N-tert-butyloxycarbonyl-L-α-aminoadipic acid α-p-methoxybenzyl ester | 790244-47-2

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 英文名称: N-tert-butyloxycarbonyl-L-α-aminoadipic acid α-p-methoxybenzyl ester
• 英文别名: (5S)-6-[(4-methoxyphenyl)methoxy]-5-[(2-methylpropan-2-yl)oxycarbonylamino]-6-oxohexanoic acid
• CAS: 790244-47-2
• 化学式: C₁₉H₂₇NO₇
• 分子量: 381.426
• InChiKey: OUUTWLNAIBCOAK-HNNXBMFYSA-N

物化性质

• 沸点：
  559.7±50.0 °C(Predicted)
• 密度：
  1.183±0.06 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  2.6
• 重原子数：
  27
• 可旋转键数：
  12
• 环数：
  1.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.53
• 拓扑面积：
  111
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  7

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  N-tert-butyloxycarbonyl-L-α-aminoadipic acid α-p-methoxybenzyl ester 在 水 、 sodium sulfate 、 2-乙氧基-1-乙氧碳酰基-1,2-二氢喹啉 、 三乙胺 作用下， 以 四氢呋喃 、 二氯甲烷 为溶剂， 反应 22.5h， 生成
  参考文献：
  名称：

  晶体学研究异青霉素N合酶与不饱和底物类似物的反应。

  摘要：

  异青霉素N合酶（IPNS）催化将线性三肽δ-（L-α-氨基己二酰基）-L-半胱氨酰-D-缬氨酸（ACV）转化为异青霉素N（IPN），这是生物合成β-内酰胺抗生素的关键步骤。先前已将不饱和底物类似物δ-（L-α-氨基己二酰基）-L-半胱氨酰-D-乙烯基甘氨酸（ACvG）与IPNS一起温育，并分离出单一产物，形成了2-α-羟甲基异青霉素N（HMPen），通过单加氧酶反应模式。ACvG现在已经用IPNS结晶，厌氧IPNS：Fe（II）：ACvG络合物的结构确定为1.15 A分辨率。此外，通过将厌氧生长的晶体暴露于高压氧气中，以1.60A的分辨率获得了对应于双环产物HMPen的结构。根据这些以及其他IPNS结构，以及相关双加氧酶的最新发展，对由ACvG形成HMPen的[2 + 2]环加成机理进行了修订，并提出了逐步的自由基机理。修订后的机制与观察到的转化立体定向保持一致，但更适合于活性位铁原子周围配位几何的明显约束。

  DOI：

  10.1039/b212270g
• 作为产物：
  描述：

  L-2-氨基己二酸 在 三乙胺 、 sodium hydroxide 作用下， 以 水 、 N,N-二甲基甲酰胺 、 叔丁醇 为溶剂， 生成 N-tert-butyloxycarbonyl-L-α-aminoadipic acid α-p-methoxybenzyl ester
  参考文献：
  名称：

  异青霉素N合酶与同源底物类似物δ-（L-α-氨基己二酰基）-L-高半胱氨酸基-D-Xaa的相互作用（通过蛋白质晶体学表征）

  摘要：

  宽松：IPNS催化青霉素生物合成的关键步骤。包含L-高半胱氨酸代替天然底物L-半胱氨酸残基的底物类似物不会转化为双环产物。具有两个这样的类似物的IPNS配合物的晶体结构表明，当这些类似物与IPNS结合时，额外的CH 2单元可提供相当的构象自由度。

  DOI：

  10.1002/cbic.201200728

文献信息

• Isopenicillin N Synthase Mediates Thiolate Oxidation to Sulfenate in a Depsipeptide Substrate Analogue: Implications for Oxygen Binding and a Link to Nitrile Hydratase?
  作者：Wei Ge、Ian J. Clifton、Jeanette E. Stok、Robert M. Adlington、Jack E. Baldwin、Peter J. Rutledge

  DOI：10.1021/ja8005397

  日期：2008.8.1

  Isopenicillin N synthase (IPNS) is a nonheme iron oxidase that catalyzes the central step in the biosynthesis of beta-lactam antibiotics: oxidative cyclization of the linear tripeptide delta-L-alpha-aminoadipoyl-L-cysteinyl-D-valine (ACV) to isopenicillin N (IPN). The ACV analogue delta-L-alpha-aminoadipoyl-L-cysteine (1-(S)-carboxy-2-thiomethyl)ethyl ester (ACOmC) has been synthesized as a mechanistic

  异青霉素 N 合酶 (IPNS) 是一种非血红素铁氧化酶，可催化 β-内酰胺抗生素生物合成的核心步骤：线性三肽 delta-L-α-氨基己二酰-L-半胱氨酰-D-缬氨酸 (ACV) 的氧化环化异青霉素 N (IPN)。ACV 类似物 delta-L-α-氨基己二酰-L-半胱氨酸（1-（S）-羧基-2-硫甲基）乙酯（ACOmC）已合成为 IPNS 催化的机械探针，并用酶结晶。厌氧 IPNS/Fe(II)/ACOmC 复合物的晶体结构确定为 1.80 A 分辨率，揭示了高度拥挤的活性位点区域。通过将这些厌氧生长的晶体暴露在高压氧气中，观察到了意想不到的次磺酸盐产物，在 IPNS 活性位点内与铁络合。提出了形成次磺酸盐-铁络合物的机制，并且似乎 ACOmC 在其与 IPNS 反应的最早阶段遵循不同的反应途径。因此，似乎氧（共底物）在与之前 IPNS 研究中观察到的不同的位点结合，在此过程中从铁中置换了水配体。以前在
• The crystal structure of an<scp>lll</scp>-configured depsipeptide substrate analogue bound to isopenicillin N synthase
  作者：Wei Ge、Ian J. Clifton、Jeanette E. Stok、Robert M. Adlington、Jack E. Baldwin、Peter J. Rutledge

  DOI：10.1039/b910170e

  日期：——

  Isopenicillin N synthase (IPNS) is a non-heme iron(II) oxidase, which catalyses the biosynthesis of isopenicillin N (IPN) from the tripeptide δ-L-α-aminoadipoyl-L-cysteinyl-D-valine (LLD-ACV) in a remarkable oxidative bicyclisation reaction. The natural substrate for IPNS is the LLD-configured tripeptide. LLL-ACV is not turned over by the enzyme, but inhibits turnover of the LLD-tripeptide. The mechanism by which this inhibition takes place is not fully understood. Recent studies have employed a range of LLD-configured depsipeptide substrate analogues in crystallographic studies to probe events preceding β-lactam closure in the IPNS reaction cycle. Herein, we report the first crystal structure of IPNS in complex with an LLL-configured depsipeptide analogue, δ-L-α-aminoadipoyl-L-cysteine (1-(R)-carboxy-2-thiomethyl)ethyl ester (LLL-ACOmC). This report describes the crystal structure of the IPNS:Fe(II):LLL-ACOmC complex to 2.0 Å resolution, and discusses attempts to oxygenate this complex at high pressure in order to probe the mechanism by which LLL-configured substrates inhibit IPNS catalysis.

  异青霉素 N 合酶 (IPNS) 是一种非血红素铁 (II) 氧化酶，可催化三肽 δ-L-α-氨基己二酰-L-半胱氨酰-D-缬氨酸 (LLD-ACV) 生物合成异青霉素 N (IPN)发生显着的氧化双环化反应。 IPNS 的天然底物是 LLD 配置的三肽。 LLL-ACV 不会被酶转化，但会抑制 LLD-三肽的转化。这种抑制发生的机制尚不完全清楚。最近的研究在晶体学研究中采用了一系列 LLD 配置的缩酚肽底物类似物来探测 IPNS 反应循环中 β-内酰胺闭合之前的事件。在此，我们报道了IPNS与LLL配置的缩酚肽类似物δ-L-α-氨基己二酰-L-半胱氨酸(1-(R)-羧基-2-硫甲基)乙酯(LLL-ACOmC)复合物的第一个晶体结构）。该报告以 2.0 Å 分辨率描述了 IPNS:Fe(II):LLL-ACOmC 复合物的晶体结构，并讨论了在高压下对该复合物进行氧化的尝试，以探讨 LLL 配置底物抑制 IPNS 催化的机制。
• The Interaction of Isopenicillin N Synthase with Homologated Substrate Analogues δ-(<scp>L</scp>-α-Aminoadipoyl)-<scp>L</scp>-homocysteinyl-<scp>D</scp>-Xaa Characterised by Protein Crystallography
  作者：Adam Daruzzaman、Ian J. Clifton、Robert M. Adlington、Jack E. Baldwin、Peter J. Rutledge

  DOI：10.1002/cbic.201200728

  日期：2013.3.18

  Loose fit: IPNS catalyses the central step in penicillin biosynthesis. Substrate analogues containing L‐homocysteine in place of the natural substrate's L‐cysteine residue are not converted into bicyclic products. Crystal structures for IPNS complexes with two such analogues reveal that the additional CH2 unit affords considerable conformational freedom when these analogues bind to IPNS.

  宽松：IPNS催化青霉素生物合成的关键步骤。包含L-高半胱氨酸代替天然底物L-半胱氨酸残基的底物类似物不会转化为双环产物。具有两个这样的类似物的IPNS配合物的晶体结构表明，当这些类似物与IPNS结合时，额外的CH 2单元可提供相当的构象自由度。
• Crystallographic studies on the reaction of isopenicillin N synthase with an unsaturated substrate analogue
  作者：Jonathan M. Elkins、Peter J. Rutledge、Nicolai I. Burzlaff、Ian J. Clifton、Robert M. Adlington、Peter L. Roach、Jack E. Baldwin

  DOI：10.1039/b212270g

  日期：2003.4.23

  Isopenicillin N synthase (IPNS) catalyses conversion of the linear tripeptide delta-(L-alpha-aminoadipoyl)-L-cysteinyl-D-valine (ACV) to isopenicillin N (IPN), the central step in biosynthesis of the beta-lactam antibiotics. The unsaturated substrate analogue delta-(L-alpha-aminoadipoyl)-L-cysteinyl-D-vinylglycine (ACvG) has previously been incubated with IPNS and single product was isolated, a 2-alpha-hydroxymethyl

  异青霉素N合酶（IPNS）催化将线性三肽δ-（L-α-氨基己二酰基）-L-半胱氨酰-D-缬氨酸（ACV）转化为异青霉素N（IPN），这是生物合成β-内酰胺抗生素的关键步骤。先前已将不饱和底物类似物δ-（L-α-氨基己二酰基）-L-半胱氨酰-D-乙烯基甘氨酸（ACvG）与IPNS一起温育，并分离出单一产物，形成了2-α-羟甲基异青霉素N（HMPen），通过单加氧酶反应模式。ACvG现在已经用IPNS结晶，厌氧IPNS：Fe（II）：ACvG络合物的结构确定为1.15 A分辨率。此外，通过将厌氧生长的晶体暴露于高压氧气中，以1.60A的分辨率获得了对应于双环产物HMPen的结构。根据这些以及其他IPNS结构，以及相关双加氧酶的最新发展，对由ACvG形成HMPen的[2 + 2]环加成机理进行了修订，并提出了逐步的自由基机理。修订后的机制与观察到的转化立体定向保持一致，但更适合于活性位铁原子周围配位几何的明显约束。