N-(N-benzyloxycarbonyl-valyl)-leucine methyl ester | 4817-93-0

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 英文名称: N-(N-benzyloxycarbonyl-valyl)-leucine methyl ester
• 英文别名: N-(N-Benzyloxycarbonyl-valyl)-leucin-methylester；Methyl 4-methyl-2-[[3-methyl-2-(phenylmethoxycarbonylamino)butanoyl]amino]pentanoate
• CAS: 4817-93-0；53941-41-6；55790-11-9
• 化学式: C₂₀H₃₀N₂O₅
• 分子量: 378.469
• InChiKey: PKLDYUWADSNDGB-UHFFFAOYSA-N

物化性质

• 熔点：
  101-102 °C
• 沸点：
  536.1±40.0 °C(Predicted)
• 密度：
  1.101±0.06 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  3.8
• 重原子数：
  27
• 可旋转键数：
  11
• 环数：
  1.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.55
• 拓扑面积：
  93.7
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  5

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  N-(N-benzyloxycarbonyl-valyl)-leucine methyl ester 在 sodium hydroxide 作用下， 生成 N-(N-benzyloxycarbonyl-valyl)-leucine
  参考文献：
  名称：

  DNA double-strand break repair in cell-free extracts from Ku80-deficient cells: implications for Ku serving as an alignment factor in non-homologous DNA end joining

  摘要：

  非同源 DNA 末端连接 (NHEJ) 被认为是哺乳动物细胞中双链断裂 (DSB) 修复的主要途径，并且取决于 DNA 末端结合 Ku70/80 异二聚体等。为了研究 Ku 在 NHEJ 中的功能，我们比较了野生型 CHO-K1 细胞、Ku80 缺陷型 xrs6 细胞和 Ku80-cDNA 互补的 xrs6 细胞 (xrs6-Ku80) 的无细胞提取物重新加入不同类型的细胞的能力。 DSB 体外。虽然两种 Ku80 丰富的提取物在重新连接所有类型的 DNA 末端时非常高效且准确，但 xrs6 提取物却显示出 NHEJ 效率和准确度大幅下降。在包含与 5' 突出端或平端相连的 3' 突出端的非同源末端构型中，准确性的缺乏最为明显。虽然 3'-突出端的序列大部分通过填充 DNA 合成在 Ku80 熟练的提取物中得以保留，但它们在 xrs6 提取物中总是完全丢失，因此，相反，在其断点处出现显示微同源补丁的小缺失。总之，我们的结果与 Ku 缺陷酵母菌株的先前结果一致，表明 Ku 可能作为比对因子，不仅提高 NHEJ 效率，而且提高准确性。此外，在缺乏 Ku 的情况下存在二级 NHEJ 活性，这很容易出错，并且可能通过碱基配对相互作用来辅助。

  DOI：

  10.1093/nar/28.13.2585
• 作为产物：
  描述：

  N-苄氧羰基-DL-缬氨酸 在 乙醚 、 三正丁胺 、 氯甲酸乙酯 作用下， 生成 N-(N-benzyloxycarbonyl-valyl)-leucine methyl ester
  参考文献：
  名称：

  DNA double-strand break repair in cell-free extracts from Ku80-deficient cells: implications for Ku serving as an alignment factor in non-homologous DNA end joining

  摘要：

  非同源 DNA 末端连接 (NHEJ) 被认为是哺乳动物细胞中双链断裂 (DSB) 修复的主要途径，并且取决于 DNA 末端结合 Ku70/80 异二聚体等。为了研究 Ku 在 NHEJ 中的功能，我们比较了野生型 CHO-K1 细胞、Ku80 缺陷型 xrs6 细胞和 Ku80-cDNA 互补的 xrs6 细胞 (xrs6-Ku80) 的无细胞提取物重新加入不同类型的细胞的能力。 DSB 体外。虽然两种 Ku80 丰富的提取物在重新连接所有类型的 DNA 末端时非常高效且准确，但 xrs6 提取物却显示出 NHEJ 效率和准确度大幅下降。在包含与 5' 突出端或平端相连的 3' 突出端的非同源末端构型中，准确性的缺乏最为明显。虽然 3'-突出端的序列大部分通过填充 DNA 合成在 Ku80 熟练的提取物中得以保留，但它们在 xrs6 提取物中总是完全丢失，因此，相反，在其断点处出现显示微同源补丁的小缺失。总之，我们的结果与 Ku 缺陷酵母菌株的先前结果一致，表明 Ku 可能作为比对因子，不仅提高 NHEJ 效率，而且提高准确性。此外，在缺乏 Ku 的情况下存在二级 NHEJ 活性，这很容易出错，并且可能通过碱基配对相互作用来辅助。

  DOI：

  10.1093/nar/28.13.2585