1-(6,7-dideoxy-2,3-O-isopropylidene-α-L-talo-hept-6-ynofuranosyl)uracil | 928034-48-4

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 二嗪类
• 英文名称: 1-(6,7-dideoxy-2,3-O-isopropylidene-α-L-talo-hept-6-ynofuranosyl)uracil
• 英文别名: 1-(6,7-dideoxy-2,3-O-isopropylidene-α-L-talo-hept-6-ynofuranosyl)-2,4(1H,3H)-pyrimidinedione
• CAS: 928034-48-4
• 化学式: C₁₄H₁₆N₂O₆
• 分子量: 308.291
• InChiKey: DPRDHTREVASPDE-FRNCOOQWSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -1.05
• 重原子数：
  22.0
• 可旋转键数：
  2.0
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.57
• 拓扑面积：
  102.78
• 氢给体数：
  2.0
• 氢受体数：
  7.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  1-(6,7-dideoxy-2,3-O-isopropylidene-α-L-talo-hept-6-ynofuranosyl)uracil 在 盐酸 、 sodium azide 、 copper(ll) sulfate pentahydrate 、 水 、 碳酸氢钠 、 sodium ascorbate 、 盐酸-N-乙基-Nˊ-(3-二甲氨基丙基)碳二亚胺 、 三乙胺 、 三氟乙酸 、 三甲基膦 作用下， 以 四氢呋喃 、 甲醇 、 二氯甲烷 、 水 、 N,N-二甲基甲酰胺 、 叔丁醇 为溶剂， 反应 55.0h， 生成
  参考文献：
  名称：

  受天然产物启发的含尿苷库的快速合成。

  摘要：

  描述了使用液相平行合成法制备受天然产物启发的核苷类似物。开发了包含炔烃和 N 保护氨基部分的关键中间体，以允许使用点击化学和脲或酰胺键形成进一步的骨架和取代基多样性。使用固相萃取完成快速纯化。获得的文库包含 80 个包含两个多样性位置和一个手性中心的分子，每个分子都以良好的纯度和可接受的总收率有效制备。还进行了细菌形态学研究。

  DOI：

  10.1021/acscombsci.0c00011
• 作为产物：
  描述：

  1-[6,7-dideoxy-2,3-O-isopropylidene-7-C-(triethylsilyl)-β-D-allo-hept-6-ynofuranosyl]uracil 在 偶氮二甲酸二异丙酯 、 三苯基膦 、 甲醇 、 水 、 sodium hydroxide 作用下， 以 四氢呋喃 为溶剂， 反应 5.0h， 以87%的产率得到1-(6,7-dideoxy-2,3-O-isopropylidene-α-L-talo-hept-6-ynofuranosyl)uracil
  参考文献：
  名称：

  受天然产物启发的含尿苷库的快速合成。

  摘要：

  描述了使用液相平行合成法制备受天然产物启发的核苷类似物。开发了包含炔烃和 N 保护氨基部分的关键中间体，以允许使用点击化学和脲或酰胺键形成进一步的骨架和取代基多样性。使用固相萃取完成快速纯化。获得的文库包含 80 个包含两个多样性位置和一个手性中心的分子，每个分子都以良好的纯度和可接受的总收率有效制备。还进行了细菌形态学研究。

  DOI：

  10.1021/acscombsci.0c00011

文献信息

• 5′-Methylene-triazole-substituted-aminoribosyl uridines as MraY inhibitors: synthesis, biological evaluation and molecular modeling
  作者：Mickaël J. Fer、Ahmed Bouhss、Mariana Patrão、Laurent Le Corre、Nicolas Pietrancosta、Ana Amoroso、Bernard Joris、Dominique Mengin-Lecreulx、Sandrine Calvet-Vitale、Christine Gravier-Pelletier

  DOI：10.1039/c5ob00707k

  日期：——

  Two families of compounds were synthesized from a unique epoxide which was regioselectively opened by acetylide ions (for compounds II) or azide ions (for compounds III). Sequential diastereoselective glycosylation with a ribosyl fluoride derivative, Cu(I)-catalyzed azide–alkyne cycloaddition (CuAAC) with various complementary azide and alkyne partners afforded the targeted compounds after final deprotection

  描述了5'-亚甲基-[1,4]-三唑取代的氨基核糖基尿苷的直接合成。由独特的环氧化物合成了两族化合物，该环氧化物被乙炔离子（对于化合物II）或叠氮化物离子（对于化合物III）区域选择性地打开。与核糖基氟化物衍生物，Cu（I）催化的叠氮化物-炔烃环加成（CuAAC）以及各种互补的叠氮化物和炔烃配偶体相继进行非对映选择性糖基化反应，最终脱保护后即可得到目标化合物。所得的16种化合物的生物活性以及先前报道的14种化合物的生物活性I评估缺少5'亚甲基的MraY转移酶活性。在30种测试化合物中，有18种化合物显示出MraY抑制，IC 50为15至150μM。进行了分子建模研究，以合理化所观察到的结构-活性关系（SAR），这使我们能够将最有效化合物的活性与涉及MraY AA的Leu191的相互作用相关联。还评估了抗菌活性，七种化合物对革兰氏阳性细菌病原体表现出良好的活性，MIC范围为8至32μgmL
• Oligonucleotide Analogues with Integrated Bases and Backbone. Part 13
  作者：Xiaomin Zhang、Bruno Bernet、Andrea Vasella

  DOI：10.1002/hlca.200690259

  日期：2006.12

  The self-complementary UA and AU dinucleotide analogues 41–45, 47, 48, and 51–60 were prepared by Sonogashira coupling of 6-iodouridines with C(5′)-ethynylated adenosines and of 8-iodoadenosines with C(5′)-ethynylated uridines. The dinucleotide analogues associate in CDCl3 solution. The C(6/I)-unsubstituted AU dimers 51 and 54 prefer an anti-oriented uracilyl group and form stretched linear duplexes

  自身互补UA和AU二核苷酸类似物41 - 45，47，48，和51 - 60通过制备的Sonogashira与6- iodouridines耦合C（5'） -ethynylated腺苷和与8- iodoadenosines C（5'） -乙炔化尿苷。二核苷酸类似物在CDCl 3溶液中缔合。的C（6 / I） -未被取代的AU二聚体51和54更喜欢抗拉伸线性双链体取向uracilyl组和形式。UA炔丙醇41和43 – 45具有持久的分子内O（5'/ I）H⋅⋅⋅N（3 / I）H-键，因此，一个顺式取向的腺嘌呤基和GT -或TG取向乙炔基部分; 它们形成波纹状线性双工。所有其他的二聚体形成特征的循环复式顺式取向的核碱基。乙炔基部分的首选方向（C（4'），C（5'）扭转角）定义了gg和乙炔基超过O（4'/ I）的构象。所述UA二聚体42,47，和48形式的Watson-Crick氢键，该AU二聚体56和58
• Design, synthesis and biological evaluation of simplified analogues of MraY inhibitory natural product with rigid scaffold
  作者：Kazuhiro Okamoto、Aoi Ishikawa、Ryotaro Okawa、Kazuki Yamamoto、Toyotaka Sato、Shin-ichi Yokota、Kazuhiro Chiba、Satoshi Ichikawa

  DOI：10.1016/j.bmc.2021.116556

  日期：2022.2

  chemical structures are rather complex. This study investigated the simplification of these natural products by structure-based drug design, synthesis, and biological evaluation. We developed a simplified rigid scaffold with an arylalkyne moiety, which shows sub-micromolar MraY inhibitory activity. The scaffold is suitable for further investigating the structure–activity relationship by virtue of our

  Muraymycins 和 caprazamycins 是 MraY 的强抑制剂，MraY 负责肽聚糖的生物合成。虽然它们是有前途的抗菌剂，具有新颖的作用方式，但它们的化学结构相当复杂。本研究通过基于结构的药物设计、合成和生物学评价研究了这些天然产物的简化。我们开发了一种带有芳基炔部分的简化刚性支架，其显示出亚微摩尔MraY抑制活性。该支架适合通过我们的合成策略进一步研究构效关系，其中感兴趣的取代基被安装在合成的最后阶段。该支架显示出进一步用于优化 MraY 抑制和抗菌活性的潜力。
• Toward Analogues of MraY Natural Inhibitors: Synthesis of 5′-Triazole-Substituted-Aminoribosyl Uridines Through a Cu-Catalyzed Azide–Alkyne Cycloaddition
  作者：Mickaël J. Fer、Samir Olatunji、Ahmed Bouhss、Sandrine Calvet-Vitale、Christine Gravier-Pelletier

  DOI：10.1021/jo4014035

  日期：2013.10.18

  A straightforward strategy for the synthesis of triazole-containing MraY inhibitors has been developed. It involves the sequential introduction of a terminal alkyne at the S' position of an uridine derivative and O-glycosylation with a protected aminoribose leading to an elaborated alkyne scaffold. An efficient Cu (1)-catalyzed azide-alkyne cycloaddition (CuAAC) allowed the introduction of chemical diversity toward a small library of inhibitors.