[14C]methylmalonyl-CoA | 6712-01-2

• 分子结构分类: 有机化合物 - 脂质和类脂质分子 - 脂肪酰基
• 英文名称: [14C]methylmalonyl-CoA
• 英文别名: (2RS)-2-methyl-3-ketobutyryl-CoA；2-methyl-3-oxobutyryl coenzyme A；2-methyl-3-oxobutyryl-CoA；2-Methylacetoacetyl-coa；S-[2-[3-[[(2R)-4-[[[(2R,3S,4R,5R)-5-(6-aminopurin-9-yl)-4-hydroxy-3-phosphonooxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-hydroxyphosphoryl]oxy-2-hydroxy-3,3-dimethylbutanoyl]amino]propanoylamino]ethyl] 2-methyl-3-oxobutanethioate
• CAS: 6712-01-2
• 化学式: C₂₆H₄₂N₇O₁₈P₃S
• 分子量: 865.643
• InChiKey: NHNODHRSCRALBF-NQNBQJKNSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -5.2
• 重原子数：
  55
• 可旋转键数：
  22
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.65
• 拓扑面积：
  406
• 氢给体数：
  9
• 氢受体数：
  23

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  4-甲基吡啶-2-甲酸 、 [14C]methylmalonyl-CoA 在 还原型辅酶II(NADPH)四钠盐 EntB(EpoB) 、 氢氧化钾 作用下， 生成 甲基丙二酸 、
  参考文献：
  名称：

  埃博霉素中间体与其他起始单元的生物合成：工程化聚酮化合物-非核糖体界面。

  摘要：

  DOI：

  10.1002/anie.200352077
• 作为产物：
  描述：

  (R)-3-(2,2,5,5-tetramethyl-1,3-dioxane-4-carboxamido)propanoic acid 在 CoaA, CoaD and CoaE enzymes were amplified from a colony of E_. coli BL₂₁(DE₃) 、 benzotriazol-1-yloxyl-tris-(pyrrolidino)-phosphonium hexafluorophosphate 、 N,N-二异丙基乙胺 作用下， 以 二氯甲烷 、 二甲基亚砜 、 甲苯 为溶剂， 反应 36.0h， 生成 [14C]methylmalonyl-CoA
  参考文献：
  名称：

  酰基辅酶A底物的化学酶法合成使小分子和蛋白质的原位标记成为可能。

  摘要：

  描述了一种化学酶促方法，其产生全功能的酰基辅酶A分子，然后将其用作底物以驱动原位酰基转移反应。还说明了基于质谱的测定法，以验证酰基辅酶A酶产物的身份。该方法响应于可以修饰为其相应的辅酶A硫酯的各种羧酸，在利用酰基辅酶A底物的广泛化学生物学研究中具有潜在的应用前景。

  DOI：

  10.1021/acs.orglett.5b02113

文献信息

• Discovery and Engineering of Pathways for Production of α-Branched Organic Acids
  作者：Michael R. Blaisse、Hongjun Dong、Beverly Fu、Michelle C. Y. Chang

  DOI：10.1021/jacs.7b07400

  日期：2017.10.18

  branch using a propionyl-CoA extender unit. Engineering synthetic pathways for production of α-methyl acids in Escherichia coli using these enzymes allows the construction of microbial strains that produce either chiral 2-methyl-3-hydroxy acids (1.1 ± 0.2 g L-1) or branched enoic acids (1.12 ± 0.06 g L-1) in the presence of a dehydratase at 44% and 87% yield of fed propionate, respectively. In vitro characterization

  基于细胞的合成为从简单的可再生碳源制备小分子提供了许多机会，通过将多个反应伸缩到一个发酵步骤中。该领域的一个挑战是开发酶促碳-碳键形成循环，使目标结构模块化断开为细胞构建块。在这方面，基于硫解酶催化酰基辅酶 A (CoA) 底物之间初始碳-碳键形成步骤的合成途径为生物合成提供了通用途径，但目前此类途径的底物多样性有限。在本报告中，我们描述了参与蛔虫蛔虫中分支酸产生的硫解酶-酮还原酶对的鉴定和生化表征，这证明了使用丙酰辅酶 A 扩展单元形成具有 α-甲基支链的产物的选择性。使用这些酶在大肠杆菌中设计用于生产 α-甲基酸的工程合成途径，可以构建生产手性 2-甲基-3-羟基酸 (1.1 ± 0.2 g L-1) 或支链烯酸 (1.12 ± 0.06 g L-1) 在脱水酶的存在下，进料丙酸盐的产率分别为 44% 和 87%。体外表征和体内分析表明，酮还原酶是选择性的关键驱动因素，即使与高度偏爱无
• [EN] COMPOSITIONS AND METHODS USEFUL FOR TREATING DISEASES CHARACTERIZED BY INSUFFICIENT PANTOTHENATE KINASE ACTIVITY<br/>[FR] COMPOSITIONS ET MÉTHODES UTILES DANS LE TRAITEMENT DE MALADIES SE CARACTÉRISANT PAR UNE ACTIVITÉ INSUFFISANTE DE LA PANTOTHÉNATE KINASE
  申请人：ACIES BIO D O O

  公开号：WO2017218963A1

  公开（公告）日：2017-12-21

  Methods and pharmaceutical compositions for use in treating diseases associated with insufficient activity of the pantothenate kinase enzyme (e.g., CASTOR diseases) are disclosed. The methods and compositions involve an effective amount of an active derivative of 4'-phosphopantetheine.

  本发明揭示了用于治疗与泛酰胺激酶酶活性不足相关疾病（例如CASTOR疾病）的方法和药物组合物。这些方法和组合物涉及有效量的4'-磷酰泛酰胺的活性衍生物。
• New genes related to a process for the production of fine chemicals
  申请人：Metanomics GmbH

  公开号：EP1953235A2

  公开（公告）日：2008-08-06

  The present invention relates to a process for the production of the fine chemical in a microorganism, a plant cell, a plant, a plant tissue or in one or more parts thereof. The invention furthermore relates to nucleic acid molecules, polypeptides, nucleic acid constructs, vectors, antisense molecules, antibodies, host cells, plant tissue, propagation material, harvested material, plants, microorganisms as well as agricultural compositions and to their use.

  本发明涉及一种在微生物、植物细胞、植物、植物组织或其一个或多个部分中生产精细化学品的工艺。本发明还涉及核酸分子、多肽、核酸构建体、载体、反义分子、抗体、宿主细胞、植物组织、繁殖材料、收获材料、植物、微生物以及农业组合物及其用途。
• Process for the production of lutein
  申请人：Metanomics GmbH

  公开号：EP2096177A2

  公开（公告）日：2009-09-02

  The present invention relates further to a process for the control of the production of fine chemical in a microorganism, a plant cell, a plant, a plant tissue or in one or more parts thereof. The invention furthermore relates to nucleic acid molecules, polypeptides, nucleic acid constructs, vectors, antisense molecules, antibodies, host cells, plant tissue, propagation material, harvested material, plants, microorganisms as well as agricultural compositions and to their use.

  本发明还涉及一种控制微生物、植物细胞、植物、植物组织或其一个或多个部分生产精细化学品的工艺。本发明还涉及核酸分子、多肽、核酸构建体、载体、反义分子、抗体、宿主细胞、植物组织、繁殖材料、收获材料、植物、微生物以及农业组合物及其用途。
• Probe compound for detecting and isolating enzymes and means and methods using the same
  申请人：Helmholtz-Zentrum für Infektionsforschung GmbH

  公开号：EP2230312A1

  公开（公告）日：2010-09-22

  The present invention relates to a probe compound that can comprise any substrate or metabolite of an enzymatic reaction in addition to an indicator component, such as, for example, a fluorescence dye, or the like. Moreover, the present invention relates to means for detecting enzymes in form of an array, which comprises any number of probe compounds of the invention which each comprise a different metabolite of interconnected metabolites representing the central pathways in all forms of life. Moreover, the present invention relates to a method for detecting enzymes involving the application of cell extracts or the like to the array of the invention which leads to reproducible enzymatic reactions with the substrates. These specific enzymatic reactions trigger the indicator (e.g. a fluorescence signal) and bind the enzymes to the respective cognate substrates. Moreover, the invention relates to means for isolating enzymes in form of nanoparticles coated with the probe compound of the invention. The immobilisation of the cognate substrates or metabolites on the surface of nanoparticles by means of the probe compounds allows capturing and isolating the respective enzyme, e.g. for subsequent sequencing.

  本发明涉及一种探针化合物，它可以包括酶反应的任何底物或代谢物，此外还包括指示成分，例如荧光染料或类似物。此外，本发明还涉及以阵列形式检测酶的方法，该阵列由任意数量的本发明探针化合物组成，每种探针化合物由代表所有生命形式中中心途径的相互关联的代谢物中的不同代谢物组成。此外，本发明还涉及一种检测酶的方法，该方法涉及将细胞提取物或类似物应用于本发明的阵列，从而导致与底物发生可重复的酶反应。这些特定的酶反应会触发指示剂（如荧光信号），并将酶与各自的同源底物结合。此外，本发明还涉及以涂覆有本发明探针化合物的纳米颗粒形式分离酶的方法。通过探针化合物将同源底物或代谢物固定在纳米颗粒表面，可以捕获和分离相应的酶，例如用于后续测序。