<i>C</i><sub>3</sub>-symmetric opioid scaffolds are pH-responsive DNA condensation agents
作者:Natasha McStay、Zara Molphy、Alan Coughlan、Attilio Cafolla、Vickie McKee、Nicholas Gathergood、Andrew Kellett
DOI:10.1093/nar/gkw1097
日期:2017.1.25
backbone coordination arising from thermal melting analysis and circular dichroism spectroscopy, with compaction also witnessed on synthetic dsDNA co-polymers poly[d(A-T)2] and poly[d(G-C)2]. On-chip microfluidic analysis of DNA condensed by C3-agents provided concentration-dependent protection (inhibition) to site-selective excision by type II restriction enzymes: BamHI, HindIII, SalI and EcoRI, but not to
在本文中,我们报告了三脚架C 3对称阿片样物质支架的合成,作为双链体DNA的高亲和力缩合剂。在超螺旋结构和规范B-DNA结构上均发生凝结,并通过琼脂糖电泳,粘度,浊度和原子力显微镜(AFM)测量进行鉴定。在结构上,三-阿片样物质骨架对缩合的要求已被证明为双-(C 2对称)和单取代的(C 1-对称的均三甲苯基连接的阿片样物质衍生物不能很好地协调dsDNA。通过环形和球状原子力显微镜的聚集观察到的缩合是由阿片样物质骨架上的质子化,阳离子,叔胺基团与磷酸核酸骨架之间的表面结合离子相互作用引起的。实际上,通过将C 3-吗啡(MC3)的6-羟基转变为C 3-异可待因(HC3)和C 3-牛黄素(OC3)中的甲氧基取代基分子,dsDNA紧缩得以保留,从而消除了磷酸盐与羟基表面结合的可能性。三脚架阿片类物质的缩合被认为是pH依赖性的,并且受离子强度的强烈影响,并进一步证明了由热熔体分析和圆二色性光谱引起的