2-(3-nitro-4-aminophenyl)-6-(1-methyl-4-piperazinyl)benzimidazole | 23623-05-4

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 苯并咪唑类
• 英文名称: 2-(3-nitro-4-aminophenyl)-6-(1-methyl-4-piperazinyl)benzimidazole
• 英文别名: 4-[5'-(4'-methylpiperazin-1'-yl)benzimidazol-2'-yl]-2-nitroaniline；4-[6-(4-methylpiperazin-1-yl)-1H-1,3-benzodiazol-2-yl]-2-nitroaniline；2-(4-amino-3-nitrophenyl)-5-(4-methylpiperazinyl)-1H-benzimidazole；4-[6-(4-Methyl-1-piperazinyl)-1H-benzimidazol-2-yl]-2-nitrobenzenamine；4-[6-(4-methylpiperazin-1-yl)-1H-benzimidazol-2-yl]-2-nitroaniline
• CAS: 23623-05-4
• 化学式: C₁₈H₂₀N₆O₂
• 分子量: 352.396
• InChiKey: OPDPHVPWVJKBIO-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  2.8
• 重原子数：
  26
• 可旋转键数：
  2
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.28
• 拓扑面积：
  107
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  6

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  2-(3-nitro-4-aminophenyl)-6-(1-methyl-4-piperazinyl)benzimidazole 在 甲醇 、 氢气 、 sodium methylate 作用下， 反应 21.42h， 生成 2-(5'-(5''-(4'''-methylpiperazin-1'''-yl)benzimidazol-2''-yl)benzimidazol-2'-yl)-4-(trifluoromethyl)pyridine
  参考文献：
  名称：

  [EN] RADIOPROTECTOR COMPOUNDS AND METHODS
  [FR] COMPOSÉS RADIOPROTECTEURS ET PROCÉDÉS CORRESPONDANTS

  摘要：

  该发明涉及新化合物、其制备方法以及它们在保护生物材料免受辐射损伤（辐射防护）方面的用途。该发明的优选化合物为以下式（II）的化合物：其中W代表-N（R1R2），其中R1和R2不同时为氢，它们可以共同形成一个5、6或7元环结构，-NHN（R1R2）、NHR3N（R1R2）、-NHR3OR2、-N（R3）R3OR2、-N（R1）R3OR3OR3、OR3NR1R2、-OR3或W代表哌啶基、哌嗪基、吗啉基、硫代吗啉基或二氮杂环庚烷基，每种基可能被C1至C4烷基、C2至C4烯基、-N（CO）N（R1R2）、-N（CO）OR1、-N（CO）OR3OH、-（CO）NR1R2、-R3（CO）NR1R2、-R3OR1、-OR1、-N（R1R2）或-NH-取代；R1和R2相同或不同，选自氢、C1至C4烷基或C2至C4烯基；Z相同或不同，代表N或CH；Z'相同或不同，代表N或C；X代表CH、N或NH，其中当X为CH或N时为双键，当X为NH时为单键；X'代表N或NH，其中当X为CH或N时X'为NH，且X和X'不同，进一步当X'为N时为双键，当X'为NH时为单键；Q代表H、烷氧基、-NR1R2、F或Cl；当Z'为N时Q1不存在，当Z'为C时，Q1代表H、烷氧基、-NR1R2、F或Cl；A代表一个含有杂环N或O的五至十元单环或多环结构，位于邻位，该环包括可选的双键、取代基和/或其他杂原子及其药用可接受的衍生物。

  公开号：

  WO2011123890A1
• 作为产物：
  描述：

  4-乙酰氨苯甲腈 在 盐酸 、 硫酸 、 溶剂黄146 、 potassium nitrate 作用下， 以 乙醇 为溶剂， 反应 1.5h， 生成 2-(3-nitro-4-aminophenyl)-6-(1-methyl-4-piperazinyl)benzimidazole
  参考文献：
  名称：

  Design and Synthesis of New Benzimidazole–Carbazole Conjugates for the Stabilization of Human Telomeric DNA, Telomerase Inhibition, and Their Selective Action on Cancer Cells

  摘要：

  Cell-permeable small molecules that enhance the stability of the G-quadruplex (G4) DNA structures are currently among the most intensively pursued ligands for inhibition of the telomerase activity. Herein we report the design and syntheses of four novel benzimidazole-carbazole conjugates and demonstrate their high binding affinity to G4 DNA. S1 nuclease assay confirmed the ligand mediated G-quadruplex DNA protection. Additional evidence from Telomeric Repeat Amplification Protocol (TRAP-LIG) assay demonstrated efficient telomerase inhibition activity by the ligands. Two of the ligands showed IC50 values in the sub-micromolar range in the TRAP-LIG assay, which are the best among the benzimidazole derivatives reported so far. The ligands also exhibited cancer cell selective nuclear internalization, nuclear condensation, fragmentation, and eventually antiproliferative activity in long-term cell viability assays. Annexin V-FITC/PI staining assays confirm that the cell death induced by the ligands follows an apoptotic pathway. An insight into the mode of ligand binding was obtained from the molecular dynamics simulations.

  DOI：

  10.1021/jm500427n

文献信息

• [EN] A PROCESS FOR THE SYNTHESIS OF BISBENZIMIDAZOLES AND ITS DERIVATIONS<br/>[FR] PROCESSUS DE SYNTHÈSE DE BISBENZIMIDAZOLES ET DE SES DÉRIVÉS
  申请人：UNIV DELHI

  公开号：WO2004063170A1

  公开（公告）日：2004-07-29

  A process for the synthesis of bisbenzimidazoles and its derivations comprising; (i) reacting 5 chloroaniline with zinc dust and acetic anhydride to produce 5 chloroacetanilide; (ii) reacting 5 chloroacetanilide with HN03 to produce 2-nitro-5-chloroacetanilide; (ix) adding sodium methoxide to 2-nitro-5-ch1oroaniline; (x) heating 2-nitro-5-chloroaniline, methyl piperazine, anhydrous K2CO3 and Dimethyl formamide at 100-120°C produce a mixture which is cooled by pouring ice and is filtered to obtain 5-(4'-methylpiperazin-1'-yl)-2-nitroaniline; (xi) treating 5-(4'-methylpiperazin-l'yl)-2-nitroaniline with Pd/C to produce 2-amino-4-(4'-methylpiperazin-1'-yl) aniline; (xii) refluxing a mixture of 2-amino-4-(4'-methylpiperazin-1'yl) aniline and ethyl-4-amino-3-nitrobenzenecarboximidate hydrochloride in presence of ethanol/glacial acetic acid to produce 4-[5'-(4'-methylpiperazin-1'-yl) 15 benzimidazol-2'-yl)-2-nitroaniline; (xiii) treating a solution of 4-[5'-(4'-methylpiperazin-1'-yi) benzimidazol-2'-yl)-2-nitroaniline with palladium on carbon to yield 2-amino-4-[5'-(4'-Methylpiperazin-1'-yl)benzimidazol-2'-yl]aniline; (xiv) heating 2-amino-4-[5'-(4'-Methylpiperazin-1'-yl)benzimidazol-2'-yl]aniline and 3-4-dimethoxy benzaldehyde using nitrobenzene as a solvent at 110-150°C to produce (DMA) i.e 5-(4-methylpiperazin-1-yl)-2-[2'-(3,4-dimethoxyphenyl)-5'-benzimidazolyl] benzimidazole; (ix) heating 2-amino-4-[5'-(4'-Methylpiperazin-1'-yl) benzimidazol-2'-YI] aniline and 5-Formyl-[3-methoxy-4-hydroxy benzimidazole] using nitrobenzene at 110°C to 150°C in presence of argon to produce (TBZ) i.e 5-(4-methylpiperazine-1-yl)-2-[2' (2'-(4-hydroxy-3methoxyphenyl)5'benzimidazolyl) -5'- benzimidazolyl] benzimidazole.

  一种合成双苯并咪唑及其衍生物的方法，包括：(i)将5-氯苯胺与锌粉和乙酸酐反应，生成5-氯乙酰苯胺；(ii)将5-氯乙酰苯胺与硝酸反应，生成2-硝基-5-氯乙酰苯胺；(ix)将甲醇钠加入2-硝基-5-氯苯胺；(x)将2-硝基-5-氯苯胺、甲基哌嗪、无水K2CO3和二甲基甲酰胺加热至100-120°C，冷却后加入冰并过滤，得到5-(4'-甲基哌嗪基)-2-硝基苯胺；(xi)用Pd/C处理5-(4'-甲基哌嗪基)-2-硝基苯胺，得到2-氨基-4-(4'-甲基哌嗪基)苯胺；(xii)在乙醇/冰乙酸存在下，回流2-氨基-4-(4'-甲基哌嗪基)苯胺和乙酰基-4-氨基-3-硝基苯甲酰胺混合物，生成4-[5'-(4'-甲基哌嗪基)-2-硝基苯胺；(xiii)用碳载钯处理4-[5'-(4'-甲基哌嗪基)-2-硝基苯胺的溶液，得到2-氨基-4-[5'-(4'-甲基哌嗪基)苯并咪唑-2-基]苯胺；(xiv)将2-氨基-4-[5'-(4'-甲基哌嗪基)苯并咪唑-2-基]苯胺和3-4-二甲氧基苯甲醛在110-150°C下用硝基苯作溶剂加热，生成(DMA)即5-(4-甲基哌嗪基)-2-[2'-(3,4-二甲氧基苯基)-5'-苯并咪唑基]苯并咪唑；(ix)将2-氨基-4-[5'-(4'-甲基哌嗪基)苯并咪唑-2-基]苯胺和5-甲酰基-[3-甲氧基-4-羟基苯并咪唑]在110°C至150°C下用硝基苯在氩气存在下加热，生成(TBZ)即5-(4-甲基哌嗪基)-2-[2'-(2'-(4-羟基-3-甲氧基苯基)-5'-苯并咪唑基)-5'-苯并咪唑基]苯并咪唑。
• DNA-Directed Alkylating Agents. 6. Synthesis and Antitumor Activity of DNA Minor Groove-Targeted Aniline Mustard Analogs of Pibenzimol (Hoechst 33258)
  作者：G. Lance Gravatt、Bruce C. Baguley、William R. Wilson、William A. Denny

  DOI：10.1021/jm00051a010

  日期：1994.12

  alternative synthesis was developed, involving construction of the bisbenzimidazole from the mustard terminus, via Cu(2+)-promoted oxidative coupling of the mustard aldehydes with 3,4-diaminobenzonitrile to form the monobenzimidazoles, followed by a Pinner-type reaction and condensation with 4-(1-methyl-4-piperazinyl)-o-phenylenediamine. This process gives higher yields and pure products. The mustard analogues

  已合成了一系列的DNA小沟结合荧光团苯甲酰氮的芥末氮类似物（Hoechst 33258），并评估了其抗肿瘤活性。通过两个连续的Pinner型反应，从哌嗪基末端按常规方法构建双苯并咪唑环系统，使被2-甲基类似物污染的产物收率低，这证明很难分离。已开发出另一种合成方法，包括从芥末末端构建双苯并咪唑，通过芥末醛与3,4-二氨基苄腈的Cu（2+）促进的氧化偶联反应形成单苯并咪唑，然后进行Pinner型反应和缩合反应用4-（1-甲基-4-哌嗪基）-邻苯二胺。此过程可提供更高的产量和纯净的产品。芥末类似物表现出高脱敏因子（IC50AA8 / IC50 UV4），这是DNA烷化剂的典型特征。在整个同源序列中，细胞毒性的增加很大（85倍），这不能完全由芥子反应性的变化来解释，并且可能与芥子相对于DNA的方向改变有关，从而导致烷基化的方式不同。使用单剂量方案，苯甲酸对苯二酚本身（已在临床上作为抗癌药进行评估
• DNA Binding Compounds. VII. Synthesis, Characterization and DNA Binding Capacity of 1,2-Dicarba-closo-dodecaborane Bibenzimidazoles Related to the DNA Minor Groove Binder Hoechst 33258
  作者：Stuart A. Bateman、David P. Kelly、Jonathan M. White、Roger F. Martin

  DOI：10.1071/c98148

  日期：——

  A series of bibenzimidazole derivatives based on the known DNA minor groove binder Hoechst 33258 have been prepared to include a 1,2-dicarba-closo-dodecaborane cage for potential use in boron neutron capture therapy (BNCT). The carborane derivatives (5)(7) were chosen to reduce the steric inhibition of minor groove DNA binding displayed by the previously prepared carborane ligand (4). The synthesis and preliminary DNA binding studies of these bibenzimidazole derivatives are presented herein.

  以已知的 DNA 小沟粘合剂 Hoechst 33258 为基础，制备了一系列联苯并咪唑衍生物。 粘合剂 Hoechst 33258 的基础上制备了一系列联苯并咪唑衍生物，其中包括一个 1,2-dicarba-closo-dodecaborane 笼，可用于 硼中子俘获疗法（BNCT）。选择硼烷衍生物 (5)(7) 的选择是为了减少之前制备的硼烷衍生物（5）（7）对小沟 DNA 结合的立体抑制作用。 的立体抑制作用。这些双硼烷衍生物的合成和 DNA 结合的初步研究。 在此介绍。
• 二-(苯并咪唑)-1,2,3-三唑衍生物及其制备和在炎症性皮肤病中的应用
  申请人：中南大学湘雅二医院

  公开号：CN113004253B

  公开（公告）日：2022-05-10

  本发明属于药物小分子技术领域，具体公开了一种全新的二‑(苯并咪唑)‑1,2,3‑三唑衍生物及其制备和应用。本发明研究发现，所述的全新的化合物，在炎症性皮肤病方面具有优异的药效、较低的毒副作用，在炎症性皮肤病的药物开发方面具有良好的应用前景。
• RADIOPROTECTOR COMPOUNDS AND METHODS
  申请人：Martin Roger Francis

  公开号：US20130109678A1

  公开（公告）日：2013-05-02

  The invention relates to novel compounds, processes for their preparation and their use in protecting biological materials from radiation damage (radioprotection). Preferred compounds of the invention are those of Formula II, as follows: wherein W represents —N(R 1 R 2 ) where R 1 and R 2 are not both hydrogen and where they may together form a 5, 6 or 7 membered ring structure, —NHN(R 1 R 2 ), —NHR 3 N(R 1 R 2 ), —NHR 3 OR 2 , —N(R 3 )R 3 OR 2 , —N(R 1 )R 3 OR 3 OR 3 , —OR 3 NR 1 R 2 , —OR 3 or W represents piperidyl, piperazinyl, morpholinyl, thiomorpholinyl or diazepanyl each of which may be optionally substituted by C 1 to C 4 alkyl, C 2 to C 4 alkenyl, —N(CO)N(R 1 R 2 ), —N(CO)OR 1 , —N(CO)OR 3 OH, —(CO)NR 1 R 2 , —R 3 (CO)NR 1 R 2 , —R 3 OR 1 , —OR 1 , —N(R 1 R 2 ) or —NH—; R 1 and R 2 are the same or different and are selected from hydrogen, C 1 to C 4 alkyl or C 2 to C 4 alkenyl; R 3 is a C 1 to C 4 alkyl or C 2 to C 4 alkenyl group or chain; Z is the same or different and represents N or CH; Z′ is the same or different and represents N or C; X represents CH, N or NH, where is a double bond when X is CH or N and a single bond when X is NH; X′ represents N or NH, wherein when X is CH or NX′ is NH and wherein X and X′ are different and further where is a double bond when X′ is N and a single bond when X′ is NH; Q represents H, alkoxyl, —NR 1 R 2 , F or Cl; Q 1 is absent when Z′ is N and when Z′ is C it represents H, alkoxyl, —NR 1 R 2 , F or Cl; A represents a five to ten membered single or multiple ring structure with heterocyclic N or O located at the ortho position, said ring including optional double bonds, substitutions and/or other heteroatoms and pharmaceutically acceptable derivatives thereof.

  本发明涉及新化合物、其制备方法及其在保护生物材料免受辐射损伤（辐射防护）方面的用途。本发明的首选化合物是式 II 所示的化合物，其结构如下：其中，W 代表 —N(R1R2)，其中 R1 和 R2 不全为氢，且它们可以一起形成 5、6 或 7 成员环结构，—NHN(R1R2)、—NHR3N(R1R2)、—NHR3OR2、—N(R3)R3OR2、—N(R1)R3OR3OR3、—OR3NR1R2、—OR3 或 W 代表哌啶基、哌嗪基、吗啉基、硫代吗啉基或二氮杂环庚烷基，每个基团可以选择地被 C1 到 C4 烷基、C2 到 C4 烯基、—N(CO)N(R1R2)、—N(CO)OR1、—N(CO)OR3OH、—(CO)NR1R2、—R3(CO)NR1R2、—R3OR1、—OR1、—N(R1R2) 或 —NH— 取代；R1 和 R2 相同或不同，选择自氢、C1 到 C4 烷基或 C2 到 C4 烯基；R3 是 C1 到 C4 烷基或 C2 到 C4 烯基基团或链；Z 相同或不同，代表 N 或 CH；Z′ 相同或不同，代表 N 或 C；X 代表 CH、N 或 NH，其中当 X 是 CH 或 N 时为双键，当 X 是 NH 时为单键；X′ 代表 N 或 NH，其中当 X 是 CH 或 N 时，X′ 为 NH，且 X 和 X′ 不同，进一步地，当 X′ 为 N 时为双键，当 X′ 为 NH 时为单键；Q 代表 H、烷氧基、—NR1R2、F 或 Cl；当 Z′ 为 N 时，Q1 不存在，当 Z′ 为 C 时，Q1 代表 H、烷氧基、—NR1R2、F 或 Cl；A 代表具有杂环 N 或 O 的五到十成员单环或多环结构，该环在邻位位置包括可选的双键、取代基和/或其他杂原子，以及其药学上可接受的衍生物。