α-D-mannopyranosyl-(1<*>6)-<α-D-mannopyranosyl-(1<*>3)>-α-D-mannopyranosyl-(1<*>6)-<α-D-mannopyranosyl-(1<*>2)-α-D-mannopyranosyl-(1<*>3)>-β-D-mannopyranosyl-(1<*>4)-2-acetamido-2-deoxy-β-D-glucopyranosyl-(1<*>4)-2-acetamido-2-deoxy-D-glucopyr.. | 123062-76-0

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机氧化合物
• 英文名称: α-D-mannopyranosyl-(1<*>6)-<α-D-mannopyranosyl-(1<*>3)>-α-D-mannopyranosyl-(1<*>6)-<α-D-mannopyranosyl-(1<*>2)-α-D-mannopyranosyl-(1<*>3)>-β-D-mannopyranosyl-(1<*>4)-2-acetamido-2-deoxy-β-D-glucopyranosyl-(1<*>4)-2-acetamido-2-deoxy-D-glucopyr..
• 英文别名: Man(a1-2)Man(a1-3)[Man(a1-3)[Man(a1-6)]Man(a1-6)]Man(b1-4)GlcNAc(b1-4)GlcNAc；N-[(3R,4R,5S,6R)-5-[(2S,3R,4R,5S,6R)-3-acetamido-5-[(2S,3S,4S,5R,6R)-4-[(2R,3S,4S,5S,6R)-4,5-dihydroxy-6-(hydroxymethyl)-3-[(2S,3S,4S,5S,6R)-3,4,5-trihydroxy-6-(hydroxymethyl)oxan-2-yl]oxyoxan-2-yl]oxy-6-[[(2S,3S,4S,5R,6R)-3,5-dihydroxy-4-[(2S,3S,4S,5S,6R)-3,4,5-trihydroxy-6-(hydroxymethyl)oxan-2-yl]oxy-6-[[(2S,3S,4S,5S,6R)-3,4,5-trihydroxy-6-(hydroxymethyl)oxan-2-yl]oxymethyl]oxan-2-yl]oxymethyl]-3,5-dihydroxyoxan-2-yl]oxy-4-hydroxy-6-(hydroxymethyl)oxan-2-yl]oxy-2,4-dihydroxy-6-(hydroxymethyl)oxan-3-yl]acetamide
• CAS: 123062-76-0
• 化学式: C₅₂H₈₈N₂O₄₁
• 分子量: 1397.26
• InChiKey: LRZHHNAKZUMMFF-KIWXPYNMSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -16
• 重原子数：
  95
• 可旋转键数：
  24
• 环数：
  8.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.96
• 拓扑面积：
  682
• 氢给体数：
  26
• 氢受体数：
  41

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  邻氨基苯甲酸 、 α-D-mannopyranosyl-(1<*>6)-<α-D-mannopyranosyl-(1<*>3)>-α-D-mannopyranosyl-(1<*>6)-<α-D-mannopyranosyl-(1<*>2)-α-D-mannopyranosyl-(1<*>3)>-β-D-mannopyranosyl-(1<*>4)-2-acetamido-2-deoxy-β-D-glucopyranosyl-(1<*>4)-2-acetamido-2-deoxy-D-glucopyr.. 在 sodium cyanoborohydride 作用下， 生成
  参考文献：
  名称：

  Hexose Rearrangements upon Fragmentation of N-Glycopeptides and Reductively Aminated N-Glycans

  摘要：

  众所周知，质子化形式的聚糖和聚糖共轭物的串联质谱分析会发生重排反应，导致内部残基丢失。在此，我们通过 MALDI-TOF/TOF-MS/MS 和 ESI 离子阱-MS/MS，研究了 N-糖肽和还原胺化 N-糖的串联质谱中发生的己糖重排。用 2- 氨基苯甲酰胺和 2- 氨基苯甲酸标记的核糖核酸酶 B 的低聚甘露糖苷 N-聚糖的质子加合物碎裂导致 1 至 5 个己糖残基转移到荧光标记的最内层 N-乙酰葡糖胺上。来自各种生物来源的具有低聚甘露糖苷的糖肽也同样会发生己糖重排反应，产生获得一个或两个己糖分子的壳寡糖裂解产物。胰免疫球蛋白 G Fc-糖肽具有双年甲基 N-聚糖，同样也会发生己糖重排反应，导致己糖转移到保留最内层 N-乙酰葡糖胺的肽分子上。因此，作为一种普遍现象，还原胺化聚糖和糖肽的串联质谱分析可能会导致己糖重排。在开发用于全新糖肽结构分析的工具时，必须考虑到糖肽 MS/MS 的这一特性。

  DOI：

  10.1021/ac900278q