LU-001i | 1620107-60-9

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 英文名称: LU-001i
• 英文别名: (2S)-1-[(2S)-2-[(2-azidoacetyl)amino]propanoyl]-N-[(2S)-1-[[(2S)-3-cyclohexyl-1-[(2R)-2-methyloxiran-2-yl]-1-oxopropan-2-yl]amino]-1-oxohexan-2-yl]-4,4-difluoropyrrolidine-2-carboxamide
• CAS: 1620107-60-9
• 化学式: C₂₈H₄₃F₂N₇O₆
• 分子量: 611.69
• InChiKey: BYGWQGGWZMNGGA-MDEFBCHOSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  4.7
• 重原子数：
  43
• 可旋转键数：
  15
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.82
• 拓扑面积：
  152
• 氢给体数：
  3
• 氢受体数：
  10

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  Cy5-alkyne 、 LU-001i 在 copper(ll) sulfate pentahydrate 、 sodium ascorbate 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 以75%的产率得到Cy5-LU001i
  参考文献：
  名称：

  基于蛋白酶体亚基选择性活性的探针报告天然聚丙烯酰胺凝胶电泳荧光共振能量转移测定中蛋白酶体核心颗粒组成

  摘要：

  大多数哺乳动物组织包含单一的蛋白酶体种类：组成型蛋白酶体。除了组成型蛋白酶体催化活性（β1c、β2c、β5c）之外，能够表达三种同源活​​性 β1i、β2i 和 β5i 的组织可能包含许多不同的蛋白酶体颗粒：免疫蛋白酶体（由 β1i、β2i 和 β5i 组成）和混合蛋白酶体蛋白酶体含有这些活性的混合物。这项工作描述了新的基于亚基选择性活性的探针的开发及其在基于活性的蛋白质分析测定中的使用，该测定允许检测各种蛋白酶体颗粒。组织提取物用带有不同荧光团和亚基特异性抑制剂的亚基特异性探针进行处理。样品通过天然聚丙烯酰胺凝胶电泳分离，

  DOI：

  10.1021/jacs.6b04207
• 作为产物：
  描述：

  N-Boc-4,4-二氟-L-脯氨酸 在 盐酸 、 亚硝酸特丁酯 、 2-(6-chloro-1H-benzotriazole-1-yl)21,1,3,3-tetramethylaminiumhexafluorophosphate 、 一水合肼 、 N,N-二异丙基乙胺 作用下， 以 1,4-二氧六环 、 甲醇 、 二氯甲烷 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 8.0h， 生成 LU-001i
  参考文献：
  名称：

  人免疫蛋白酶体β1i或β5i特异性抑制剂的基于结构的设计

  摘要：

  哺乳动物基因组编码7个催化蛋白酶体亚基，分别是β1c，β2c，β5c（组装成20S组成的蛋白酶体核心颗粒），β1i，β2i，β5i（并入免疫蛋白酶体）和胸腺蛋白酶体特异性亚基β5t。在过去的几十年中，广泛的研究产生了许多有效的蛋白酶体抑制剂，包括目前临床上用于治疗多发性骨髓瘤和套细胞淋巴瘤的化合物。有选择性靶向β1c/β1i，β2c/β2i或β5c/β5i组合的蛋白酶体抑制剂，但对于单个蛋白酶体活性真正选择性的配体却很少。在这项工作中，我们报道了在选择性和/或效能方面优于现有铅的细胞可渗透性β1i和β5i选择性抑制剂的开发。

  DOI：

  10.1021/jm500716s

文献信息

• Two‐Step Bioorthogonal Activity‐Based Protein Profiling of Individual Human Proteasome Catalytic Sites
  作者：Bo‐Tao Xin、Christofer Espinal、Gerjan Bruin、Dmitri V. Filippov、Gijsbert A. Marel、Bogdan I. Florea、Herman S. Overkleeft

  DOI：10.1002/cbic.201900551

  日期：2020.1.15

  developed for β1i, β2i, β5c, and β5i proved to be useful two-step ABPs that effectively label their developed proteasome subunits in both Raji cell extracts and living Raji cells through inverse-electron-demand Diels-Alder (iEDDA) ligation. The compound developed for β1c proved incapable of penetrating the cell membrane, but effectively labels β1c in vitro. The compound developed for β2c proved not

  生物正交化学可以选择性修饰复杂生物样品中的生物分子。这种方法的一种应用是基于两步活动的基于蛋白质的蛋白质谱分析（ABPP），在使用荧光或生物素化探针的直接ABPP无效的情况下，这种方法特别有吸引力。本文中，我们描述了一组降冰片烯修饰的，基于机理的蛋白酶体抑制剂，旨在对人组成型蛋白酶体和免疫蛋白酶体的六个催化位点中的每一个都具有选择性。针对β1i，β2i，β5c和β5i开发的探针被证明是有用的两步ABP，可通过反电子需求Diels-Alder（iEDDA）连接有效地标记Raji细胞提取物和活Raji细胞中已发育的蛋白酶体亚基。为β1c开发的化合物被证明无法穿透细胞膜，但可在体外有效标记β1c。为β2c开发的化合物证明没有选择性，但在体外和原位通过叠氮化物-炔炔单击连接化学方法证明其含叠氮化物的类似物LU-002c在标记β2c方面均有效。总的来说，我们的结果有助于增加蛋白酶体活性工具的清单，其