6-N-phenoxyacetyl-3',5'-O-(1,1,3,3-tetraisopropyldisiloxane-1,3-diyl)-2'-O-[2-(tetrazol-5-yl)ethyl]adenosine | 1030609-52-9

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘌呤核苷
• 英文名称: 6-N-phenoxyacetyl-3',5'-O-(1,1,3,3-tetraisopropyldisiloxane-1,3-diyl)-2'-O-[2-(tetrazol-5-yl)ethyl]adenosine
• 英文别名: N-[9-[(6aR,8R,9R,9aR)-2,2,4,4-tetra(propan-2-yl)-9-[2-(2H-tetrazol-5-yl)ethoxy]-6a,8,9,9a-tetrahydro-6H-furo[3,2-f][1,3,5,2,4]trioxadisilocin-8-yl]purin-6-yl]-2-phenoxyacetamide
• CAS: 1030609-52-9
• 化学式: C₃₃H₄₉N₉O₇Si₂
• 分子量: 739.979
• InChiKey: WVQOENQFRZQECF-QCVVPRSOSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  4.84
• 重原子数：
  51
• 可旋转键数：
  13
• 环数：
  6.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.61
• 拓扑面积：
  183
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  13

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  6-N-phenoxyacetyl-3',5'-O-(1,1,3,3-tetraisopropyldisiloxane-1,3-diyl)-2'-O-[2-(tetrazol-5-yl)ethyl]adenosine 、 碘甲烷 在 碳酸氢钠 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 19.0h， 以21%的产率得到N-[9-[(6aR,8R,9R,9aR)-9-[2-(2-methyltetrazol-5-yl)ethoxy]-2,2,4,4-tetra(propan-2-yl)-6a,8,9,9a-tetrahydro-6H-furo[3,2-f][1,3,5,2,4]trioxadisilocin-8-yl]purin-6-yl]-2-phenoxyacetamide
  参考文献：
  名称：

  2' - O-（四唑-5-基）乙基修饰的寡核苷酸的合成与杂交特性

  摘要：

  2'- ø - （1 ħ -四唑-5-基）乙基腺苷用2'-合成ö -cyanoethyladenosine衍生物作为关键中间体。2'- O-（1H-四唑-5-基）乙基修饰物表现出令人感兴趣的性质，例如在质子化形式和去质子化形式之间四唑残基的结构变化。所述Ť米具有2'-各种寡核苷酸的实验ø - （1个ħ与未修饰的寡核苷酸相比，对-四唑-5-基）乙基修饰的腺苷显示出降低的杂交亲和力，其互补的寡聚脱氧核苷酸。在四唑部分的结构和理化性质的基础上，探讨了降低杂交亲和力的机理。

  DOI：

  10.1016/j.tet.2008.02.075
• 作为产物：
  描述：

  3',5'-O-(1,1,3,3-tetraisopropyldisiloxane-1,3-diyl)-2'-O-[2-(tetrazol-5-yl)ethyl]adenosine 、 苯氧乙酰氯 以 吡啶 为溶剂， 反应 4.0h， 以80%的产率得到6-N-phenoxyacetyl-3',5'-O-(1,1,3,3-tetraisopropyldisiloxane-1,3-diyl)-2'-O-[2-(tetrazol-5-yl)ethyl]adenosine
  参考文献：
  名称：

  2' - O-（四唑-5-基）乙基修饰的寡核苷酸的合成与杂交特性

  摘要：

  2'- ø - （1 ħ -四唑-5-基）乙基腺苷用2'-合成ö -cyanoethyladenosine衍生物作为关键中间体。2'- O-（1H-四唑-5-基）乙基修饰物表现出令人感兴趣的性质，例如在质子化形式和去质子化形式之间四唑残基的结构变化。所述Ť米具有2'-各种寡核苷酸的实验ø - （1个ħ与未修饰的寡核苷酸相比，对-四唑-5-基）乙基修饰的腺苷显示出降低的杂交亲和力，其互补的寡聚脱氧核苷酸。在四唑部分的结构和理化性质的基础上，探讨了降低杂交亲和力的机理。

  DOI：

  10.1016/j.tet.2008.02.075

文献信息

• Synthesis and hybridization properties of 2′-O-(tetrazol-5-yl)ethyl-modified oligonucleotides
  作者：Hisao Saneyoshi、Keigo Tamaki、Akihiro Ohkubo、Kohji Seio、Mitsuo Sekine

  DOI：10.1016/j.tet.2008.02.075

  日期：2008.5

  l)ethyl modifications exhibited intriguing properties such as the change in the structure of the tetrazole residue between a protonated and a deprotonated form. The Tm experiments of various oligodeoxynucleotides having a 2′-O-(1H-tetrazol-5-yl)ethyl-modified adenosine showed reduced hybridization affinity in comparison to the unmodified oligonucleotides toward their complementary oligodeoxynucleotides

  2'- ø - （1 ħ -四唑-5-基）乙基腺苷用2'-合成ö -cyanoethyladenosine衍生物作为关键中间体。2'- O-（1H-四唑-5-基）乙基修饰物表现出令人感兴趣的性质，例如在质子化形式和去质子化形式之间四唑残基的结构变化。所述Ť米具有2'-各种寡核苷酸的实验ø - （1个ħ与未修饰的寡核苷酸相比，对-四唑-5-基）乙基修饰的腺苷显示出降低的杂交亲和力，其互补的寡聚脱氧核苷酸。在四唑部分的结构和理化性质的基础上，探讨了降低杂交亲和力的机理。