glycinyl-alanyl-glycinyl-alanyl-glycine | 1073635-94-5

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 英文名称: glycinyl-alanyl-glycinyl-alanyl-glycine
• 英文别名: GAGAG-NH2；GAGAG
• CAS: 1073635-94-5
• 化学式: C₁₂H₂₂N₆O₅
• 分子量: 330.344
• InChiKey: DXBNVZRHJWMZRC-BQBZGAKWSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -4.33
• 重原子数：
  23.0
• 可旋转键数：
  9.0
• 环数：
  0.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.58
• 拓扑面积：
  185.51
• 氢给体数：
  6.0
• 氢受体数：
  6.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  glycinyl-alanyl-glycinyl-alanyl-glycine 、 在 O-(1H-benzotriazol-1-yl)-N,N,N',N'-tetramethyluronium hexafluorophosphate 、 N,N-二异丙基乙胺 作用下， 以 二氯甲烷 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 0.17h， 以62%的产率得到
  参考文献：
  名称：

  低聚（对亚苯基亚乙烯基）-肽缀合物：溶液中和固液界面的合成和自组装

  摘要：

  已经使用固相和液相策略合成了两种低聚（对亚苯基亚乙烯基）-肽杂化两亲物。两亲物由 pi 共轭低聚（对亚苯基亚乙烯基）三聚体（OPV）组成，该三聚体与甘氨酰-丙氨酰-甘氨酰-丙氨酰-甘氨酸（GAGAG）丝状β-折叠或甘氨酰-丙氨酰-天冬酰胺偶联-脯氨酰-天门冬酰胺-丙氨酰-丙氨酰-甘氨酸 (GANPNAAG) β-转角形成寡肽序列。如果避免强酸性条件，固相策略使人们能够使用更长的肽，而溶液相偶联提供更好的产量。通过在亚分子水平上通过扫描隧道显微镜 (STM) 对 OPV-GAGAG 的二维 (2D) 自组装进行的研究证明了双层的形成，其中分子以β-折叠构象反平行。在 OPV-GANPNAAG 的情况下，无法观察到自组装单层。吸收、荧光和圆二色性研究表明 OPV-GAGAG 和 OPV-GANPNAAG 在多种有机溶剂中聚集。在水低温透射电子显微镜 (cryo-TEM)、原子力显微镜 (AFM

  DOI：

  10.1021/ja803026j
• 作为产物：
  描述：

  BOC-甘氨酸 、 N-叔丁氧羰基-L-丙氨酸 在 O-(1H-benzotriazol-1-yl)-N,N,N',N'-tetramethyluronium hexafluorophosphate 、 N,N-二异丙基乙胺 、 氢氟酸 作用下， 生成 glycinyl-alanyl-glycinyl-alanyl-glycine
  参考文献：
  名称：

  低聚（对亚苯基亚乙烯基）-肽缀合物：溶液中和固液界面的合成和自组装

  摘要：

  已经使用固相和液相策略合成了两种低聚（对亚苯基亚乙烯基）-肽杂化两亲物。两亲物由 pi 共轭低聚（对亚苯基亚乙烯基）三聚体（OPV）组成，该三聚体与甘氨酰-丙氨酰-甘氨酰-丙氨酰-甘氨酸（GAGAG）丝状β-折叠或甘氨酰-丙氨酰-天冬酰胺偶联-脯氨酰-天门冬酰胺-丙氨酰-丙氨酰-甘氨酸 (GANPNAAG) β-转角形成寡肽序列。如果避免强酸性条件，固相策略使人们能够使用更长的肽，而溶液相偶联提供更好的产量。通过在亚分子水平上通过扫描隧道显微镜 (STM) 对 OPV-GAGAG 的二维 (2D) 自组装进行的研究证明了双层的形成，其中分子以β-折叠构象反平行。在 OPV-GANPNAAG 的情况下，无法观察到自组装单层。吸收、荧光和圆二色性研究表明 OPV-GAGAG 和 OPV-GANPNAAG 在多种有机溶剂中聚集。在水低温透射电子显微镜 (cryo-TEM)、原子力显微镜 (AFM

  DOI：

  10.1021/ja803026j

文献信息

• Morphology and chirality controlled self-assembled nanostructures of porphyrin–pentapeptide conjugate: effect of the peptide secondary conformation
  作者：Quanbo Wang、Yanli Chen、Pan Ma、Jitao Lu、Xiaomei Zhang、Jianzhuang Jiang

  DOI：10.1039/c1jm10547g

  日期：——

  An optically active porphyrin–pentapeptide conjugate 1, actually a porphyrinato zinc complex covalently linked with a glycinyl–alanyl–glycinyl–alanyl–glycine (GAGAG) peptide chain, was designed and synthesized. The self-assembly properties of this novel porphyrin–pentapeptide conjugate in THF/n-hexane and THF/water were comparatively investigated by electronic absorption, circular dichroism (CD), IR spectroscopy, transmission electron microscopy (TEM), scanning electron microscopy (SEM), and X-ray diffraction (XRD) technique. Associated with the different secondary conformation of the pentapeptide chain covalently linked to the porphyrin ring in different solvent systems, self-assembly of conjugate 1 leads to the formation of nanofibers with right-handed helical arrangement and nanotubes with left-handed helical arrangement in a stack of porphyrin chromophores according to the CD spectroscopic result in apolar THF/n-hexane (1 : 3) and polar THF/water (1 : 3) system depending on the cooperation between intramolecular or intermolecular hydrogen bonding interaction with chiral discrimination between pentapeptide chains and porphyrin–porphyrin interactions in the direction parallel to the tetrapyrrole ring of neighboring conjugate molecules. IR spectroscopic result clearly reveals the α-helix and β-sheet secondary conformation, respectively, employed by the pentapeptide chain attached at the porphyrin core in the nanostructures formed in THF/n-hexane (1 : 3) and THF/water (1 : 3). The X-ray diffraction (XRD) result confirms that in the nanotubes, a dimeric supramolecular bilayer structure was formed through an intermolecular hydrogen bonding interaction between two conjugate molecules which, as the building block, self-assembles into the target nanostructures. These results clearly reveal the effect of a secondary conformation of pentapeptide chain in the conjugate molecule on the packing mode of porphyrin chromophore, supramolecular chirality, and morphology of the self-assembled nanostructure. The present result represents not only the first example of organic nanostructures self-assembled from a covalently linked porphyrin–pentapeptide conjugate, but more importantly the first effort towards controlling and tuning the morphology and in particular the supramolecular chirality of porphyrin nanostructures via tuning the secondary conformation of peptides in different solvent systems, which is helpful towards understanding, designing, preparing, and mimicking the structure and role of naturally occurring porphyrin–peptide conjugates. In addition, both nanofibers and nanotubes were revealed to show good semiconducting properties.

  本研究设计并合成了一种具有光学活性的卟啉五肽共轭物 1，它实际上是一种与甘氨酰甘氨酰甘氨酰甘氨酸（GAGAG）肽链共价连接的卟啉锌络合物。通过电子吸收、圆二色（CD）、红外光谱、透射电子显微镜（TEM）、扫描电子显微镜（SEM）和 X 射线衍射（XRD）技术，比较研究了这种新型卟啉五肽共轭物在 THF/n-hexane 和 THF/water 中的自组装特性。共轭物 1 在不同溶剂体系中与卟啉环共价连接的五肽链具有不同的次级构象，根据 CD 光谱结果，在无极性 THF/n-hexane (1â. â3) 和极性 THF/n-hexane (1â. â3) 溶液中，共轭物 1 的自组装导致在卟啉发色团堆叠中形成右手螺旋排列的纳米纤维和左手螺旋排列的纳米管：3）和极性四氢呋喃/水（1â:â3）体系中，分子内或分子间的氢键相互作用与五肽链之间的手性辨别以及卟啉与卟啉在平行于相邻共轭分子的四吡咯环方向上的相互作用之间的合作关系。红外光谱结果清楚地显示了在 THF/n-hexane (1â:â3) 和 THF/water (1â:â3) 中形成的纳米结构中，卟啉核心上附着的五肽链分别采用了δ-螺旋和δ-片二级构象。X 射线衍射（XRD）结果证实，在纳米管中，通过两个共轭分子之间的分子间氢键作用，形成了二聚超分子双层结构。这些结果清楚地揭示了共轭分子中五肽链的次级构象对卟啉发色团的堆积模式、超分子手性和自组装纳米结构的形态的影响。本成果不仅是首个由共价连接的卟啉五肽共轭物自组装成有机纳米结构的实例，更重要的是首次尝试通过调节肽在不同溶剂体系中的次级构象来控制和调节卟啉纳米结构的形态，特别是超分子手性，这有助于理解、设计、制备和模拟天然存在的卟啉肽共轭物的结构和作用。此外，纳米纤维和纳米管都显示出良好的半导体特性。