5'-O-(tert-butyldimethylsilyl)-3'-amino-3'-deoxythymidine | 130945-04-9

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘧啶核苷
• 英文名称: 5'-O-(tert-butyldimethylsilyl)-3'-amino-3'-deoxythymidine
• 英文别名: 1-((2R,4S,5S)-4-amino-5-(((tert-butyldimethylsilyl)oxy)methyl)tetrahydrofuran-2-yl)-5-methylpyrimidine-2,4(1H,3H)-dione；3'-amino-2'-deoxy-5'-O-(tert-butyldimethylsilyl)thymidine；5’-TBDMS-3’-aminothymidine；3'-amino-3'-deoxy-5'-O-(tert-butyldimethylsilyl)thymidine；3'-Amino-5'-O-tert-butyldimethylsilyl-3'-deoxythymidine；1-[(2R,4S,5S)-4-amino-5-[[tert-butyl(dimethyl)silyl]oxymethyl]oxolan-2-yl]-5-methylpyrimidine-2,4-dione
• CAS: 130945-04-9
• 化学式: C₁₆H₂₉N₃O₄Si
• 分子量: 355.509
• InChiKey: IRIKXZKOLWIDBZ-YNEHKIRRSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  1.48
• 重原子数：
  24
• 可旋转键数：
  5
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.75
• 拓扑面积：
  93.9
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  5

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  5'-O-(tert-butyldimethylsilyl)-3'-amino-3'-deoxythymidine 在 四丁基氟化铵 作用下， 以 四氢呋喃 为溶剂， 以87%的产率得到3'-氨基-2',3'-双脱氧胸苷
  参考文献：
  名称：

  5'-甲硅烷基化的3'-1,2,3-三唑基胸苷类似物作为西尼罗河病毒和登革热病毒的抑制剂

  摘要：

  西尼罗河病毒（WNV）和登革热病毒（DENV）是重要的人类病原体，目前尚无针对其的疫苗或特异性抗病毒药。我们在本文中报道了从3'-叠氮胸苷（AZT）衍生的5'-甲硅烷基化核苷支架，在低微摩尔浓度下一致且选择性地抑制WNV和DENV。各种三唑生物甾体的进一步合成显示出清晰的结构-活性关系（SAR），其中对WNV和DENV的抗病毒活性主要取决于5'-甲硅烷基和3'-三唑或其生物甾体的取代基。5'甲硅烷基特别有趣，它可开启针对WNV和DENV的抗病毒活性，同时废除先前报道的针对人类免疫缺陷病毒（HIV-1）的抗病毒效力。通过噬菌斑测定法确认了抗病毒活性，该噬菌斑测定法在选择的化合物存在下观察到病毒滴度降低。分子建模与竞争S-腺苷-1-甲硫氨酸（SAM）结合试验表明，这些化合物可能通过与甲基转移酶（MTase）结合而赋予抗病毒活性。

  DOI：

  10.1021/acs.jmedchem.5b00327
• 作为产物：
  描述：

  beta-胸苷 在 palladium on activated charcoal 4-二甲氨基吡啶 、 叠氮化锂 、 偶氮二甲酸二异丙酯 、 氢气 、 三乙胺 、 三苯基膦 作用下， 以 乙醇 、 二氯甲烷 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 51.0h， 生成 5'-O-(tert-butyldimethylsilyl)-3'-amino-3'-deoxythymidine
  参考文献：
  名称：

  N3'-> P5'寡脱氧核糖核苷酸磷酸氨基甲酸酯：一种基于亚磷酰胺胺交换反应的新合成方法。

  摘要：

  展示了一种合成N3'-> P5'氨基磷酸亚氨基寡脱氧核苷酸的新方法。本文描述了亚磷酰胺交换反应中所用单体的合成以及与这种新的链组装方式有关的实验细节。亚磷酰胺交换法在每个循环中产生的偶联收率在92-95％的范围内，并且无需进行仪器修饰即可合成嵌合的氨基磷酸酯/磷酸二酯或氨基磷酸酯/硫代磷酸酯寡核苷酸。

  DOI：

  10.1021/jo970801t

文献信息

• Hybrids of macrolides and nucleobases or nucleosides
  作者：Anna M Costa、Jaume Vilarrasa

  DOI：10.1016/s0040-4039(00)00417-2

  日期：2000.4

  examples of hybrids/conjugates/chimeras of erythromycin A derivatives and nucleobases (uracil and thymine) or thymidine-derived nucleosides are reported. Linkers and reaction conditions have been investigated to avoid the degradation of the macrolide moiety (glycoside hydrolysis, ring cleavage, dehydration, etc.).

  报道了红霉素A衍生物和核碱基（尿嘧啶和胸腺嘧啶）或胸苷衍生的核苷的杂合体/结合物/嵌合体的一些实例。已经研究了接头和反应条件，以避免大环内酯部分的降解（糖苷水解，环裂解，脱水等）。
• Catalytic Reductions Without External Hydrogen Gas: Broad Scope Hydrogenations with Tetrahydroxydiboron and a Tertiary Amine
  作者：Kirill A. Korvinson、Hari K. Akula、Casina T. Malinchak、Dellamol Sebastian、Wei Wei、Tashrique A. Khandaker、Magdalena R. Andrzejewska、Barbara Zajc、Mahesh K. Lakshman

  DOI：10.1002/adsc.201901099

  日期：2020.1.7

  Facile reduction of aryl halides with a combination of 5% Pd/C, B2(OH)4, and 4‐methylmorpholine is reported. Aryl bromides, iodides, and chlorides were efficiently reduced. Aryl dihalides containing two different halogen atoms underwent selective reduction: I over Br and Cl, and Br over Cl. Beyond these, aryl triflates were efficiently reduced. This combination was broadly general, effectuating reductions

  据报道，结合5％Pd / C，B 2（OH）4和4-甲基吗啉可轻松还原芳基卤化物。有效地还原了芳基溴化物，碘化物和氯化物。含有两个不同卤素原子的芳基二卤化物经过选择性还原：I在Br和Cl之上，Br在Cl之上。除此之外，芳基三氟甲磺酸酯被有效还原。这种组合广泛适用，可实现苄基卤化物和醚，烯烃，炔烃，醛和叠氮化物的还原反应，以及N- Cbz脱保护反应的还原。氰基基团不受影响，但是硝基基团和酮还原程度低。当B 2（OD）4如果将其用于芳基卤化物的还原，则会发生大量的氘化。但是，氢原子的引入竞争并在较慢的反应中增加。4-甲基吗啉被认为是其中H原子的可能来源，但仅将4-甲基吗啉和Pd / C结合不会导致还原。已经观察到氢气与该试剂结合物形成。旨在了解化学反应的实验提出了一个合理的机制，并鉴定了N，N-双（甲基-d 3）吡啶-4-胺（DMAP- d 6）和B 2（OD）4作为有效的组合，使芳烃完全氘化。
• Hydrolytic reactions of 3′-N-phosphoramidate and 3′-N-thiophosphoramidate analogs of thymidylyl-3′,5′-thymidine
  作者：Mikko Ora、Merita Murtola、Sami Aho、Mikko Oivanen

  DOI：10.1039/b313470a

  日期：——

  The diastereomeric thiophosphoramidate analogs [(RP)- and (SP)-3′,5′-Tnp(s)T] 2 and the phosphoramidate analog [3′,5′-TnpT] 3 of thymidylyl-3′,5′-thymidine were prepared and their hydrolytic reactions over the pH-range 1–8 at 363.2 K were followed by RP HPLC. At pH < 6, an acid-catalyzed P–N3′ bond cleavage (first-order in [H+]) takes place with both 3′,5′-Tnp(s)T and 3′,5′-TnpT, the former being about 12 fold more stable than the latter. At pH > 4, Tnp(s)T undergoes two competing pH-independent reactions, desulfurization (yielding TnpT) and depyrimidination (cleavage of the N-glycosidic bond) the rates of which are of the same order of magnitude. Also with 3′,5′-TnpT the pH-independent depyrimidination competes with P–N3′ cleavage at pH > 5.

  硫代磷酰胺酯类似物[(RP)-和(SP)-3′,5′-Tnp(s)T]2以及磷酰胺酯类似物[3′,5′-TnpT]3的胸苷基-3′,5′-胸苷被制备出来，并在363.2 K下通过反相高效液相色谱法跟踪了它们在pH范围1至8的水解反应。在pH < 6时，酸催化的P-N3′键断裂（[H+]的一级反应）在3′,5′-Tnp(s)T和3′,5′-TnpT中都会发生，前者比后者稳定约12倍。在pH > 4时，Tnp(s)T会经历两种竞争性的pH无关反应，去硫化（生成TnpT）和去嘧啶化（N-糖苷键断裂），这两种反应的速率是同一数量级的。同样，3′,5′-TnpT在pH > 5时，pH无关的去嘧啶化与P-N3′键断裂竞争。
• A new synthetic method for the preparation of nucleoside phosphoramidate analogues with the nitrogen atom in bridging positions of the phosphoramidate linkage
  作者：Inger Kers、Jacek Stawiński、Adam Kraszewski

  DOI：10.1016/s0040-4039(97)10734-1

  日期：1998.3

  An efficient method for the preparation of nucleoside P3′→N5′ and N3′→P5′ phosphoramidates and their thio analogues results from generation of a pyridine adduct of a nucleoside metaphosphate or its analogue from a nucleoside H-phosphonate, nucleoside H-phosphonothioate or nucleoside H-phosphonodithioate monoester followed by its reaction with 5′- or 3′-aminonucleoside.

  制备核苷P3'→N5'和N3'→P5'氨基磷酸酯及其硫代类似物的有效方法是由核苷H-膦酸酯，核苷H-膦硫代酸酯或核苷H-膦二硫代磷酸单酯，然后与5'-或3'-氨基核苷反应。
• Electrochemically Driven, Ni-Catalyzed Aryl Amination: Scope, Mechanism, and Applications
  作者：Yu Kawamata、Julien C. Vantourout、David P. Hickey、Peng Bai、Longrui Chen、Qinglong Hou、Wenhua Qiao、Koushik Barman、Martin A. Edwards、Alberto F. Garrido-Castro、Justine N. deGruyter、Hugh Nakamura、Kyle Knouse、Chuanguang Qin、Khalyd J. Clay、Denghui Bao、Chao Li、Jeremy T. Starr、Carmen Garcia-Irizarry、Neal Sach、Henry S. White、Matthew Neurock、Shelley D. Minteer、Phil S. Baran

  DOI：10.1021/jacs.9b01886

  日期：2019.4.17

  C-N cross-coupling is one of the most valuable and widespread transformations in organic synthesis. Largely dominated by Pd- and Cu-based catalytic systems, it has proven to be a staple transformation for those in both academia and industry. The current study presents the development and mechanistic understanding of an electrochemically driven, Ni-catalyzed method for achieving this reaction of high

  CN 交叉偶联是有机合成中最有价值和最广泛的转化之一。它主要由 Pd 和 Cu 基催化系统主导，已被证明是学术界和工业界人士的主要转变。目前的研究展示了一种电化学驱动的镍催化方法的发展和机理理解，以实现这种具有高度战略重要性的反应。通过一系列电化学、计算、动力学和经验实验，该反应的关键机制特征已被揭开，从而产生了适用于广泛芳基卤化物和胺亲核试剂的第二代条件，包括复杂的例子寡肽、药用杂环、天然产物和糖。