N-[[(1S)-1-[(pentafluorophenoxy)carbonyl]ethyl]carbamoyl]-L-tryptophan tert-butyl ester | 286939-25-1

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 英文名称: N-[[(1S)-1-[(pentafluorophenoxy)carbonyl]ethyl]carbamoyl]-L-tryptophan tert-butyl ester
• 英文别名: tert-butyl (2S)-3-(1H-indol-3-yl)-2-[[(2S)-1-oxo-1-(2,3,4,5,6-pentafluorophenoxy)propan-2-yl]carbamoylamino]propanoate
• CAS: 286939-25-1
• 化学式: C₂₅H₂₄F₅N₃O₅
• 分子量: 541.475
• InChiKey: MCDMPLBRMNAQKG-NHYWBVRUSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  4.6
• 重原子数：
  38
• 可旋转键数：
  10
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.32
• 拓扑面积：
  110
• 氢给体数：
  3
• 氢受体数：
  10

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  N-[[(1S)-1-[(pentafluorophenoxy)carbonyl]ethyl]carbamoyl]-L-tryptophan tert-butyl ester 在 1,2-乙二硫醇 、 N,N-二异丙基乙胺 、 三氟乙酸 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 16.5h， 生成 (2S)-2-[[(2S)-1-[[(2S,3S)-1-[[(2R,4R,5R)-5-(2,4-dioxopyrimidin-1-yl)-4-hydroxyoxolan-2-yl]methylamino]-3-[[(2S)-2-(9H-fluoren-9-ylmethoxycarbonylamino)propanoyl]-methylamino]-1-oxobutan-2-yl]amino]-1-oxopropan-2-yl]carbamoylamino]-3-(1H-indol-3-yl)propanoic acid
  参考文献：
  名称：

  半合成帕西霉素二氢帕西霉素 D 的立体化学解析和全合成

  摘要：

  已显示太平洋霉素的 C(4') 环外烯烃的氢化作用产生一系列半合成化合物，即二氢太平洋霉素，其抗菌活性类似于天然产物。通过天然产物降解实验以及最低分子量二氢太平洋霉素 D 的全合成，已经完成了太平洋霉素中立体化学的阐明。 太平洋霉素 D 中包含的色氨酸和两个丙氨酸残基的立体化学身份已经确定显示为天然 (S) 构型，而该系列抗生素中所含的独特 3-甲基氨基-2-氨基丁酸已显示为 (2S,3S) 构型。最后，通过氢化 C(4')-C(5'

  DOI：

  10.1021/ja003292c
• 作为产物：
  描述：

  N-[[(1S)-1-[(benzyloxy)carbonyl]ethyl]carbamoyl]-L-tryptophan tert-butylester 在 palladium on activated charcoal 氢气 、 N,N'-二环己基碳二亚胺 作用下， 以 甲醇 、 乙酸乙酯 为溶剂， 20.0 ℃ 、101.33 kPa 条件下， 反应 6.5h， 生成 N-[[(1S)-1-[(pentafluorophenoxy)carbonyl]ethyl]carbamoyl]-L-tryptophan tert-butyl ester
  参考文献：
  名称：

  半合成帕西霉素二氢帕西霉素 D 的立体化学解析和全合成

  摘要：

  已显示太平洋霉素的 C(4') 环外烯烃的氢化作用产生一系列半合成化合物，即二氢太平洋霉素，其抗菌活性类似于天然产物。通过天然产物降解实验以及最低分子量二氢太平洋霉素 D 的全合成，已经完成了太平洋霉素中立体化学的阐明。 太平洋霉素 D 中包含的色氨酸和两个丙氨酸残基的立体化学身份已经确定显示为天然 (S) 构型，而该系列抗生素中所含的独特 3-甲基氨基-2-氨基丁酸已显示为 (2S,3S) 构型。最后，通过氢化 C(4')-C(5'

  DOI：

  10.1021/ja003292c

文献信息

• Total Synthesis and Biological Evaluation of Pacidamycin D and Its 3′-Hydroxy Analogue
  作者：Kazuya Okamoto、Masahiro Sakagami、Fei Feng、Hiroko Togame、Hiroshi Takemoto、Satoshi Ichikawa、Akira Matsuda

  DOI：10.1021/jo202159q

  日期：2012.2.3

  copper-catalyzed cross-coupling with the tetrapeptide carboxamide 5, a thermally unstable compound containing a number of potentially reactive functional groups. This synthetic route also allowed us to easily prepare 3′-hydroxy analogue 32. The assemblage by cross-coupling of the Z-oxyvinyl halide 6 and the carboxamide 5 at a late stage of the synthesis provided ready access to a range of uridylpeptide antibiotics

  描述了pacidamycin D（4）及其3'-羟基类似物32的总合成的全部细节。化学上不稳定的Z-氧酰基烯酰胺部分是在尿肽天然产物中发现的最具挑战性的化学结构。我们合成4的方法的关键要素包括有效且立体控制的Z-氧乙烯基卤化物6和7的构建以及它们在铜催化下与四肽羧酰胺5的交叉偶联，四肽羧酰胺5是一种热不稳定的化合物，含有许多潜在的反应性官能团组。这种合成途径还使我们能够轻松制备3'-羟基类似物32。Z-氧乙烯基卤化物6和羧酰胺5在合成的后期通过交叉偶联而组装在一起，尽管它们固有的不稳定性质和潜在的差向异构化作用，但只要改变它们，就可以轻易地获得一系列的尿肽肽抗生素及其类似物。四肽部分。
• Total Synthesis of Pacidamycin D by Cu(I)-Catalyzed Oxy Enamide Formation
  作者：Kazuya Okamoto、Masahiro Sakagami、Fei Feng、Hiroko Togame、Hiroshi Takemoto、Satoshi Ichikawa、Akira Matsuda

  DOI：10.1021/ol202124b

  日期：2011.10.7

  The first total synthesis of pacidamycin D, which is expected to be a good candidate as an antibacterial agent against P. aeruginosa, is described. The key elements of our approach feature an efficient and stereocontrolled construction of the Z-oxyvinyl iodide and copper-catalyzed cross-coupling with the tetrapeptide carboxamide.