N-(9-fluorenylmethoxycarbonyl)-3(S)-methyl-L-aspartic acid β-tert-butyl ester | 482631-91-4

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 芴
• 英文名称: N-(9-fluorenylmethoxycarbonyl)-3(S)-methyl-L-aspartic acid β-tert-butyl ester
• 英文别名: (2S,3S)-4-(tert-butyl)-3-methyl-2-(9-fluorenylmethyloxycarbonylamino)succinic acid；(2S,3S)-Fmoc-MeAsp(OtBu)-OH；(2S,3S)-4-(tert-butoxy)-2-({[(9H-fluoren-9-yl)methoxy]carbonyl}amino)-3-methyl-4-oxobutanoic acid；(2S,3S)-2-(9H-fluoren-9-ylmethoxycarbonylamino)-3-methyl-4-[(2-methylpropan-2-yl)oxy]-4-oxobutanoic acid
• CAS: 482631-91-4
• 化学式: C₂₄H₂₇NO₆
• 分子量: 425.481
• InChiKey: GFPZVFFQFHJUMK-XOBRGWDASA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  3.96
• 重原子数：
  31.0
• 可旋转键数：
  6.0
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.38
• 拓扑面积：
  101.93
• 氢给体数：
  2.0
• 氢受体数：
  5.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  N-(9-fluorenylmethoxycarbonyl)-3(S)-methyl-L-aspartic acid β-tert-butyl ester 在 N,N-二异丙基乙胺 、 三氟乙酸 作用下， 以 二氯甲烷 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 19.0h， 生成 (2S,3S)-1-allyl 4-(2-phenylpropan-2-yl) 2-((((9H-fluoren-9-yl)methoxy)carbonyl)-amino)-3-methylsuccinate
  参考文献：
  名称：

  Skyllamycins A–C的全合成

  摘要：

  Skyllamycins是一类高度功能化的非核糖体环状双缩肽天然产物，其中包含极为罕见的α-OH-甘氨酸功能。在这里，首次报道了Skyllamycins A–C的全合成，以及天然产物的生物膜抑制活性。每种天然产物的线性肽前体均通过有效的固相途径制备而成，并结合了许多合成的修饰氨基酸。在C末端酰胺和N末端乙醛酰胺部分之​​间进行的新的大环化步骤是关键的转化过程，以安装独特的α-OH-甘氨酸单元并在合成的最终步骤中生成天然产物。

  DOI：

  10.1002/chem.201704277
• 作为产物：
  描述：

  Fmoc-Asp(Ot-Bu)-OBn 在 palladium 10% on activated carbon 、 氢气 、 sodium carbonate 、 二乙胺 、 三乙胺 、 lithium hexamethyldisilazane 作用下， 以 四氢呋喃 、 1,4-二氧六环 、 甲醇 、 二氯甲烷 、 水 为溶剂， 反应 27.08h， 生成 N-(9-fluorenylmethoxycarbonyl)-3(S)-methyl-L-aspartic acid β-tert-butyl ester
  参考文献：
  名称：

  通过β-羟基天冬氨酸连接介导的环化和绝对结构建立全合成马拉西丁 A。

  摘要：

  新型抗生素的开发对于对抗日益增多的耐药病原体至关重要。Malacidin A 是钙依赖性抗生素 (CDA) 家族的新成员，具有抗抗生素耐药性病原体的活性。它的作用方式不同于经典的 CDA。然而，尚未确定马拉西丁 A 的绝对结构。在此，通过基于 Fmoc 的固相肽合成 (SPPS) 和 β-羟基天冬氨酸连接介导的肽环化的组合报道了 Malacidin A 及其类似物的全合成。全合成使我们能够建立马拉西丁 A 的绝对构型，这与我们研究中高级 Marfey 分析证实的天然马拉西丁 A 的构型一致。

  DOI：

  10.1002/anie.202009092

文献信息

• Incorporation of (2S,3S) and (2S,3R) β-Methyl aspartic acid into RGD-Containing peptides
  作者：S Schabbert

  DOI：10.1016/s0968-0896(02)00206-7

  日期：2002.10

  report the synthesis and biological activity of a series of side-chain-constrained RGD peptides containing the (2S,3R) or (2S,3S) beta-methyl aspartic acid within the RGD sequence. These compounds have been assayed for binding to the integrin receptors alpha(IIb)beta3 and alpha(v)beta3 and the results demonstrate the importance of the side-chain orientation of this particular residue within the RGD sequence

  我们报告了RGD序列内包含（2S，3R）或（2S，3S）β-甲基天冬氨酸的一系列侧链约束RGD肽的合成和生物学活性。已经测定了这些化合物与整联蛋白受体α（IIb）β3和α（v）β3的结合，并且结果证明了RGD序列内该特定残基的侧链取向的重要性。基于我们的发现，我们的RGD序列的（2S，3S）β-甲基化类似物保持了其与整联蛋白受体的结合力，而（2S，3R）β-甲基化类似物表现出极大的结合亲和力降低。我们的研究表明，天冬氨酰侧链的三维取向是整联蛋白结合的一个非常重要的参数，影响侧链取向的微小变化会引起结合亲和力的急剧变化。这些结果为设计更有效的RGD模拟物提供了重要信息。
• Synthetic Studies Toward the Skyllamycins: Total Synthesis and Generation of Simplified Analogues
  作者：Andrew M. Giltrap、F. P. Jake Haeckl、Kenji L. Kurita、Roger G. Linington、Richard J. Payne

  DOI：10.1021/acs.joc.8b00898

  日期：2018.7.6

  Herein, we report our synthetic studies toward the skyllamycins, a highly modified class of nonribosomal peptide natural products which contain a number of interesting structural features, including the extremely rare α-OH-glycine residue. Before embarking on the synthesis of the natural products, we prepared four structurally simpler analogues. Access to both the analogues and the natural products

  在本文中，我们报告了对Skyllamycins的合成研究，Skyllamycins是高度修饰的一类非核糖体肽天然产物，其包含许多有趣的结构特征，包括极为罕见的α-OH-甘氨酸残基。在开始合成天然产物之前，我们制备了四种结构上更简单的类似物。要获得类似物和天然产物，首先都需要合成许多非蛋白氨基酸，包括从方便的手性前体加纳醛中获得的三个β-OH氨基酸。在制备了适当保护的非蛋白原性氨基酸之后，使用固相合成路线，然后进行最后阶段的溶液相环化反应，组装出斯卡霉素类似物。为了获得天然产物（skyllamycins A–C），对类似物的合成路线进行了修改。具体地，通过固相肽合成法合成含有C-末端酰胺的线性肽前体。从树脂上裂解后，N-末端丝氨酸残基被氧化裂解为乙醛酰胺部分。通过最后一步环化并伴随形成异常的α-OH-甘氨酸残基，成功制备了目标天然产物Skyllamycins A–C。纯化和与真实分离物的光谱