3',5'-O-bis(tert-butyl(dimethyl)silyl)-5-(azidomethyl)deoxyuridine | 823790-97-2

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘧啶核苷
• 英文名称: 3',5'-O-bis(tert-butyl(dimethyl)silyl)-5-(azidomethyl)deoxyuridine
• 英文别名: 3',5'-bis-O-(tert-butyldimethylsilyl)-5-(azidomethyl)-2'-deoxyuridine；5-(azidomethyl)-1-[(2R,4S,5R)-4-[tert-butyl(dimethyl)silyl]oxy-5-[[tert-butyl(dimethyl)silyl]oxymethyl]oxolan-2-yl]pyrimidine-2,4-dione
• CAS: 823790-97-2
• 化学式: C₂₂H₄₁N₅O₅Si₂
• 分子量: 511.769
• InChiKey: CVJSTVBOLCMJGT-RCCFBDPRSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  5.05
• 重原子数：
  34
• 可旋转键数：
  10
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.82
• 拓扑面积：
  91.5
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  7

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  3',5'-O-bis(tert-butyl(dimethyl)silyl)-5-(azidomethyl)deoxyuridine 在 copper(l) iodide 、 四丁基氟化铵 、 N,N-二异丙基乙胺 作用下， 以 四氢呋喃 、 水 、 乙腈 为溶剂， 反应 0.03h， 生成 5-[(4-methyluracil-1H-1,2,3-triazol-1-yl)methyl]-2'-deoxyuridine
  参考文献：
  名称：

  用于核苷功能化的微波辅助点击化学：用于分析和生物学应用的有用衍生物

  摘要：

  摘要 通过Huisgen反应，使用简单方便的一步合成方法合成了一系列新颖的5-（1,2,3-三唑基）-2'-脱氧尿苷。这些合成过程中的关键步骤是在无溶剂微波辐照下和以CuI为催化剂的C-5位置发生点击反应。由胸苷合成5-叠氮基甲基-2'-脱氧尿苷，其与几种炔烃的点击反应提供了高产率的三唑衍生物。合成的化合物仅显示出有限的抗病毒活性[针对人鼻病毒（HRV），丙型肝炎病毒（HCV）和HIV]和对一系列革兰氏阳性和革兰氏阴性细菌的抗菌活性。pyr改性的和EPR的硝基氧基自旋标记的脱氧尿苷的荧光性质的评估表明这些化合物作为有价值的分析工具的适用性。 通过Huisgen反应，使用简单方便的一步合成方法合成了一系列新颖的5-（1,2,3-三唑基）-2'-脱氧尿苷。这些合成过程中的关键步骤是在无溶剂微波辐照下和以CuI为催化剂的C-5位置发生点击反应。由胸苷合成5-叠氮基甲基-2'-脱氧尿苷，其与几种炔

  DOI：

  10.1055/s-0032-1317964
• 作为产物：
  描述：

  beta-胸苷 在 咪唑 、 N-溴代丁二酰亚胺(NBS) 、 sodium azide 、 偶氮二异丁腈 作用下， 以 四氯化碳 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 11.0h， 生成 3',5'-O-bis(tert-butyl(dimethyl)silyl)-5-(azidomethyl)deoxyuridine
  参考文献：
  名称：

  用于核苷功能化的微波辅助点击化学：用于分析和生物学应用的有用衍生物

  摘要：

  摘要 通过Huisgen反应，使用简单方便的一步合成方法合成了一系列新颖的5-（1,2,3-三唑基）-2'-脱氧尿苷。这些合成过程中的关键步骤是在无溶剂微波辐照下和以CuI为催化剂的C-5位置发生点击反应。由胸苷合成5-叠氮基甲基-2'-脱氧尿苷，其与几种炔烃的点击反应提供了高产率的三唑衍生物。合成的化合物仅显示出有限的抗病毒活性[针对人鼻病毒（HRV），丙型肝炎病毒（HCV）和HIV]和对一系列革兰氏阳性和革兰氏阴性细菌的抗菌活性。pyr改性的和EPR的硝基氧基自旋标记的脱氧尿苷的荧光性质的评估表明这些化合物作为有价值的分析工具的适用性。 通过Huisgen反应，使用简单方便的一步合成方法合成了一系列新颖的5-（1,2,3-三唑基）-2'-脱氧尿苷。这些合成过程中的关键步骤是在无溶剂微波辐照下和以CuI为催化剂的C-5位置发生点击反应。由胸苷合成5-叠氮基甲基-2'-脱氧尿苷，其与几种炔

  DOI：

  10.1055/s-0032-1317964

文献信息

• [EN] INHIBITORS OF DNMT1 AS ANTICANCER THERAPEUTIC AGENTS<br/>[FR] INHIBITEURS DE DNMT1 UTILISÉS EN TANT QU'AGENTS THÉRAPEUTIQUES ANTICANCÉREUX
  申请人：VICTORIA LINK LTD

  公开号：WO2020013712A1

  公开（公告）日：2020-01-16

  Inhibitors of DNA methyltransferase 1 (an enzyme responsible for the maintenance of DNA CpG methylation marks in human cells) and their use as therapeutic agents against various cancers. The invention relates to compounds, pharmaceutical compositions, methods for inhibiting DNA methyltransferase 1, and methods for treating cancer. The inhibitors are compounds of the general formula.

  DNA 甲基转移酶 1 的抑制剂（一种负责在人类细胞中维持 DNA CpG 甲基化标记的酶）及其作为治疗各种癌症的药物的使用。该发明涉及化合物、药物组合物、抑制 DNA 甲基转移酶 1 的方法以及治疗癌症的方法。这些抑制剂是一般公式的化合物。
• Bioorthogonal Metabolic DNA Labelling using Vinyl Thioether-Modified Thymidine and <i>o</i> -Quinolinone Quinone Methide
  作者：Amu Gubu、Long Li、Yan Ning、Xiaoyun Zhang、Seonghyun Lee、Mengke Feng、Qiang Li、Xiaoguang Lei、Kyubong Jo、Xinjing Tang

  DOI：10.1002/chem.201705917

  日期：2018.4.17

  and their functions. Here, we report the development of a new DNA metabolic labeling strategy enabled by the catalyst‐free bioorthogonal ligation using vinyl thioether modified thymidine and o‐quinolinone quinone methide. With the newly designed vinyl thioether‐modified thymidine (VTdT), we added labeling tags on cellular DNA, which could further be linked to fluorochromes in cells. Therefore, we successfully

  用荧光染料进行生物正交代谢DNA标记是一种可视化DNA分子及其功能的强大策略。在这里，我们报告了一种新的DNA代谢标记策略的开发，该策略通过使用乙烯基硫醚修饰的胸苷和邻喹啉酮醌甲基化物进行无催化剂的生物正交连接而得以实现。使用新设计的乙烯基硫醚修饰的胸苷（VTdT），我们在细胞DNA上添加了标签标签，这些标签可以进一步与细胞中的荧光染料连接。因此，我们成功地观察了细胞内的DNA定位以及单个DNA分子，而无需其他染色试剂。此外，我们使用DNase I消化，VTdT以及VTdT- o的MS表征进一步表征了这种生物正交DNA代谢标记QQF共轭物在细胞核或线粒体中。这项技术为研究细胞中的DNA提供了有力的策略，这为将来实现DNA合成和功能的时空破译铺平了道路。
• Electron-Mediated Aminyl and Iminyl Radicals from C5 Azido-Modified Pyrimidine Nucleosides Augment Radiation Damage to Cancer Cells
  作者：Zhiwei Wen、Jufang Peng、Paloma R. Tuttle、Yaou Ren、Carol Garcia、Dipra Debnath、Sunny Rishi、Cameron Hanson、Samuel Ward、Anil Kumar、Yanfeng Liu、Weixi Zhao、Peter M. Glazer、Yuan Liu、Michael D. Sevilla、Amitava Adhikary、Stanislaw F. Wnuk

  DOI：10.1021/acs.orglett.8b03035

  日期：2018.12.7

  xyuridine (AvdU) and cytidine (AvdC). The addition of radiation-produced electrons to C5-azido nucleosides leads to the formation of π-aminyl radicals followed by facile conversion to σ-iminyl radicals either via a bimolecular reaction involving intermediate α-azidoalkyl radicals in AmdU/AmdC or by tautomerization in AvdU/AvdC. AmdU demonstrates effective radiosensitization in EMT6 tumor cells.

  合成了两类叠氮基修饰的嘧啶核苷作为潜在的放射增敏剂；一类是5-叠氮甲基-2'-脱氧尿苷(AmdU)和胞苷(AmdC)，第二类是5-(1-叠氮乙烯基)-2'-脱氧尿苷(AvdU)和胞苷(AvdC)。将辐射产生的电子添加到 C5-叠氮基核苷上会导致 π-氨基自由基的形成，然后通过涉及 AmdU/AmdC 中中间体 α-叠氮基烷基自由基的双分子反应或通过 AvdU 中的互变异构化轻松转化为 σ-亚氨基自由基/AvdC。AmdU 在 EMT6 肿瘤细胞中表现出有效的放射增敏作用。
• Synthesis and Properties of a New Fluorescent Bicyclic 4-<i>N</i>-Carbamoyldeoxycytidine Derivative
  作者：Kenichi Miyata、Ryuji Tamamushi、Akihiro Ohkubo、Haruhiko Taguchi、Kohji Seio、Tomofumi Santa、Mitsuo Sekine

  DOI：10.1021/ol053125n

  日期：2006.4.1

  [reaction: see text] A bicyclic 4-N-carbamoyldeoxycytidine derivative (1, dC(hpp)) geometrically locked was synthesized as a new fluorescent nucleobase. The hybridization properties of oligodeoxynucleotides containing dC(hpp) were investigated by use of T(m) analysis. It was found that dC(hpp) forms stable base pairs not only with the complementary guanine base, but also with the adenine base. Interestingly

  [反应：见正文]合成了一种几何上锁定的双环4-N-氨基甲酰基脱氧胞苷衍生物（1，dC（hpp）），作为一种新的荧光核碱基。通过T（m）分析研究了含有dC（hpp）的寡聚脱氧核苷酸的杂交特性。发现dC（hpp）不仅与互补鸟嘌呤碱基而且与腺嘌呤碱基形成稳定的碱基对。有趣的是，仅当形成dC（hpp）-dG碱基对时，dC（hpp）的荧光才被抑制。
• Synthesis and Characterization of Transition-State Analogue Inhibitors against Human DNA Methyltransferase 1
  作者：Farah Lamiable-Oulaidi、Rajesh K. Harijan、Karl J. Shaffer、Douglas R. Crump、Yan Sun、Quan Du、Shivali A. Gulab、Ashna A. Khan、Andreas Luxenburger、Anthony D. Woolhouse、Simone Sidoli、Peter C. Tyler、Vern L. Schramm

  DOI：10.1021/acs.jmedchem.1c01869

  日期：2022.4.14

  methyltransferase 1 (DNMT1) silences tumor-suppression genes, and inhibition of DNMT1 can reactivate silenced genes. The 5-azacytidines are approved inhibitors of DNMT1, but their mutagenic mechanism limits their utility. A synthon approach from the analogues of S-adenosylhomocysteine, methionine, and deoxycytidine recapitulated the chemical features of the DNMT1 transition state in the synthesis of 16 chemically

  人类 DNA 甲基转移酶 1 (DNMT1) 对 CpG 区域的高甲基化使肿瘤抑制基因沉默，而对 DNMT1 的抑制可以重新激活沉默的基因。5-氮杂胞苷是经批准的 DNMT1 抑制剂，但它们的诱变机制限制了它们的效用。来自S-腺苷高半胱氨酸、蛋氨酸和脱氧胞苷类似物的合成子方法在 16 种化学稳定的过渡态模拟物的合成中概括了 DNMT1 过渡态的化学特征。对引起纯化的DNMT1的完全和部分抑制的抑制剂进行了表征。抑制剂对 DNMT1 与 DNMT3b 显示出适度的选择性。活性位点对接预测抑制剂与S-腺苷-l的相互作用催化位点的甲硫氨酸和脱氧胞苷区域，通过直接结合分析进行验证。纯化的 DNMT1 的抑制剂作用未反映在培养的细胞中。部分抑制剂激活细胞 DNA 甲基化，而完全抑制剂对细胞 DNA 甲基化没有影响。这些化合物提供了对用于 DNA 甲基转移酶的新的非共价 DNMT 化学支架家族的化学访问。