(S,R)-N6-(2-hydroxy-3,4-epoxybut-1-yl)-2'-deoxyadenosine | 1197991-95-9

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘌呤核苷
• 英文名称: (S,R)-N6-(2-hydroxy-3,4-epoxybut-1-yl)-2'-deoxyadenosine
• CAS: 1197991-95-9
• 化学式: C₁₄H₁₉N₅O₅
• 分子量: 337.335
• InChiKey: VBYDXKZJNMTVPA-FBDQPXRJSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -1.36
• 重原子数：
  24.0
• 可旋转键数：
  6.0
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.64
• 拓扑面积：
  138.08
• 氢给体数：
  4.0
• 氢受体数：
  10.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  (S,R)-N6-(2-hydroxy-3,4-epoxybut-1-yl)-2'-deoxyadenosine 在 水 作用下， 反应 12.0h， 生成 (S,S)-1,N6-(1-hydroxymethyl-2-hydroxypropan-1,3-diyl)-2'-deoxyadenosine 、 (S,S)-1,N6-(2-hydroxy-3-hydroxymethylpropan-1,3-diyl)-2'-deoxyadenosine
  参考文献：
  名称：

  1,2,3,4-二环氧丁烷的环外脱氧腺苷加合物：合成、结构阐明和机理研究

  摘要：

  1,2,3,4-二环氧丁烷 (DEB) 被认为是 1,3-丁二烯的最终致癌代谢物，1,3-丁二烯是城市空气中存在的一种重要的工业化学品和环境污染物。虽然它优先修饰 DNA 中的鸟嘌呤，但 DEB 会诱导大量 A → T 颠换，表明它在腺嘌呤核碱基处形成强烈的错配损伤。我们现在报告了 DEB 的三个潜在错配环外腺嘌呤病变的发现：N 6 , N 6 -(2,3-dihydroxybutan-1,4-diyl)-2'-deoxyadenosine (compound 2 ), 1, N 6 -( 2-hydroxy-3-hydroxymethylpropan-1,3-diyl)-2'-deoxyadenosine (compound 3 ), and 1, N 6-(1-羟甲基-2-羟基丙烷-1,3-二基)-2'-脱氧腺苷(化合物4 )。新型 DEB-dA 加合物的结构和立体化学由紫外和核磁共振

  DOI：

  10.1021/tx900312e
• 作为产物：
  描述：

  2'-脱氧肌苷 、 (S,R)-N-Fmoc-1-amino-2-hydroxy-3,4-epoxybutane 在 benzotriazol-1-yloxyl-tris-(pyrrolidino)-phosphonium hexafluorophosphate 、 N,N-二异丙基乙胺 作用下， 以 二甲基亚砜 为溶剂， 反应 120.0h， 以95%的产率得到(S,R)-N6-(2-hydroxy-3,4-epoxybut-1-yl)-2'-deoxyadenosine
  参考文献：
  名称：

  1,2,3,4-二环氧丁烷的环外脱氧腺苷加合物：合成、结构阐明和机理研究

  摘要：

  1,2,3,4-二环氧丁烷 (DEB) 被认为是 1,3-丁二烯的最终致癌代谢物，1,3-丁二烯是城市空气中存在的一种重要的工业化学品和环境污染物。虽然它优先修饰 DNA 中的鸟嘌呤，但 DEB 会诱导大量 A → T 颠换，表明它在腺嘌呤核碱基处形成强烈的错配损伤。我们现在报告了 DEB 的三个潜在错配环外腺嘌呤病变的发现：N 6 , N 6 -(2,3-dihydroxybutan-1,4-diyl)-2'-deoxyadenosine (compound 2 ), 1, N 6 -( 2-hydroxy-3-hydroxymethylpropan-1,3-diyl)-2'-deoxyadenosine (compound 3 ), and 1, N 6-(1-羟甲基-2-羟基丙烷-1,3-二基)-2'-脱氧腺苷(化合物4 )。新型 DEB-dA 加合物的结构和立体化学由紫外和核磁共振

  DOI：

  10.1021/tx900312e

文献信息

• Exocyclic Deoxyadenosine Adducts of 1,2,3,4-Diepoxybutane: Synthesis, Structural Elucidation, and Mechanistic Studies
  作者：Uthpala Seneviratne、Sergey Antsypovich、Melissa Goggin、Danae Quirk Dorr、Rebecca Guza、Adam Moser、Carrie Thompson、Darrin M. York、Natalia Tretyakova

  DOI：10.1021/tx900312e

  日期：2010.1.18

  guanine within DNA, DEB induces a large number of A → T transversions, suggesting that it forms strongly mispairing lesions at adenine nucleobases. We now report the discovery of three potentially mispairing exocyclic adenine lesions of DEB: N6,N6-(2,3-dihydroxybutan-1,4-diyl)-2′-deoxyadenosine (compound 2), 1,N6-(2-hydroxy-3-hydroxymethylpropan-1,3-diyl)-2′-deoxyadenosine (compound 3), and 1,N6-(1

  1,2,3,4-二环氧丁烷 (DEB) 被认为是 1,3-丁二烯的最终致癌代谢物，1,3-丁二烯是城市空气中存在的一种重要的工业化学品和环境污染物。虽然它优先修饰 DNA 中的鸟嘌呤，但 DEB 会诱导大量 A → T 颠换，表明它在腺嘌呤核碱基处形成强烈的错配损伤。我们现在报告了 DEB 的三个潜在错配环外腺嘌呤病变的发现：N 6 , N 6 -(2,3-dihydroxybutan-1,4-diyl)-2'-deoxyadenosine (compound 2 ), 1, N 6 -( 2-hydroxy-3-hydroxymethylpropan-1,3-diyl)-2'-deoxyadenosine (compound 3 ), and 1, N 6-(1-羟甲基-2-羟基丙烷-1,3-二基)-2'-脱氧腺苷(化合物4 )。新型 DEB-dA 加合物的结构和立体化学由紫外和核磁共振