4-amino-N-[(2S)-6-amino-2-[[2-[2-aminoethyl-[3-(diaminomethylideneamino)propanoyl]amino]acetyl]amino]hexyl]-N-[2-[[(2S)-1-[(2-amino-2-oxoethyl)-[3-(diaminomethylideneamino)propanoyl]amino]-5-(diaminomethylideneamino)pentan-2-yl]amino]-2-oxoethyl]butanamide | 1338321-68-8

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 肽模拟物
• 英文名称: 4-amino-N-[(2S)-6-amino-2-[[2-[2-aminoethyl-[3-(diaminomethylideneamino)propanoyl]amino]acetyl]amino]hexyl]-N-[2-[[(2S)-1-[(2-amino-2-oxoethyl)-[3-(diaminomethylideneamino)propanoyl]amino]-5-(diaminomethylideneamino)pentan-2-yl]amino]-2-oxoethyl]butanamide
• CAS: 1338321-68-8
• 化学式: C₃₂H₆₆N₁₈O₆
• 分子量: 798.993
• InChiKey: UGCLUCBOOBTWOT-GOTSBHOMSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -9
• 重原子数：
  56
• 可旋转键数：
  31
• 环数：
  0.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.72
• 拓扑面积：
  434
• 氢给体数：
  12
• 氢受体数：
  12

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  2-[3-[bis[(2-methylpropan-2-yl)oxycarbonylamino]methylideneamino]propanoyl-[2-(9H-fluoren-9-ylmethoxycarbonylamino)ethyl]amino]acetic acid 、 2-[[(2S)-2-(9H-fluoren-9-ylmethoxycarbonylamino)-6-[(2-methylpropan-2-yl)oxycarbonylamino]hexyl]-[4-[(2-methylpropan-2-yl)oxycarbonylamino]butanoyl]amino]acetic acid 、 2-[[(2S)-5-[[amino-[(2,2,4,6,7-pentamethyl-3H-1-benzofuran-5-yl)sulfonylamino]methylidene]amino]-2-(9H-fluoren-9-ylmethoxycarbonylamino)pentyl]-[3-[bis[(2-methylpropan-2-yl)oxycarbonylamino]methylideneamino]propanoyl]amino]acetic acid 在 N,N'-二异丙基碳二亚胺 、 哌啶 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 4.0h， 生成 4-amino-N-[(2S)-6-amino-2-[[2-[2-aminoethyl-[3-(diaminomethylideneamino)propanoyl]amino]acetyl]amino]hexyl]-N-[2-[[(2S)-1-[(2-amino-2-oxoethyl)-[3-(diaminomethylideneamino)propanoyl]amino]-5-(diaminomethylideneamino)pentan-2-yl]amino]-2-oxoethyl]butanamide
  参考文献：
  名称：

  γ-AApeptides bind to RNA by mimicking RNA-binding proteins

  摘要：

  蛋白质与RNA之间的相互作用对许多细胞过程至关重要，包括RNA的转录和加工、翻译以及病毒感染。我们在这里报道一种γ-AA肽，它能够模拟HIV-1 Tat蛋白，并以纳摩尔亲和力结合HIV和BIV的TAR RNA，这一亲和力与Tat的RNA结合片段（氨基酸49-58）相当。该相互作用能抵抗大量tRNA的存在。由于对蛋白水解的抵抗以及无限的多样化潜力，γ-AA肽可能会成为调节RNA-蛋白相互作用的新型肽模仿物。

  DOI：

  10.1039/c1ob05738c