culicinin D | 889128-40-9

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 肽模拟物
• 英文名称: culicinin D
• 英文别名: (2S)-1-butanoyl-N-[(2S,4S,6R)-6-hydroxy-1-[[1-[[1-[[(2S,4R)-1-[[(2S)-1-[[1-[[(2S)-1-[[3-[[(2S)-1-(2-hydroxyethylamino)propan-2-yl]amino]-3-oxopropyl]amino]-4-methyl-1-oxopentan-2-yl]amino]-2-methyl-1-oxopropan-2-yl]amino]-4-methyl-1-oxopentan-2-yl]amino]-4-methyl-1-oxodecan-2-yl]amino]-2-methyl-1-oxopropan-2-yl]amino]-2-methyl-1-oxopropan-2-yl]amino]-4-methyl-1,8-dioxodecan-2-yl]pyrrolidine-2-carboxamide
• CAS: 889128-40-9
• 化学式: C₆₃H₁₁₅N₁₁O₁₃
• 分子量: 1234.67
• InChiKey: CFLQJUVAEKRCNF-SANVKYMSSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  5.1
• 重原子数：
  87
• 可旋转键数：
  43
• 环数：
  1.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.83
• 拓扑面积：
  352
• 氢给体数：
  12
• 氢受体数：
  14

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  在 1,8-二氮杂双环[5.4.0]十一碳-7-烯 、 2-巯基乙醇 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 1.0h， 以6.31 mg的产率得到culicinin D
  参考文献：
  名称：

  合成抗癌药物 Culicinin D 的改进策略

  摘要：

  抗癌 peptaibol culicinin D 是通过新开发的途径合成的。该途径包括改进的 C 端氨基酸醇结构单元与 2-氯三苯甲基氯树脂的连接。开发了一种利用现成的 Fmoc-丙氨醇作为不寻常的 APAE 构建块的替代品的模型系统，通过 N 锚定第一个 C 末端残基和分子内 O-N 酰基转移来研究树脂负载。Fmoc SPPS 和关键的 O-N 酰基转移的使用提供了一个 C 端醇，能够合成五个相关的 peptaibols 库。然后将该模型系统应用于 culicinin D 的合成。 C 端 APAE 构建块以 67% 的负载率锚定在 2-氯三苯甲基氯树脂上，使用优化条件，以及 culicinin D（6.31 mg，4%) 在肽裂解和 O-N 酰基转移之前通过 SPPS 制备。该合成策略还用于制备包含非天然 (S)-AHMOD 氨基酸的库里奇宁 D 的非对映异构体。

  DOI：

  10.1002/ejoc.201500872

文献信息

• Alanine scan-guided synthesis and biological evaluation of analogues of culicinin D, a potent anticancer peptaibol
  作者：Iman Kavianinia、Louise A. Stubbing、Maria R. Abbattista、Paul W.R. Harris、Jeff B. Smaill、Adam V. Patterson、Margaret A. Brimble

  DOI：10.1016/j.bmcl.2020.127135

  日期：2020.6

  scanning of a potent and readily accessible analogue 23 revealed the effect of each residue on antiproliferative activity, and a small panel of analogues were prepared to explore the SAR of the non-natural amino acid residue (2S,4R)-AMD. Results from the alanine scan were used to design an expanded library of culicinin D analogues, leading to the discovery of cyclohexylalanine analogue 52, which exhibited

  Culicinin D（1）是最初从clavisporces clavisporus分离的10个氨基酸的肽醇，对多种癌细胞系均表现出强大的活性。在我们先前探索不寻常的（2S，4S，6R）-AHMOD残基的构效关系（SAR）的基础上，准备了一系列culicinin D的类似物以进一步研究这些肽的SAR。丙氨酸对有效且易于获得的类似物23的扫描揭示了每个残基对抗增殖活性的影响，并准备了一小组类似物以探索非天然氨基酸残基（2S，4R）-AMD的SAR。丙氨酸扫描的结果被用于设计culicinin D类似物的扩展文库，从而发现了环己基丙氨酸类似物52，
• Synthesis of the Peptaibol Framework of the Anticancer Agent Culicinin D: Stereochemical Assignment of the AHMOD Moiety
  作者：Kuo-yuan Hung、Paul W. R. Harris、Margaret A. Brimble

  DOI：10.1021/ol302852q

  日期：2012.11.16

  The postulated structure of the potent anticancer peptaibol culicinin D has been synthesized using Fmoc-based solid-phase peptide synthesis (SPPS). Comparison of the 1H NMR data for the reported structure of culicinin D with the data obtained for the two synthetic polypeptides epimeric at C-6 in the AHMOD unit established the C-6 stereochemistry of the AHMOD residue in the natural product to be (R)

  使用基于Fmoc的固相肽合成（SPPS）合成了有效的抗癌肽肽culicinin D的假定结构。所报告的culicinin D结构的1 H NMR数据与在AHMOD单元中C-6处的两个合成多肽融合的合成数据的比较确定了天然产物AHMOD残基的C-6立体化学为（R）。
• Improved Strategy for the Synthesis of the Anticancer Agent Culicinin D
  作者：Michaela Stach、Andreas J. Weidkamp、Sung-Hyun Yang、Kuo-yuan Hung、Daniel P. Furkert、Paul W. R. Harris、Jeff B. Smaill、Adam V. Patterson、Margaret A. Brimble

  DOI：10.1002/ejoc.201500872

  日期：2015.10

  enabled the synthesis of a library of five related peptaibols. This model system was then applied to the synthesis of culicinin D. The C-terminal APAE building block was anchored to 2-chlorotrityl chloride resin in 67 % loading yield using the optimised conditions, and culicinin D (6.31 mg, 4 %) was prepared by SPPS prior to peptide cleavage and O–N acyl shift. This synthetic strategy was also used

  抗癌 peptaibol culicinin D 是通过新开发的途径合成的。该途径包括改进的 C 端氨基酸醇结构单元与 2-氯三苯甲基氯树脂的连接。开发了一种利用现成的 Fmoc-丙氨醇作为不寻常的 APAE 构建块的替代品的模型系统，通过 N 锚定第一个 C 末端残基和分子内 O-N 酰基转移来研究树脂负载。Fmoc SPPS 和关键的 O-N 酰基转移的使用提供了一个 C 端醇，能够合成五个相关的 peptaibols 库。然后将该模型系统应用于 culicinin D 的合成。 C 端 APAE 构建块以 67% 的负载率锚定在 2-氯三苯甲基氯树脂上，使用优化条件，以及 culicinin D（6.31 mg，4%) 在肽裂解和 O-N 酰基转移之前通过 SPPS 制备。该合成策略还用于制备包含非天然 (S)-AHMOD 氨基酸的库里奇宁 D 的非对映异构体。