1-Methyl-4-nitro-1H-imidazole-2-carboxylic acid {5-[5-(3-dimethylamino-propylcarbamoyl)-1-methyl-1H-pyrrol-3-ylcarbamoyl]-1-methyl-1H-pyrrol-3-yl}-amide | 128484-14-0

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 唑类
• 英文名称: 1-Methyl-4-nitro-1H-imidazole-2-carboxylic acid {5-[5-(3-dimethylamino-propylcarbamoyl)-1-methyl-1H-pyrrol-3-ylcarbamoyl]-1-methyl-1H-pyrrol-3-yl}-amide
• 英文别名: N-[5-[[5-[3-(dimethylamino)propylcarbamoyl]-1-methylpyrrol-3-yl]carbamoyl]-1-methylpyrrol-3-yl]-1-methyl-4-nitroimidazole-2-carboxamide
• CAS: 128484-14-0
• 化学式: C₂₂H₂₉N₉O₅
• 分子量: 499.53
• InChiKey: BHSNIPQEWWBSLH-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  1.19
• 重原子数：
  36.0
• 可旋转键数：
  10.0
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.36
• 拓扑面积：
  161.36
• 氢给体数：
  3.0
• 氢受体数：
  10.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  1-Methyl-4-nitro-1H-imidazole-2-carboxylic acid {5-[5-(3-dimethylamino-propylcarbamoyl)-1-methyl-1H-pyrrol-3-ylcarbamoyl]-1-methyl-1H-pyrrol-3-yl}-amide 在 sodium tetrahydroborate 、 palladium on activated charcoal 作用下， 以 甲醇 、 水 、 乙酸乙酯 为溶剂， 生成 4-Amino-1-methyl-1H-imidazole-2-carboxylic acid {5-[5-(3-dimethylamino-propylcarbamoyl)-1-methyl-1H-pyrrol-3-ylcarbamoyl]-1-methyl-1H-pyrrol-3-yl}-amide
  参考文献：
  名称：

  吡咯/咪唑 CPI 偶联物的高效序列特异性 DNA 链间交联

  摘要：

  我们通过合成吡咯 (Py)/咪唑 (Im)-二酰胺-CPI 偶联物 ImPyLDu86 (1) 的二聚体，使用七种不同的接头连接，开发了一种新型 DNA 链间交联剂。四亚甲基接头化合物 7b 仅在伴侣三酰胺 ImImPy 存在的情况下有效地在九个碱基对序列 5'-PyGGC(T/A)GCCPu-3' 处产生 DNA 链间交联。为了通过 7b 与 ImImPy 进行有效交联，需要两个识别位点之间的一个 AT 碱基对来容纳接头区域。消除 AT 碱基对和插入额外的 AT 碱基对并用 GC 碱基对替换显着降低了交联程度。在存在各种三酰胺的情况下，还检查了 7b 的链间交联的序列特异性。与 ImImPy 相比，ImImIm 的存在略微减少了交联产物的形成。错配伙伴 ImPyPy 和 PyImPy 不与 7b 产生链间交联产物，而 ImPyPy 和 PyImPy 在其与 7b 的匹配位点诱导有效烷基化。使用变性聚丙烯酰胺凝胶电泳和

  DOI：

  10.1021/ja028459b
• 作为产物：
  描述：

  N-[3-(dimethylamino)propyl]-1-methyl-4-{[(1-methyl-4-nitro-1H-pyrrol-2-yl)carbonyl]amino}-1H-pyrrole-2-carboxamide 在 10% palladium on active carbon 氢气 、 N,N-二异丙基乙胺 作用下， 以 甲醇 、 二氯甲烷 为溶剂， 生成 1-Methyl-4-nitro-1H-imidazole-2-carboxylic acid {5-[5-(3-dimethylamino-propylcarbamoyl)-1-methyl-1H-pyrrol-3-ylcarbamoyl]-1-methyl-1H-pyrrol-3-yl}-amide
  参考文献：
  名称：

  吡咯/咪唑 CPI 偶联物的高效序列特异性 DNA 链间交联

  摘要：

  我们通过合成吡咯 (Py)/咪唑 (Im)-二酰胺-CPI 偶联物 ImPyLDu86 (1) 的二聚体，使用七种不同的接头连接，开发了一种新型 DNA 链间交联剂。四亚甲基接头化合物 7b 仅在伴侣三酰胺 ImImPy 存在的情况下有效地在九个碱基对序列 5'-PyGGC(T/A)GCCPu-3' 处产生 DNA 链间交联。为了通过 7b 与 ImImPy 进行有效交联，需要两个识别位点之间的一个 AT 碱基对来容纳接头区域。消除 AT 碱基对和插入额外的 AT 碱基对并用 GC 碱基对替换显着降低了交联程度。在存在各种三酰胺的情况下，还检查了 7b 的链间交联的序列特异性。与 ImImPy 相比，ImImIm 的存在略微减少了交联产物的形成。错配伙伴 ImPyPy 和 PyImPy 不与 7b 产生链间交联产物，而 ImPyPy 和 PyImPy 在其与 7b 的匹配位点诱导有效烷基化。使用变性聚丙烯酰胺凝胶电泳和

  DOI：

  10.1021/ja028459b

文献信息

• Synthesis of nitrated oligo-N-methylpyrrole carboxamide derivatives and their photochemical DNA cleaving activities
  作者：Eiji Nishiwaki、Hideaki Lee、Toyomi Matsumoto、Kouhei Toyooka、Hiromu Sakurai、Masayuki Shibuya

  DOI：10.1016/s0040-4039(00)88790-0

  日期：1990.1

  Synthesis of various nitrated oligo-N-methylpyrrolecarboxamide derivatives and their DNA cleaving activities under UV-A irradiation were described.

  描述了各种硝化的寡聚-N-甲基吡咯甲酰胺衍生物的合成及其在UV-A辐照下的DNA裂解活性。