摘要:
描述了作为小分子库的关键组成部分的 β 转角模拟库的设计和合成,该库针对涉及蛋白质-蛋白质相互作用的主要识别基序。对蛋白质数据库 (PDB) 中 10,245 个 β-转角的几何特征分析表明,反式-吡咯烷-3,4-二甲酰胺可作为有效且可合成的文库模板。这通过最初针对一系列识别内源性配体中的 β-转角结构的肽激活 GPCR 筛选选定化合物而得到证实。这项验证研究通过对 κ-阿片受体 (KOR) 具有高亲和力的非碱性和碱性小分子(分别为 K(i) = 390 和 23 nM)的鉴定而得到强调。与合作者的筛选能力一致并经过设计验证,完整的文库被组装为 20 种化合物的 210 种混合物,提供总共 4200 种化合物,旨在模拟天然存在的 β-转角中 4 个残基中的 3 个的所有可能排列. 独特的设计,并且由于模板的 C(2) 对称性,典型的 20 × 20 × 20 混合物(8000 种化合物制备为