
• 重原子数：
  31
• 可旋转键数：
  13
• 环数：
  1.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.83
• 拓扑面积：
  117
• 氢给体数：
  3
• 氢受体数：
  5

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  Ac-Leu-Leu-OMe 在 盐酸 、 亚硝酸特丁酯 、 肼 作用下， 以 1,4-二氧六环 、 甲醇 、 二氯甲烷 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 6.0h， 生成 (2S)-2-acetamido-4-methyl-N-[(2S)-4-methyl-1-[[(2S)-4-methyl-1-[(2R)-2-methyloxiran-2-yl]-1-oxopentan-2-yl]amino]-1-oxopentan-2-yl]pentanamide
  参考文献：
  名称：

  使用肽环氧酮抑制剂对 20S 蛋白酶体的底物偏好进行系统分析

  摘要：

  20S 蛋白酶体与天然或合成底物的裂解分析允许推断活性位点的底物特异性，并为合理设计高亲和力蛋白酶体抑制剂铺平了道路。然而，由于缺乏适当的结构数据，裂解偏好的细节仍然是个谜。我们采用一种独特的方法，使用不可逆作用的 α',β' 环氧酮 (ep) 抑制剂系统地检查了酵母和人类蛋白酶体的底物特异性。生化和结构分析提供了对不同活性位点的底物偏好的独特见解，并突出了蛋白酶体类型之间的差异，这些差异可能会在未来的抑制剂设计工作中加以考虑。(1) 由于空间位阻原因，P1 位带有 Val 或 Ile 的环氧酮是所有活性位点的弱抑制剂。(2) β2c 选择性化合物 Ac-LAE-ep 的鉴定代表了开发区分 β2c 和 β2i 的化合物的有希望的起点。(3) 发现化合物 Ac-LAA-ep 比 β5i 更有利于亚基 β5c 三个数量级。(4) 酵母β1 和人β1c 亚基优先结合S1 口袋中的Asp 和Leu，而Glu

  DOI：

  10.1021/jacs.5b03688

文献信息

• Enzyme inhibition
  申请人：Crews Craig M.

  公开号：US20090099097A1

  公开（公告）日：2009-04-16

  Peptide-based compounds including heteroatom-containing, three-membered rings efficiently and selectively inhibit specific activities of N-terminal nucleophile (Ntn) hydrolases. The activities of those Ntn having multiple activities can be differentially inhibited by the compounds described. For example, the chymotrypsin-like and PGPH activities of the 20S proteasome can be selectively inhibited with the inventive compounds. The peptide-based compounds include an electron withdrawing group adjacent to the ring functionality, and the peptide include at least three peptide units. Among other therapeutic utilities, the peptide-based compounds exhibit anti-inflammatory and inhibition of cell proliferation, involving therapeutic applications for these compounds.
• US7476650B2
  申请人：——

  公开号：US7476650B2

  公开（公告）日：2009-01-13
• Systematic Analyses of Substrate Preferences of 20S Proteasomes Using Peptidic Epoxyketone Inhibitors
  作者：Eva M. Huber、Gerjan de Bruin、Wolfgang Heinemeyer、Guillem Paniagua Soriano、Herman S. Overkleeft、Michael Groll

  DOI：10.1021/jacs.5b03688

  日期：2015.6.24

  channel give rise to the β1 selectivity of compounds featuring Pro at the P3 site. Altogether, 23 different epoxyketone inhibitors, five proteasome mutants, and 43 crystal structures served to delineate a detailed picture of the substrate and ligand specificities of proteasomes and will further guide drug development efforts toward subunit-specific proteasome inhibitors for applications as diverse

  20S 蛋白酶体与天然或合成底物的裂解分析允许推断活性位点的底物特异性，并为合理设计高亲和力蛋白酶体抑制剂铺平了道路。然而，由于缺乏适当的结构数据，裂解偏好的细节仍然是个谜。我们采用一种独特的方法，使用不可逆作用的 α',β' 环氧酮 (ep) 抑制剂系统地检查了酵母和人类蛋白酶体的底物特异性。生化和结构分析提供了对不同活性位点的底物偏好的独特见解，并突出了蛋白酶体类型之间的差异，这些差异可能会在未来的抑制剂设计工作中加以考虑。(1) 由于空间位阻原因，P1 位带有 Val 或 Ile 的环氧酮是所有活性位点的弱抑制剂。(2) β2c 选择性化合物 Ac-LAE-ep 的鉴定代表了开发区分 β2c 和 β2i 的化合物的有希望的起点。(3) 发现化合物 Ac-LAA-ep 比 β5i 更有利于亚基 β5c 三个数量级。(4) 酵母β1 和人β1c 亚基优先结合S1 口袋中的Asp 和Leu，而Glu