6-叠氮基-6-脱氧-L-半乳糖 | 70932-63-7

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机氧化合物
• 中文名称: 6-叠氮基-6-脱氧-L-半乳糖
• 英文名称: 6-azido-6-deoxy-L-galactose
• 英文别名: 6-azido-L-fucose；(2S,3R,4R,5S)-6-azido-2,3,4,5-tetrahydroxyhexanal
• CAS: 70932-63-7
• 化学式: C₆H₁₁N₃O₅
• 分子量: 205.17
• InChiKey: HEYJIJWKSGKYTQ-KCDKBNATSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -1.8
• 重原子数：
  14
• 可旋转键数：
  6
• 环数：
  0.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.83
• 拓扑面积：
  112
• 氢给体数：
  4
• 氢受体数：
  7

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  6-叠氮基-6-脱氧-L-半乳糖 、 苯甲酰氯 在 吡啶 作用下， 反应 24.0h， 以1.90 g的产率得到6-azide-1,2,3,4-tetra-O-benzoyl-6-deoxy-β-L-galactopyranose
  参考文献：
  名称：

  基于FRET的人类岩藻糖基转移酶活性的直接和连续监测：从丰富的D-半乳糖高效合成通用的GDP-L-岩藻糖衍生物。

  摘要：

  我们已经开发了一种简便且通用的协议，用于通过使用荧光能量共振转移（FRET）连续监测人岩藻糖基转移酶的活性，并探索了其在抑制剂筛选测定中的可行性。具有荧光探针的便捷糖核苷酸6-脱氧-6-N-（2-萘-2-基乙酰胺）-β-L-吡喃半乳糖-1-基鸟苷5'-二磷酸二钠盐（1），由天然丰富的D-吡喃半乳糖通过关键中间体6-叠氮化物-1,2,3,4-四-O-苯甲酰基-6-脱氧-β-L-吡喃半乳糖有效地合成（10）。结果表明，糖基供体1和丹磺化受体底物唾液酸-α2,3-LacNAc衍生物（2）的联合使用使我们能够对唾液酸化路易斯的产生进行高度敏感，直接和连续的体外监测X（SLe x），它由人α-1,3-岩藻糖基转移酶VI（FUT-VI）催化。动力学分析表明，化合物1是检测人FUT-VI活性的优良供体底物（KM = 0.94 microM和Vmax = 0.14 microM min（-1））。据我们所

  DOI：

  10.1002/chem.200700760
• 作为产物：
  描述：

  在 溶剂黄146 作用下， 以 甲醇 为溶剂， 反应 4.0h， 生成 6-叠氮基-6-脱氧-L-半乳糖
  参考文献：
  名称：

  基于FRET的人类岩藻糖基转移酶活性的直接和连续监测：从丰富的D-半乳糖高效合成通用的GDP-L-岩藻糖衍生物。

  摘要：

  我们已经开发了一种简便且通用的协议，用于通过使用荧光能量共振转移（FRET）连续监测人岩藻糖基转移酶的活性，并探索了其在抑制剂筛选测定中的可行性。具有荧光探针的便捷糖核苷酸6-脱氧-6-N-（2-萘-2-基乙酰胺）-β-L-吡喃半乳糖-1-基鸟苷5'-二磷酸二钠盐（1），由天然丰富的D-吡喃半乳糖通过关键中间体6-叠氮化物-1,2,3,4-四-O-苯甲酰基-6-脱氧-β-L-吡喃半乳糖有效地合成（10）。结果表明，糖基供体1和丹磺化受体底物唾液酸-α2,3-LacNAc衍生物（2）的联合使用使我们能够对唾液酸化路易斯的产生进行高度敏感，直接和连续的体外监测X（SLe x），它由人α-1,3-岩藻糖基转移酶VI（FUT-VI）催化。动力学分析表明，化合物1是检测人FUT-VI活性的优良供体底物（KM = 0.94 microM和Vmax = 0.14 microM min（-1））。据我们所

  DOI：

  10.1002/chem.200700760

文献信息

• GLYCOPROTEOMIC PROBES FOR FLUORESCENT IMAGING OF FUCOSYLATED GLYCANS IN VIVO
  申请人：Wong Chi-Huey

  公开号：US20110257376A1

  公开（公告）日：2011-10-20

  Methods are provided for labeling cellular glycans bearing azide groups via fluorescent labeling comprising Cu(I)-catalyzed [3+2] cycloaddition of a probe comprising alkynyl group. Generation of fluorescent probes from a nonfluorescent precursor, 4-ethynyl-N-ethyl-1,8-naphthalimide, by Cu(I)-catalyzed [3+2] cycloaddition of the alkyne group of the probe to an azido-modified sugar are provided. Incorporation of azido-containing fucose analog into glycoconjugates via the fucose salvage pathway are disclosed. Fluorescent visualization of fucosylated cells by flow cytometry of cells treated with 6-azidofucose labeled with click-activated fluorogenic probe or biotinylated alkyne is disclosed. Visualization of intracellular location of fucosylated glycoconjugates by fluorescence microscopy are disclosed.

  提供了一种通过荧光标记的方法来标记带有偶氮基团的细胞糖基，包括利用含炔基的探针进行铜(I)催化的[3+2]环加成。通过将非荧光前体4-乙炔基-N-乙基-1,8-萘酰亚胺经铜(I)催化的[3+2]环加成，将探针的炔基与偶氮修饰糖的偶氮基团结合生成荧光探针。通过富马醇拯救途径将含偶氮基的富马醇类似物纳入糖蛋白中。通过流式细胞术将经6-偶氮基富马醇标记的细胞与点击活化的荧光探针或生物素化炔烃处理，实现对富马基细胞的荧光可视化。通过荧光显微镜揭示富马基糖蛋白的胞内位置。
• Metabolic labeling and molecular enhancement of biological materials using bioorthogonal reactions
  申请人：The General Hospital Corporation

  公开号：US20170362266A1

  公开（公告）日：2017-12-21

  The present application provides methods of functionalizing an organ or tissue of a mammal by administering a nutrient (e.g., peracetylated N-azido galactosamine Ac4GalNAz) to the mammal or by culturing an organ or tissue in a bioreactor containing such nutrient. The present application also provides methods of selectively functionalizing extracellular matrix (ECM) of an organ or tissue of a mammal by administering a nutrient (e.g., peracetylated N-azido galactosamine Ac4GalNAz) to the mammal. In some aspects, the present application provides a decellularized scaffold of a mammalian organ or tissue comprising an extracellular matrix, wherein the extracellular matrix of the decellularized scaffold is functionalized with a chemical group that is reactive in a bioorthogonal chemical reaction, such as an azide chemical group. The present application also provides biological prosthetic mesh and mammalian organs and tissues for transplantation prepared according to the methods of the application.

  本申请提供了一种通过向哺乳动物投与营养物质（例如，乙酰化N-叠氮基半乳糖氨酸Ac4GalNAz）或在含有这种营养物质的生物反应器中培养器官或组织来功能化哺乳动物器官或组织的方法。本申请还提供了一种通过向哺乳动物投与营养物质（例如，乙酰化N-叠氮基半乳糖氨酸Ac4GalNAz）来选择性地功能化哺乳动物器官或组织的细胞外基质（ECM）的方法。在某些方面，本申请提供了哺乳动物器官或组织的脱细胞支架，其中脱细胞支架的细胞外基质被功能化为在生物正交化学反应中具有反应性的化学基团，例如叠氮基团。本申请还提供了根据本申请的方法制备的生物义肢网和哺乳动物器官和组织用于移植。
• [EN] SYNTHESIS OF LACTONE DERIVATIVES AND THEIR USE IN THE MODIFICATION OF PROTEINS<br/>[FR] SYNTHÈSE DE DÉRIVÉS DE LACTONE ET LEUR UTILISATION DANS LA MODIFICATION DE PROTÉINES
  申请人：GENIE BIOTECH UK LTD

  公开号：WO2021123229A1

  公开（公告）日：2021-06-24

  Site-specific modifications of proteins are desirable in biotechnological applications such as biopharmaceuticals, immunotherapy, vaccines, and are useful in chemical biology. Gluconoylation is a non-enzymatic, covalent, post-translational modification commonly observed on N-terminal His-Tags bearing proteins. We synthesized glucono-1,5-lactone derivatives, including azido variants for selective acylation. High yield acylation is achieved by simply mixing derivatives with target protein amidst diverse conditions of temperatures, aqueous buffers, excipients, or complex cell lysate.

  蛋白质的位点特异性修饰在生物技术应用中是可取的，例如生物制药、免疫疗法、疫苗，并且在化学生物学中也非常有用。葡萄糖酸化是一种非酶促的共价后翻译修饰，常见于带有N-末端His-标签的蛋白质上。我们合成了葡萄糖酸-1,5-内酯衍生物，包括用于选择性酰化的叠氮化衍生物。只需将衍生物与目标蛋白质混合在不同的温度、水溶液缓冲剂、辅料或复杂的细胞裂解液条件下，即可实现高产酰化。
• Alkynyl sugar analogs for the labeling and visualization of glycoconjugates in cells
  申请人：WONG CHI-HUEY

  公开号：US20080268468A1

  公开（公告）日：2008-10-30

  The present disclosure relates to a method for metabolic oligosaccharide engineering that incorporates derivatized alkyne-bearing sugar analogs as “tags” into cellular glycoconjugates. The disclosed method incorporates alkynyl derivatized Fuc and alkynyl derivatized ManNAc sugars into a cellular glycoconjugate. A chemical probe comprising an azide group and a visual probe or a fluorogenic probe is used to label the alkyne-derivatized sugar-tagged glycoconjugate. In one aspect, the chemical probe binds covalently to the alkynyl group by Cu(I)-catalyzed [3+2] azide-alkyne cycloaddition and is visualized at the cell surface, intracellularly, or in a cellular extract. The labeled glycoconjugate is capable of detection by flow cytometry, SDS-PAGE, Western blot, ELISA or confocal microscopy, and mass spectrometry.

  本公开涉及一种代谢寡糖工程的方法，该方法将衍生化的烷基糖类似物作为“标记”并纳入细胞糖蛋白中。所披露的方法将烷基化的Fuc和烷基化的ManNAc糖纳入细胞糖蛋白中。使用含有偶氮基团的化学探针和视觉探针或荧光探针来标记烷基化糖标记的糖蛋白。在一个方面，化学探针通过Cu(I)-催化的[3+2]偶氮-烷基环加成与烷基基团共价结合，并在细胞表面、细胞内或细胞提取物中可视化。标记的糖蛋白可通过流式细胞术、SDS-PAGE、Western blot、ELISA或共聚焦显微镜和质谱检测。
• METABOLIC LABELING AND MOLECULAR ENHANCEMENT OF BIOLOGICAL MATERIALS USING BIOORTHOGONAL REACTIONS
  申请人：The General Hospital Corporation

  公开号：EP3471703A1

  公开（公告）日：2019-04-24