(E)-5-(2-carbomethoxyvinyl)-2'-deoxyuridine | 96244-97-2

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘧啶核苷
• 英文名称: (E)-5-(2-carbomethoxyvinyl)-2'-deoxyuridine
• 英文别名: (E)-5-(2-methoxycarbonylvinyl)-2'-deoxyuridine；methyl (E)-3-(1-((2R,4S,5R)-4-hydroxy-5-(hydroxymethyl)tetrahydrofuran-2-yl)-2,4-dioxo-1,2,3,4-tetrahydropyrimidin-5-yl)acrylate；methyl (E)-3-[1-[(2R,4S,5R)-4-hydroxy-5-(hydroxymethyl)oxolan-2-yl]-2,4-dioxopyrimidin-5-yl]prop-2-enoate
• CAS: 96244-97-2
• 化学式: C₁₃H₁₆N₂O₇
• 分子量: 312.279
• InChiKey: RKTRMSPWWLPPAY-YJCWOPNRSA-N

物化性质

• 密度：
  1.540±0.06 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -1.3
• 重原子数：
  22
• 可旋转键数：
  5
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.46
• 拓扑面积：
  125
• 氢给体数：
  3
• 氢受体数：
  7

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  (E)-5-(2-carbomethoxyvinyl)-2'-deoxyuridine 在 盐酸 、 N-溴代丁二酰亚胺(NBS) 、 potassium carbonate 、 sodium hydroxide 作用下， 生成 溴夫定
  参考文献：
  名称：

  BVdU 的 ProTides 作为潜在的抗癌剂，有效地在细胞内递送其活化的代谢物

  摘要：

  核苷是治疗癌症的主要化疗药物，但其在细胞摄取、核苷激酶介导的激活和分解代谢方面的局限性已有充分记录。被称为 ProTides 的单磷酸前核苷酸代表了一种绕过对主动转运和核苷激酶介导的激活的依赖的强大策略。在此，我们报告了 BVdU ProTides 的结构调整。制备了 46 种氨基磷酸酯，并针对三种不同的癌细胞系进行了生物学评估；鼠白血病 (L1210)、人 CD 4 + T 淋巴细胞 (CEM) 和人宫颈癌 (HeLa)。与 BVdU 相比，针对 L1210 细胞的效力增强了 20 倍。有趣的是，与无活性的母体 BVdU 相比，许多 ProTides 对 CEM 和 HeLa 细胞表现出较低的微摩尔活性。ProTides 对非致瘤性人肺成纤维细胞培养物显示出即使有可测量的毒性，也很差。报道了四对非对映异构体混合物的分离以及它们的光谱特性、生物活性和酶活化率的比较。

  DOI：

  10.1016/j.bmcl.2016.10.077
• 作为产物：
  描述：

  碘苷 以 乙腈 为溶剂， 反应 24.0h， 生成 (E)-5-(2-carbomethoxyvinyl)-2'-deoxyuridine
  参考文献：
  名称：

  Hassan, Mohamed E., Recueil des Travaux Chimiques des Pays-Bas, 1986, vol. 105, # 1, p. 30 - 32

  摘要：

  DOI：

文献信息

• (E)-5-(3-oxopropen-1-yl)-2′-deoxyuridine and (E)-5-(3-oxopropen-1-yl)-2′,3′-dideoxyuridine; new antiviral agents: Syntheses and biological activity
  作者：Young-Moon Cho、Francis Johnson

  DOI：10.1016/0040-4039(94)88009-3

  日期：1994.2

  The synthese of the 5-(3-oxopropen-1-yl) derivatives of dU () and ddU () and their biological activity are reported. Good antiviral activity (EC50, 1.4 μg/mL) and selectivity (SI > 71.4) is shown by against VZV, whereas in the case of the antiviral activity (EC50, 2.6 μg/mL; SI > 38.5) against EBV is greater than that of Acyclovir (EC50, 9.3 μg/mL).

  报道了dU（）和ddU（）的5-（3-氧代丙烯-1-基）衍生物的合成及其生物学活性。良好的抗病毒活性（EC 50，1.4微克/毫升）和选择性（SI> 71.4）由示出对VZV，而在的情况下，抗病毒活性（EC 50，2.6微克/毫升; SI> 38.5）抗EBV是更大比阿昔洛韦（EC 50，9.3微克/毫升）。
• Synthesis, Cytotoxicity, and Insight into the Mode of Action of Re(CO)3 Thymidine Complexes
  作者：Mark D. Bartholomä、Anthony R. Vortherms、Shawn Hillier、Birgit Ploier、John Joyal、John Babich、Robert P. Doyle、Jon Zubieta

  DOI：10.1002/cmdc.201000196

  日期：2010.9.3

  and C5 with spacers of various lengths. The corresponding organometallic thymidine complexes were fully characterized by IR and NMR spectroscopy and mass spectrometry. Their cytotoxicity was assessed against the A549 lung carcinoma cell line. Toxicity is dependent on the site and mode of conjugation as well as on the nature and the length of the tether. Moderate toxicity was observed for conjugates carrying

  核苷类似物被广泛用于癌症和病毒性疾病的治疗。迄今为止，几乎没有研究过有机or（I）配合物的抗增殖特性。在这里，我们介绍胸苷和尿苷的Re I（CO）3核心配合物的合成，表征和体外评估。用于绑定Re I（CO）3作为核心，在位置C5'，C2'，N3和C5处引入具有不同长度间隔基的三齿二聚二烯丙基胺金属螯合物。相应的有机金属胸苷配合物通过IR和NMR光谱法和质谱法充分表征。评估了它们对A549肺癌细胞系的细胞毒性。毒性取决于结合的部位和方式，以及系链的性质和长度。观察到用于承载铼部分在位置C5'或N3缀合物中等毒性（IC 50 = 124-160μ中号）。对于在C2'或C5处修饰的复合物，未观察到毒性。在C5'处带有十二碳烯间隔基的配合物53具有显着的毒性，并且比顺铂更有效，IC 50为50的6.0μ值中号。据我们所知，这是[M（CO）3 ] + 1-核苷结合物的抗增殖特性的首次报道。在使用A5
• A Simple Synthesis of 5-(1-Alkenyl)uracil Derivatives by Palladium-Catalyzed Oxidative Coupling of Uracils With Olefins
  作者：Kosaku Hirota、Yoshiaki Isobe、Yukio Kitade、Yoshifumi Maki

  DOI：10.1055/s-1987-27981

  日期：——

  The oxidative coupling of uracil derivatives t with olefins, such as methyl acrylate, acrylonitrile, methyl vinyl ketone, and styrene, using one equivalent of palladium acetate leads to the corresponding 5-(1-alkenyl)uracil derivatives 2.

  使用一当量的醋酸钯，尿嘧啶衍生物t与丙烯酸甲酯、丙烯腈、乙烯基甲酮和苯乙烯等烯烃进行氧化偶联反应，可得到相应的5-(1-烯基)尿嘧啶衍生物2。
• A Versatile Toolbox for Variable DNA Functionalization at High Density
  作者：Stefan Jäger、Goran Rasched、Hagit Kornreich-Leshem、Marianne Engeser、Oliver Thum、Michael Famulok

  DOI：10.1021/ja051725b

  日期：2005.11.1

  variety of chemically modified deoxynucleotide triphosphates (dNTPs), DNA polymerases, and templates. All natural nucleobases in each strand were substituted with up to four different base-modified analogues. We studied the sequence dependence of enzymatic amplification to yield high-density functionalized DNA (fDNA) from modified dNTPs, and of fDNA templates, and found that GC-rich sequences are amplified

  为了扩大化学修饰 DNA 在纳米和生物技术、材料科学、传感器开发和分子识别中的适用性，需要将大量不同的修饰同时引入同一核酸序列的策略。在这里，我们使用各种化学修饰的三磷酸脱氧核苷酸 (dNTP)、DNA 聚合酶和模板，研究通过引物延伸和 PCR 获得功能化 dsDNA 的范围和限制。每条链中的所有天然核碱基都被多达四种不同的碱基修饰类似物取代。我们研究了酶促扩增的序列依赖性，以从修饰的 dNTP 和 fDNA 模板中产生高密度功能化 DNA (fDNA)，并发现与富含 AT 的序列相比，富含 GC 的序列扩增效率降低。对所使用的聚合酶也有很强的依赖性。虽然 A 族聚合酶通常在包含特定碱基连续片段的“要求高”的模板上表现不佳，但 B 族聚合酶更适合此目的，尤其是 Pwo 和 Vent (exo-) DNA 聚合酶。通过 CD 光谱对以增加的密度进行修饰的 fDNA 进行系统分析表明，无论其化学性质如何，单个修饰碱基都不会改变整体
• Novel water-soluble phosphatriazenes: versatile ligands for Suzuki–Miyaura, Sonogashira and Heck reactions of nucleosides
  作者：Shatrughn Bhilare、Vijay Gayakhe、Ajaykumar V. Ardhapure、Yogesh S. Sanghvi、Carola Schulzke、Yulia Borozdina、Anant R. Kapdi

  DOI：10.1039/c6ra19039a

  日期：——

  complexation reactions with Pd(OAc)2 and utilized for catalyzing column-free Suzuki–Miyaura cross-coupling of various purine and pyrimidine halonucleosides in water. The water-solubility of the catalytic system simplified the isolation of the cross-coupled products to mere filtration, while the catalytically active solution in the filtrate was recycled eight times. A novel copper-free Sonogashira coupling

  两种新的水溶性磷三氮烯配体已被合成为与Pd（OAc）2络合反应的通用配体，并用于催化水中各种嘌呤和嘧啶卤代核苷的无柱铃木-宫浦交叉偶联。催化系统的水溶性简化了交叉偶合产物的分离，使其仅需过滤，而滤液中的催化活性溶液则循环了八次。通过一锅合成FV-100（一种基于核苷的药物，用于带状疱疹或带状疱疹治疗的3期临床试验），也已建立了针对核苷的新型无铜Sonogashira偶联方案。通过另一种抗病毒药物：BVDU的合成证明了Heck反应的应用。