ethyl 5-(p-trimethoprimoxy)valerate | 957466-88-5

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 苯和取代衍生物
• 英文名称: ethyl 5-(p-trimethoprimoxy)valerate
• 英文别名: ethyl 5-(4-((2,4-diaminopyrimidin-5-yl)methyl)-2,6-dimethoxyphenoxy)pentanoate；Ethyl 5-[4-[(2,4-diaminopyrimidin-5-yl)methyl]-2,6-dimethoxyphenoxy]pentanoate
• CAS: 957466-88-5
• 化学式: C₂₀H₂₈N₄O₅
• 分子量: 404.466
• InChiKey: WJKTVYNZYIJXCT-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  1.9
• 重原子数：
  29
• 可旋转键数：
  12
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.45
• 拓扑面积：
  132
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  9

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  ethyl 5-(p-trimethoprimoxy)valerate 在 O-(1,2-dihydro-2-oxo-1-pyridyl)-N,N,N',N'-tetramethyluronium tetrafluoroborate 、 copper(II) sulfate 、 sodium ascorbate 、 三乙胺 、 sodium hydroxide 、 三[(1-苄基-1H-1,2,3-三唑-4-基)甲基]胺 作用下， 以 甲醇 、 水 、 N,N-二甲基甲酰胺 、 叔丁醇 为溶剂， 反应 21.08h， 生成
  参考文献：
  名称：

  甲氨蝶呤在MASPIT优化中作为固定锚部分的替代试剂：合成和生物学评估

  摘要：

  抛锚：对两种化学二聚体方法（TMP和SNAP标签）进行了评估，以提高系统的灵敏度，该系统可在完整的人类细胞中进行小分子靶蛋白分析。他莫昔芬的融合化合物与原核生物特异的DHFR配体束缚在一起，产生的剂量反应曲线向EC 50值明显降低，比原始MTX同系物的EC 50值低。

  DOI：

  10.1002/cbic.201402702
• 作为产物：
  描述：

  甲氧苄啶 在 氢溴酸 、 caesium carbonate 作用下， 以 水 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 8.33h， 生成 ethyl 5-(p-trimethoprimoxy)valerate
  参考文献：
  名称：

  Modulation of BCR Signaling by the Induced Dimerization of Receptor-Associated SYK

  摘要：

  多价抗原对 B 细胞抗原受体（BCR）的集聚作用通过 SYK 酪氨酸激酶传递给多种细胞内通路，这些通路决定了受体参与的生理后果。为了探索调节交联 BCR 信号数量和质量的因素，我们开发了一种新型二聚化化学介质，以诱导与受体相关的 SYK 聚合。为了实现这一目标，我们将 SYK 与大肠杆菌二氢叶酸还原酶（eDHFR）融合，后者能以高亲和力和选择性结合小分子三甲氧苄啶（TMP），并合成了带有柔性连接体的 TMP 二聚体。TMP 二聚体能在活细胞中诱导与 eDHFR 链接的 SYK 聚合。与 BCR 结合的 SYK 被诱导的二聚化会对下游转录因子的活化产生不同的调节作用，促进活化 T 细胞核因子（NFAT）的活化，而不影响 NFκB 的活化。SYK 的二聚化通过增强其与质膜上交联的 BCR 的相互作用程度和持续时间，增强了钙动员的持续时间而非幅度。

  DOI：

  10.3390/antib6040023

文献信息

• SMALL MOLECULES FOR DUAL FUNCTION POSITRON EMISSION TOMOGRAPHY (PET) AND CELL SUICIDE SWITCHES
  申请人：THE TRUSTEES OF THE UNIVERSITY OF PENNSYLVANIA

  公开号：US20190070321A1

  公开（公告）日：2019-03-07

  The present invention includes an engineered cell comprising a chimeric antigen receptor (CAR) further comprising a nucleic acid molecule comprising a suicide gene comprising a ligand binding domain and a suicide domain wherein the ligand binding domain is capable of binding to radiolabeled tracer or a small molecule suicide switch. This invention also includes methods for inducing apoptosis of an engineered cell, methods for assessing the efficacy or toxicity of an adoptive cell therapy in a subject, methods for detecting the quantity of engineered T cells in a subject, methods for monitoring an immunotherapy treatment in a subject and methods of imaging engineered T cells in a subject. In some embodiments, the imaging is performed via Positron Emission Topography (PET). This invention further includes a chemical inducer of dimerization (CID), wherein the CID is a Bis-Trimethoprim (Bis-TMP).

  本发明包括一种工程细胞，其中包括一个嵌合抗原受体（CAR），进一步包括一个包含自杀基因的核酸分子，该自杀基因包括一个配体结合结构域和一个自杀结构域，其中配体结合结构域能够结合到放射标记示踪剂或小分子自杀开关。该发明还包括诱导工程细胞凋亡的方法，评估在受试者中采用免疫细胞治疗的疗效或毒性的方法，检测受试者中工程T细胞的数量的方法，监测受试者中的免疫治疗方法以及在受试者中成像工程T细胞的方法。在某些实施例中，成像是通过正电子发射断层扫描（PET）进行的。该发明还包括一种化学诱导二聚体化合物（CID），其中CID是双三甲氧苄啶（Bis-TMP）。
• Luminescent Terbium Protein Labels for Time-Resolved Microscopy and Screening
  作者：Harsha E. Rajapakse、D. Rajasekhar Reddy、Shabnam Mohandessi、Nathaniel G. Butlin、Lawrence W. Miller

  DOI：10.1002/anie.200900858

  日期：2009.6.22

  Brilliance of terbium: Heterodimeric conjugates of trimethoprim covalently linked to sensitized terbium chelates bind to Escherichia coli dihydrofolate reductase fusion proteins with nanomolar affinity (see picture). Terbium luminescence enables sensitive and time‐resolved detection of labeled proteins in vitro and on the surface of living mammalian cells.

  铽的光辉：甲氧苄啶的异二聚体偶联物与致敏的铽螯合物共价连接，以纳摩尔亲和力与大肠杆菌二氢叶酸还原酶融合蛋白结合（见图）。铽发光能够在体外和哺乳动物活细胞表面对标记蛋白质进行灵敏且时间分辨的检测。
• Construction of a small-molecule-integrated semisynthetic split intein for in vivo protein ligation
  作者：Tomomi Ando、Shinya Tsukiji、Tsutomu Tanaka、Teruyuki Nagamune

  DOI：10.1039/b712843f

  日期：——

  A new split intein-based protein ligation tool that is synthetically accessible and can be used for protein semisynthesis on the cell surface and potentially inside cells has been constructed.

  构建了一种新的基于分裂内含肽的蛋白质连接工具，该工具可合成，可用于细胞表面和细胞内部的蛋白质半合成。
• SELECTIVE PROTEIN LABELING
  申请人：Miller Larry

  公开号：US20120115128A1

  公开（公告）日：2012-05-10

  The present invention is related to methods of detecting protein-protein interactions in living cells, as well as detecting the formation and/or inhibition of protein-protein interactions in cells.

  本发明涉及在活细胞中检测蛋白质相互作用的方法，以及检测细胞中蛋白质相互作用的形成和/或抑制。
• Small molecules for dual function positron emission tomography (PET) and cell suicide switches
  申请人：THE TRUSTEES OF THE UNIVERSITY OF PENNSYLVANIA

  公开号：US11253616B2

  公开（公告）日：2022-02-22

  The present invention includes an engineered cell comprising a chimeric antigen receptor (CAR) further comprising a nucleic acid molecule comprising a suicide gene comprising a ligand binding domain and a suicide domain wherein the ligand binding domain is capable of binding to radiolabeled tracer or a small molecule suicide switch. This invention also includes methods for inducing apoptosis of an engineered cell, methods for assessing the efficacy or toxicity of an adoptive cell therapy in a subject, methods for detecting the quantity of engineered T cells in a subject, methods for monitoring an immunotherapy treatment in a subject and methods of imaging engineered T cells in a subject. In some embodiments, the imaging is performed via Positron Emission Topography (PET). This invention further includes a chemical inducer of dimerization (CID), wherein the CID is a Bis-Trimethoprim (Bis-TMP).

  本发明包括一种包含嵌合抗原受体（CAR）的工程细胞，该嵌合抗原受体进一步包含自杀基因的核酸分子，该自杀基因包含配体结合结构域和自杀结构域，其中配体结合结构域能够与放射性标记的示踪剂或小分子自杀开关结合。本发明还包括诱导工程细胞凋亡的方法、评估受试者体内采纳细胞疗法的疗效或毒性的方法、检测受试者体内工程T细胞数量的方法、监测受试者体内免疫疗法的方法以及对受试者体内工程T细胞成像的方法。在某些实施方案中，成像是通过正电子发射地形图（PET）进行的。本发明还包括一种二聚化化学诱导剂（CID），其中的 CID 是双三甲氧苄啶（Bis-TMP）。