随着新
化学实体越来越难以找到和获得批准,重新定位和重新定位药物已成为当前时代的一种成功追求的成功策略。本文中,我们报告了一条集成的BioGPS / F
LAPdock管道,可快速有效地进行脱靶识别和药物再利用。我们的方法基于蛋白质结合位点的结构和
化学性质,即GRID分子相互作用域(MIF)中编码的
配体图像。通过BioGPS算法,根据聚类的口袋测量口袋的重叠程度,可以揭示蛋白质的相似性。共结晶的和已知的
配体可以在相似的靶标之间交叉对接,选择用于后续的体外结合实验,并且可能会提高抑制效力。我们使用人类
胸苷酸合酶(
TS)作为测试案例,并在整个RCSB蛋白质数据库(PDB)中搜索了类似的目标口袋。我们选择
酪蛋白激酶IIalpha作为对照,并测试了其一系列针对
TS模板的
抑制剂。确定了
鞣花酸和
芹菜素为
TS抑制剂,并在第二轮筛选中选择并合成了各种类
黄酮。已证明这些化合物在低微摩尔范围内具有活性。