N⁴-(5-aminopentyl)-N¹,N⁸-bis(tert-butoxycarbonyl)spermidine | 178212-40-3

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 英文名称: N⁴-(5-aminopentyl)-N¹,N⁸-bis(tert-butoxycarbonyl)spermidine
• 英文别名: tert-butyl N-[3-[5-aminopentyl-[4-[(2-methylpropan-2-yl)oxycarbonylamino]butyl]amino]propyl]carbamate
• CAS: 178212-40-3
• 化学式: C₂₂H₄₆N₄O₄
• 分子量: 430.632
• InChiKey: UHHJDOSFLTZURY-UHFFFAOYSA-N

物化性质

• 沸点：
  558.1±45.0 °C(Predicted)
• 密度：
  1.007±0.06 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  2.9
• 重原子数：
  30
• 可旋转键数：
  18
• 环数：
  0.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.91
• 拓扑面积：
  106
• 氢给体数：
  3
• 氢受体数：
  6

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  N⁴-(5-aminopentyl)-N¹,N⁸-bis(tert-butoxycarbonyl)spermidine 在 盐酸 作用下， 以 1,4-二氧六环 、 苯酚 为溶剂， 反应 4.25h， 生成 N⁴-(5-(9-aminoacridinyl)pentyl)spermidine tetrahydrochloride
  参考文献：
  名称：

  多胺同系物对多胺-（DNA-嵌入剂）缀合物的转运和细胞毒性特性的影响。

  摘要：

  开发了一种有效的五步合成方法来获得亚系列的亚精胺啶和亚精胺蒽共轭物。所述衍生物由在其N4位置通过脂肪族链共价拴系到an啶或蒽核的亚精胺片段（例如亚精胺-[脂族系链] -ac啶）组成。通过使用分别由四个或五个亚甲基单元组成的不同系链，改变了亚精胺和芳香核之间的距离。这些配体（2-5）已显示在10 microM时抑制人DNA拓扑异构酶II（TOPO-II）活性。酶活性被评估为解链（断端）和切割动素体DNA（kDNA）的能力。与9-氨基ac啶和9-（N-丁基）氨基ac啶对照（在10μM下）相比，多胺缀合不破坏the啶-亚精胺缀合物2和3抑制TOPO-II活性的能力。通常，the啶衍生物（2和3）显示出比其蒽对应物（4和5）更高的TOPO-II抑制活性。但是，这种趋势在L1210（鼠白血病）细胞的全细胞试验中被逆转，其中蒽类似物比than啶类似物更有效。在这方面，基于定性酶的测定不能预测相应IC（

  DOI：

  10.1021/jo0002792
• 作为产物：
  描述：

  亚精胺 在 镍 氢气 、 potassium carbonate 作用下， 以 四氢呋喃 、 ammonium hydroxide 、 乙醇 、 乙腈 为溶剂， 反应 83.0h， 生成 N⁴-(5-aminopentyl)-N¹,N⁸-bis(tert-butoxycarbonyl)spermidine
  参考文献：
  名称：

  多胺同系物对多胺-（DNA-嵌入剂）缀合物的转运和细胞毒性特性的影响。

  摘要：

  开发了一种有效的五步合成方法来获得亚系列的亚精胺啶和亚精胺蒽共轭物。所述衍生物由在其N4位置通过脂肪族链共价拴系到an啶或蒽核的亚精胺片段（例如亚精胺-[脂族系链] -ac啶）组成。通过使用分别由四个或五个亚甲基单元组成的不同系链，改变了亚精胺和芳香核之间的距离。这些配体（2-5）已显示在10 microM时抑制人DNA拓扑异构酶II（TOPO-II）活性。酶活性被评估为解链（断端）和切割动素体DNA（kDNA）的能力。与9-氨基ac啶和9-（N-丁基）氨基ac啶对照（在10μM下）相比，多胺缀合不破坏the啶-亚精胺缀合物2和3抑制TOPO-II活性的能力。通常，the啶衍生物（2和3）显示出比其蒽对应物（4和5）更高的TOPO-II抑制活性。但是，这种趋势在L1210（鼠白血病）细胞的全细胞试验中被逆转，其中蒽类似物比than啶类似物更有效。在这方面，基于定性酶的测定不能预测相应IC（

  DOI：

  10.1021/jo0002792

文献信息

• METHODS AND COMPOSITIONS RELATED TO NUCLEIC ACID BINDING ASSAYS
  申请人：Nubad, LLC

  公开号：US20140024137A1

  公开（公告）日：2014-01-23

  Small molecule fluorescent probes for established drug targets such as nucleic acids including DNA and RNA has been developed and disclosed herein. These nucleic acid probes bind to multiple DNA and RNA structures, and to sites crucial for nucleic acid function, such as DNA and RNA major grooves. Displacement of the probes by other binders such as small molecule compounds and/or proteins illicits a fluorescence change in the probe that once detected and analyzed provide binding information of these other binders of interest. Similarly, changes in fluorescence upon binding of the probes to nucleic acid have been applied to screen nucleic acid of different sequence and conformation. The nucleic acid probes and method of uses disclosed herein are advantageously suitable for high-through put screening of libraries of small molecule compounds, proteins, and nucleic acids.
• US9017943B2
  申请人：——

  公开号：US9017943B2

  公开（公告）日：2015-04-28
• US9410186B2
  申请人：——

  公开号：US9410186B2

  公开（公告）日：2016-08-09
• [EN] ANTIRETROVIRAL BASES<br/>[FR] BASES ANTIRETROVIRALES
  申请人：——

  公开号：WO1997027179A2

  公开（公告）日：1997-07-31

  [EN] The invention relates to the use of a compound of formula (I), wherein R1 and R2 are independently amino, N-alkylamino, N,N-dialkylamino, cycloalkylamino, amidino, N-lower alkylamidino, N,N-di-lower alkylamidino, guanidino, N-lower alkylguanidino, N,N-di-lower alkylguanidino or (a); X and Y are independently selected from the group consisting of -(CH2)b-, (b), (c) and -(CH2)g-Cycloalkylen-(CH2)h-; Z is, independently of X and Y, -(CH2)b-, (d) or (e), wherein R is hydrogen or lower alkyl; Q is aryl, arylcarbonyl, arylaminocarbonyl, heterocyclyl, heterocyclylcarbonyl or heterocyclylaminocarbonyl, aryl or heterocyclyl whenever mentioned containing 2 or more annelated rings, a is 2 to 4, b is 2-7, c, d, e and f is 1 to 3, respectively, g and h is 0 to 3, respectively, i is 2 to 7 and k is 1 to 3, with the proviso that Q is arylcarbonyl, arylaminocarbonyl, heterocyclylcarbonyl or heterocyclylaminocarbonyl only if Z is a bivalent radical of formula (f) or (g); a tautomer thereof, or a salt thereof, as antiretroviral therapeutic (also for prophylaxis) inhibiting the interaction of transcriptional regulators with retroviral response elements.
  [FR] L'invention concerne l'utilisation d'un composé de la formule (I). Dans cette formule, R1 et R2 représentent indépendamment amino, N-alkylamino, N,N-dialkylamino, cycloalkylamino, amidino, N-alkylamidino inférieur, N,N-dialkylamidino inférieur, guanidino, N-alkylguanidino inférieur, N,N-dialkylguanidino inférieur ou (a); X et Y sont indépendamment choisis dans le groupe se composant de (CH2)b-, (b), (c) et -(CH2)g-Cycloalkylen-(CH2)h-; Z est indépendamment de X et Y, -(CH2)b-, (d) ou (e), où R représente hydrogène ou de alkyle inférieur; Q représente aryle, arylcarbonyle, arylaminocarbonyle, hétérocyclycle, hétérocyclylcarbonyle ou hétérocyclylaminocarbonyle, aryle ou hétérocyclyle contenant chaque fois 2 ou plusieurs chaînes fusionnées; a est compris entre 2 et 4; b est compris entre 2 et 7, c, d, e et f sont compris entre 1 et 3, respectivement, g et h est compris entre 0 et 3, respectivement, i est compris entre 2 et 7 et k est compris entre 1 et 3, à condition que Q soit de l'arylcarbonyle, de l'arylaminocarbonyle, de l'hétérocyclylcarbonyle, ou de l'hétérocyclylaminocarbonyle uniquement si Z est un radical bivalent ayant les formules (f) ou (g); un tautomère de ce dernier, ou un sel de ce dernier, comme agent thérapeutique antirétroviral (ou prophylactique) inhibant l'interaction des régulateurs de la transcription avec des éléments de réponse rétroviraux.
• The Effect of Polyamine Homologation on the Transport and Cytotoxicity Properties of Polyamine−(DNA-Intercalator) Conjugates
  作者：Phanstiel、Harry L. Price、Lu Wang、Jane Juusola、Martin Kline、Sapna Majmundar Shah

  DOI：10.1021/jo0002792

  日期：2000.9.1

  DNA topoisomerase-II (TOPO-II) activity at 10 microM. Enzymatic activity was assessed as the ability to unknot (decatenate) and cleave kinetoplast DNA (kDNA). Polyamine conjugation did not disrupt the ability of the acridine-spermidine conjugates 2 and 3 to inhibit TOPO-II activity as compared with the 9-aminoacridine and 9-(N-butyl)aminoacridine controls (at 10 microM). In general, the acridine derivatives

  开发了一种有效的五步合成方法来获得亚系列的亚精胺啶和亚精胺蒽共轭物。所述衍生物由在其N4位置通过脂肪族链共价拴系到an啶或蒽核的亚精胺片段（例如亚精胺-[脂族系链] -ac啶）组成。通过使用分别由四个或五个亚甲基单元组成的不同系链，改变了亚精胺和芳香核之间的距离。这些配体（2-5）已显示在10 microM时抑制人DNA拓扑异构酶II（TOPO-II）活性。酶活性被评估为解链（断端）和切割动素体DNA（kDNA）的能力。与9-氨基ac啶和9-（N-丁基）氨基ac啶对照（在10μM下）相比，多胺缀合不破坏the啶-亚精胺缀合物2和3抑制TOPO-II活性的能力。通常，the啶衍生物（2和3）显示出比其蒽对应物（4和5）更高的TOPO-II抑制活性。但是，这种趋势在L1210（鼠白血病）细胞的全细胞试验中被逆转，其中蒽类似物比than啶类似物更有效。在这方面，基于定性酶的测定不能预测相应IC（