8-Aza-2'-deoxy-adenosine | 4229-57-6

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 三唑并嘧啶类
• 英文名称: 8-Aza-2'-deoxy-adenosine
• 英文别名: 7-amino-3-(2-deoxy-β-D-erythro-pentofuranosyl)-3H-1,2,3-triazolo[4,5-d]pyrimidine；8-aza-2’-deoxyadenosine；8-aza-2'-deoxyadenosine；2'-Deoxy-8-azaadenosine；(2R,3S,5R)-5-(7-aminotriazolo[4,5-d]pyrimidin-3-yl)-2-(hydroxymethyl)oxolan-3-ol
• CAS: 4229-57-6；4229-58-7；34698-66-3
• 化学式: C₉H₁₂N₆O₃
• 分子量: 252.233
• InChiKey: SWPYSGBHZQYENP-KVQBGUIXSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -1.3
• 重原子数：
  18
• 可旋转键数：
  2
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.56
• 拓扑面积：
  132
• 氢给体数：
  3
• 氢受体数：
  8

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  8-Aza-2'-deoxy-adenosine 在 三甲基氯硅烷 、 N,N-二异丙基乙胺 作用下， 以 吡啶 、 二氯甲烷 为溶剂， 反应 6.25h， 生成 N-[3-[(2R,4S,5R)-5-[[bis(4-methoxyphenyl)-phenylmethoxy]methyl]-4-[2-cyanoethoxy-[di(propan-2-yl)amino]phosphanyl]oxyoxolan-2-yl]triazolo[4,5-d]pyrimidin-7-yl]-2-methylpropanamide
  参考文献：
  名称：

  8-氮杂腺苷及其2'-脱氧核糖核苷：合成及其寡核苷酸碱基对稳定性

  摘要：

  8-氮杂腺苷（1a； z 8 A）的合成已通过SnCl 4催化的8氮杂腺嘌呤（4）与1,2,3,5-四-O-乙酰基-β-D-核呋喃糖的糖基化作用（5），随后分离区域异构体6和7并随后脱乙酰。核糖核苷1a及其2'-脱氧衍生物1b（z 8 A d）被转化为寡核苷酸结构单元-膦酸酯2以及亚磷酰胺3和19。它们用于制备寡核糖核苷酸（z 8 A-U）6和寡脱氧核糖核苷酸。与包含A d或A残基的那些相比，修饰的双链体的T m值和双链体形成的热力学数据没有显示出显着变化。这表明发现的用于单体核苷的8-氮杂腺嘌呤碱基的立体电子效应对双链体稳定性仅具有较小的影响。

  DOI：

  10.1002/hlca.19980810527
• 作为产物：
  描述：

  1-Α-氯-3,5-二-O-对甲苯甲酰基-2-脱氧-D-呋喃核糖 在 氨 、 potassium carbonate 作用下， 以 甲醇 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 13.0h， 生成 8-Aza-2'-deoxy-adenosine
  参考文献：
  名称：

  8-Aza-2'-脱氧腺苷和相关的7-氨基-3 H -1,2,3-三唑并[4,5- d ]嘧啶2'-脱氧核糖呋喃糖苷的合成：通过核碱基阴离子的立体选择性糖基化

  摘要：

  合成8-氮杂-2'-脱氧腺苷（= 7-氨基-3 H -1,2,3三唑并[4,5- d ]嘧啶N 3-（2'-脱氧-β-D-呋喃呋喃糖苷）；描述了1）以及N 2-和N 1-（2'-脱氧-β-D-呋喃核糖苷）2和3。的7-氨基-3阴离子的糖基化ħ -1,2,3-三唑并[4,5- d ]嘧啶（6在DMF中），得到3区域异构保护2'-脱氧β-d-ribofuranosides，即所述Ñ 3-，N 2-和N 4-糖基化异构体7（14％），9（11％）和11（3％），以及几乎等量的α-D-异头物8（13％），10（12％）和12（4％；方案1）。反应变成立体选择性的β-d核苷如果-7-甲氧基- 3的阴离子ħ -1,2,3-三唑并[4,5- d ]嘧啶（13）在MeCN中糖基化：仅Ñ 3 - ，N 2和N 1-（2'-deoxy-β-D-nucleosides）14（29％），15（32％）和16分别形成了（23％）（方案2）。NH

  DOI：

  10.1002/hlca.19890720715

文献信息

• Process for selectively producing 1-phosphorylated sugar derivative anomer and process for producing nucleoside
  申请人：——

  公开号：US20020193314A1

  公开（公告）日：2002-12-19

  A desired isomer is selectively prepared by phosphorolyzing and isomerizing an anomer mixture of a 1-phosphorylated saccharide derivative while crystallizing one of the isomers to displace the equilibrium. Furthermore, using the action of a nucleoside phosphorylase, a nucleoside is prepared from the 1-phosphorylated saccharide derivative obtained and a base with improved stereoselectivity and a higher yield. This process is an anomer-selective process for preparing a 1-phosphorylated saccharide derivative and a nucleoside.

  通过磷酸解和异构化1-磷酸化糖衍生物的环式异构体混合物，有选择性地制备所需的异构体，同时通过结晶其中一种异构体以移动平衡。此外，利用核苷酸磷酸化酶的作用，从获得的1-磷酸化糖衍生物和一种改善立体选择性和更高产率的碱基中制备核苷酸。该过程是用于制备1-磷酸化糖衍生物和核苷酸的环式选择性过程。
• Synthesis of 2-Deoxy-β-D-ribonucleosides and 2,3-Dideoxy-β-D-pentofuranosides on Immobilized Bacterial Cells
  作者：Ivan Votruba、Antonín Holý、Hana Dvořáková、Jaroslav Günter、Dana Hocková、Hubert Hřebabecký、Tomas Cihlar、Milena Masojídková

  DOI：10.1135/cccc19942303

  日期：——

  Alginate gel-entrapped cells of auxotrophic thymine-dependent strain of E. coli catalyze the transfer of 2-deoxy-D-ribofuranosyl moiety of 2'-deoxyuridine to purine and pyrimidine bases as well as their aza and deaza analogs. All experiments invariably gave β-anomers; in most cases, the reaction was regiospecific, affording N⁹-isomers in the purine and N¹-isomers in the pyrimidine series. Also a 2,3-dideoxynucleoside can serve as donor of the glycosyl moiety. The acceptor activity of purine bases depends only little on substitution, the only condition being the presence of N⁷-nitrogen atom. On the other hand, in the pyrimidine series the activity is limited to only a narrow choice of mostly short 5-alkyl and 5-halogeno uracil derivatives. Heterocyclic bases containing amino groups are deaminated; this can be avoided by conversion of the base to the corresponding N-dimethylaminomethylene derivative which is then ammonolyzed. The method was verified by isolation of 9-(2-deoxy-β-D-ribofuranosyl) derivatives of adenine, guanine, 2-chloroadenine, 6-methylpurine, 8-azaadenine, 8-azaguanine, 1-deazaadenine, 3-deazaadenine, 1-(2-deoxy-β-D-ribofuranosyl) derivatives of 5-ethyluracil, 5-fluorouracil, and 9-(2,3-dideoxy-β-D-pentofuranosyl)hypoxanthine, 9-(2,3-dideoxy-β-D-pentofuranosyl)-6-methylpurine, and other nucleosides.

  藻酸盐凝胶包埋的辅助胸腺嘧啶依赖菌株大肠杆菌细胞催化2'-脱氧尿嘧啶的2-脱氧-D-核糖呋喃基团转移到嘌呤和嘧啶碱基以及它们的氮杂和去氮类似物。所有实验都不可避免地产生β-异构体；在大多数情况下，反应是区域特异性的，产生嘌呤中的N⁹-异构体和嘧啶系列中的N¹-异构体。此外，2,3-二脱氧核苷酸可以作为糖基团的供体。嘌呤碱基的受体活性仅在取代上有少许影响，唯一的条件是存在N⁷-氮原子。另一方面，在嘧啶系列中，活性仅限于大多数短链5-烷基和5-卤代尿嘧啶衍生物的狭窄选择。含氨基的杂环碱基会发生脱氨作用；可以通过将碱基转化为相应的N-二甲氨基甲烯基衍生物来避免这种情况，然后进行氨解作用。该方法通过分离腺嘌呤、鸟嘌呤、2-氯腺嘌呤、6-甲基嘌呤、8-氮杂腺嘌呤、8-氮杂鸟嘌呤、1-去氮腺嘌呤、3-去氮腺嘌呤的9-(2-脱氧-β-D-核糖呋喃基)衍生物，5-乙基尿嘧啶、5-氟尿嘧啶的1-(2-脱氧-β-D-核糖呋喃基)衍生物，以及9-(2,3-二脱氧-β-D-戊呋喃基)缺氧嘌呤、9-(2,3-二脱氧-β-D-戊呋喃基)-6-甲基嘌呤和其他核苷酸的验证。
• Chemical Morphing of DNA Containing Four Noncanonical Bases
  作者：Elena Eremeeva、Michail Abramov、Lia Margamuljana、Jef Rozenski、Valerie Pezo、Philippe Marlière、Piet Herdewijn

  DOI：10.1002/anie.201601529

  日期：2016.6.20

  The ability of alternative nucleic acids, in which all four nucleobases are substituted, to replicate in vitro and to serve as genetic templates in vivo was evaluated. A nucleotide triphosphate set of 5‐chloro‐2′‐deoxyuridine, 7‐deaza‐2′‐deoxyadenosine, 5‐fluoro‐2′‐deoxycytidine, and 7‐deaza‐2′deoxyguanosine successfully underwent polymerase chain reaction (PCR) amplification using templates of different

  评估了替代核酸（其中所有四个核碱基均被取代）在体外复制并在体内用作遗传模板的能力。使用5-氯-2'-脱氧尿苷，7-脱氮-2'-脱氧腺苷，5-氟-2'-脱氧胞苷和7-脱氮-2'脱氧鸟苷的三磷酸核苷酸组成功地通过聚合酶链反应（PCR）扩增不同长度（57或525mer）的模板和Taq或Vent（exo-）DNA聚合酶作为催化剂。此外，使用这些完全取代的核苷酸通过PCR产生了编码二氢叶酸还原酶的完全变形基因，并被证明可以转化并赋予甲氧苄啶对大肠杆菌的抗性。这些结果表明完全修饰的模板可以被细菌复制机制准确读取，并提供了一个长的完全修饰的DNA分子在体内起作用的第一个例子。
• Enzymatic Synthesis of 2′-Deoxy-β-d-ribonucleosides of 8-Azapurines and 8-Aza-7-deazapurines
  作者：Igor Mikhailopulo、Vladimir Stepchenko、Frank Seela、Roman Esipov、Anatoly Miroshnikov、Yuri Sokolov

  DOI：10.1055/s-0031-1290679

  日期：2012.6

  2′-deoxyguanosine, 2′-deoxycytidine, 2′-deoxyuridine, and 2′-deoxythymidine as 2-deoxy- d -ribofuranose donors and recombinant E. coli purine nucleoside phosphorylase (PNP) as biocatalyst, and (ii) one-pot synthesis from 2-deoxy- d -ribose and nucleobases employing recombinant E. coli ribokinase (RK), phosphopentomutase (PPM) and PNP as biocatalysts. Good substrate activity was observed for all bases studied

  已经研究了 8-氮杂嘌呤和 8-氮杂-7-脱氮嘌呤 2'-脱氧核糖核苷的酶促合成。已使用两种方法：(i) 使用 2'-脱氧鸟苷、2'-脱氧胞苷、2'-脱氧尿苷和 2'-脱氧胸苷作为 2-脱氧-d-呋喃核糖供体和重组大肠杆菌嘌呤核苷磷酸化酶 (PNP) 的转糖基化) 作为生物催化剂，以及 (ii) 使用重组大肠杆菌核糖激酶 (RK)、磷酸戊糖变位酶 (PPM) 和 PNP 作为生物催化剂，从 2-脱氧-d-核糖和核碱基一锅法合成。除了 2-amino-8-aza-6-chloro-7-deazapurine 外，所有研究的碱基都观察到了良好的底物活性，由于碱基的溶解度非常低和 C6 的部分替代，它以中等产率提供了所需的 N 9-核苷-氯原子并与羟基形成核苷。E. Ser90 Oγ 的参与。
• [EN] MODIFIED DNA-ENCODED CHEMICAL LIBRARY AND METHODS RELATED THERETO<br/>[FR] BIBLIOTHÈQUE CHIMIQUE D'ADN CODÉ MODIFIÉ ET PROCÉDÉS ASSOCIÉS
  申请人：UNIV DORTMUND TECH

  公开号：WO2021191333A1

  公开（公告）日：2021-09-30

  The present invention relates to a compound library comprising a plurality of conjugate molecules, wherein said conjugates comprise a small organic molecule covalently coupled to a nucleic acid moiety, wherein the nucleic acid moiety comprises or consists of 7-deazapurines and/or 7-deaza-8-azapurines, and, optionally, modified and/or unmodified pyrimidine nucleotides. Further, the present invention relates to the use of said library for screening compounds binding to a target molecule and methods of synthesizing said library.

  本发明涉及一种化合物库，其中包含多个共轭分子，所述共轭物包含一个小有机分子与一个核酸基团共价耦合，其中核酸基团包含或仅包含7-脱氮嘌呤和/或7-脱氮-8-氮杂嘧啶，以及可选的修饰和/或未修饰的嘧啶核苷酸。此外，本发明还涉及使用该库筛选与目标分子结合的化合物和合成该库的方法。