adenylyl-2',5'-adenosine | 2273-76-9

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘌呤核苷酸
• 英文名称: adenylyl-2',5'-adenosine
• 英文别名: Ap(2'-5')A；adenylyl(3'-5')phosphoadenine；A2'p5'A；D,D-A(2'-5')pA；phosphoric acid adenosin-2'-yl ester adenosin-5'-yl ester；[2']Adenylsaeure-adenosin-5'-ylester；adenylyl-(2'->5')-adenosine；Adenylyl-(2'-5')-adenosine；[(2R,3S,4R,5R)-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-dihydroxyoxolan-2-yl]methyl [(2R,3R,4R,5R)-2-(6-aminopurin-9-yl)-4-hydroxy-5-(hydroxymethyl)oxolan-3-yl] hydrogen phosphate
• CAS: 2273-76-9
• 化学式: C₂₀H₂₅N₁₀O₁₀P
• 分子量: 596.453
• InChiKey: CJUIKAWANGRMQE-XPWFQUROSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -4.4
• 重原子数：
  41
• 可旋转键数：
  8
• 环数：
  6.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.5
• 拓扑面积：
  294
• 氢给体数：
  7
• 氢受体数：
  18

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  adenylyl-2',5'-adenosine 在 1,8-[2,2'-(1,4,7-triazacyclonon)dihexyloxy]anthracene-9,10-dione hydrochloride 、 水 作用下， 反应 16.0h， 生成 5'-腺嘌呤核苷酸 、 腺苷
  参考文献：
  名称：

  三氮杂蒽醌-蒽醌缀合物的合成及DNA切割活性†

  摘要：

  1,4,7-三氮杂环壬烷 （TACN），具有DNA裂解能力，通过不同的间隔基连接到蒽醌上，以构建新化合物1,8- [2,2'-（1,4,7-三氮杂环酮）二乙氧基]蒽-9,10-二酮盐酸盐（1）和1,8- [2,2'-（1,4,7-三氮杂环酮）二己氧基]蒽-9,10-二酮盐酸盐（2）作为无金属DNA切割的新剂。荧光和CD光谱研究表明存在嵌入的DNA结合模式，表观DNA结合常数1和2分别为3.93×10 7和6.07×10 7 M -1。具有更长间隔基的化合物2表现出更高的DNA结合能力。在生理介质中，由1和2（0.05 mM）促进的DNA切割的表观初始一级速率常数（k obs）分别为0.077±0.0028和0.123±0.0027 h -1。比父级快51倍和82倍TACN（在相同条件下，k obs为0.0015±0.00003 h -1（0.05 mM））是由于化合物1和2的蒽醌部分通过堆

  DOI：

  10.1039/c0nj00347f
• 作为产物：
  描述：

  5'-腺嘌呤核苷酸 在 2,2'-二硫二吡啶 、 三乙胺 、 三苯基膦 、 alkaline phosphatase 作用下， 以 二甲基亚砜 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 5.0h， 生成 adenylyl-2',5'-adenosine
  参考文献：
  名称：

  使用蒙脱石作为催化剂的无保护基团的核苷酸二聚体合成。

  摘要：

  已经开发了提供包含天然或非天然核苷残基的核苷酸二聚体的合成。在不存在保护基的情况下，将核糖核苷5'-磷酰胺基咪唑化物添加到吸附在蒙脱石上的核苷中性pH下。大约30％的咪唑化物被转化为2'-5'二聚体和3'-5'二聚体，其余的则被水解为5'-单磷酸酯。通过多种组合进行的实验表明，该方法可能会受到限制，包括杂手性和嵌合合成。这种绿色化学方法使得能够从活化的核苷酸本身，具有核苷的活化核苷酸和具有核苷酸5'-单磷酸酯的活化核苷酸合成二聚体。 [本文提供补充材料。转到发布者的在线版《核苷酸，核苷酸和核酸》以查看免费的补充文件。]

  DOI：

  10.1080/15257770.2012.701787

文献信息

• Natural Occurrence of 2′,5′-Linked Heteronucleotides in Marine Sponges
  作者：Annika Lopp、Tönu Reintamm、Anne Kuusksalu、Indrek Tammiste、Arno Pihlak、Merike Kelve

  DOI：10.3390/md8020235

  日期：——

  muricata and Chondrilla nucula are able to catalyze in vivo synthesis of 2-5A as well as the synthesis of a series 2',5'-linked heteronucleotides which accompanied high levels of 2',5'-diadenylates. In dephosphorylated perchloric acid extracts of the sponges, these heteronucleotides were identified as A2'p5'G, A2' p5'U, A2'p5'C, G2'p5'A and G2' p5'U. The natural occurrence of 2'-adenylated NAD(+) was also

  2',5'-寡聚腺苷酸合成酶 (OAS) 作为哺乳动物干扰素诱导的抗病毒酶系统的组成部分，催化细胞 ATP 寡聚化为 2',5'-连接的寡聚腺苷酸 (2-5A)。尽管脊椎动物 OAS 在体外条件下已被表征为 2'-核苷酸转移酶，但从未证明 2-5A 以外的 2',5'-寡核苷酸的自然存在。在这里，我们已经证明来自海洋海绵 Thenea muricata 和 Chondrilla nucula 的 OAS 能够催化 2-5A 的体内合成以及一系列 2',5' 连接的杂核苷酸的合成，这些杂核苷酸伴随着高水平的 2'， 5'-二腺苷酸。在海绵的去磷酸化高氯酸提取物中，这些异核苷酸被鉴定为 A2'p5'G、A2'p5'U、A2' p5'C、G2'p5'A 和 G2'p5'U。还检测到 2'-腺苷酸化 NAD(+) 的自然发生。体外试验表明，除了 ATP 外，GTP 还是海绵 OAS 的良好底物，尤其是来自
• Dinuclear Zn²⁺complexes in the hydrolysis of the phosphodiester linkage in a diribonucleoside monophosphate diester
  作者：Morio Yashiro、Hideki Kaneiwa、Kenichi Onaka、Makoto Komiyama

  DOI：10.1039/b312301d

  日期：——

  Dizinc complexes that were formed from 2 ∶ 1 mixtures of Zn(NO3)2 and dinucleating ligands TPHP (1), TPmX (2) or TPpX (3) in aqueous solutions efficiently hydrolyzed diribonucleoside monophosphate diesters (NpN) under mild conditions. The dinucleating ligand affected the structure of the aquo-hydroxo-dizinc core, resulting in different characteristics in the catalytic activities towards NpN cleavage. The pH-rate profile of ApA cleavage in the presence of (Zn2+)2-1 was sigmoidal, whereas those of (Zn2+)2-2 and (Zn2+)2-3 were bell-shaped. The pH titration study indicated that (Zn2+)2-1 dissociates only one aquo proton (up to pH 12), whereas (Zn2+)2-2 dissociates three aquo protons (up to pH 10.7). The observed differences in the pH-rate profile are attributable to the various distributions of the monohydroxo-dizinc species, which are responsible for NpN cleavage. As compared to that using (Zn2+)2-1, the NpN cleavage using (Zn2+)2-2 showed a greater rate constant, with a higher product ratio of 3′-NMP/2′-NMP. The saturation behaviors of the rate, with regard to the concentration of NpN, were analyzed by Michaelis–Menten type kinetics. Although the binding of (Zn2+)2-2 to ApA was weaker than that of (Zn2+)2-1, (Zn2+)2-2 showed a greater kcat value than (Zn2+)2-1, resulting in higher ApA cleavage activity of the former.

  由2:1的Zn(NO3)2与双配体TPHP（1）、TPmX（2）或TPpX（3）在水溶液中形成的二锌复合物在温和条件下有效水解二核苷酸单磷酸二酯（NpN）。双配体的结构影响了水合羟基二锌核心的构造，导致其催化NpN裂解的活性特征有所不同。在（Zn2+)2-1存在下，ApA裂解的pH-速率曲线呈S型，而（Zn2+)2-2和（Zn2+)2-3的曲线则呈钟形。pH滴定研究表明，（Zn2+)2-1仅在pH达到12时解离一个水合质子，而（Zn2+)2-2在pH达到10.7时则解离三个水合质子。观察到的pH-速率曲线差异可归因于单羟基二锌物种的不同分布，这些物种是NpN裂解的关键。与使用（Zn2+)2-1相比，使用（Zn2+)2-2时的NpN裂解表现出更大的速率常数，且3′-NMP/2′-NMP的产物比例更高。关于NpN浓度的速率饱和行为通过米氏动力学分析。尽管（Zn2+)2-2对ApA的结合强度弱于（Zn2+)2-1，但（Zn2+)2-2的kcat值高于（Zn2+)2-1，导致前者在ApA裂解中的活性更强。
• Synthesis and Enzymatic Deprotection of Biodegradably Protected Dinucleoside-2′,5′-monophosphates: 3-(Acetyloxy)-2,2-bis(ethoxycarbonyl)propyl Phosphoesters of 3′-O-(Acyloxymethyl)adenylyl-2′,5′-adenosines
  作者：Emilia Kiuru、Mikko Ora、Leonid Beigelman、Lawrence Blatt、Harri Lönnberg

  DOI：10.1002/cbdv.201000288

  日期：2011.2

  first step towards a viable prodrug strategy for short oligoribonucleotides, such as 2-5A and its congeners, adenylyl-2',5'-adenosines bearing a 3-(acetyloxy)-2,2-bis(ethoxycarbonyl)propyl group at the phosphate moiety, and an (acetyloxy)methyl- or a (pivaloyloxy)methyl-protected 3'-OH group of the 2'-linked nucleoside have been prepared. The enzyme-triggered removal of these protecting groups by hog

  迈向针对短寡核糖核苷酸（例如2-5A及其同类物）的可行前药策略的第一步，是在末端带有3-（乙酰氧基）-2,2-双（乙氧基羰基）丙基的腺苷基2'，5'-腺苷制备磷酸酯部分，并制备2'-连接核苷的（乙酰氧基）甲基或（新戊酰氧基）甲基保护的3'-OH基。已经研究了通过猪肝脏羧酯酶在pH 7.5和37°下用酶触发的方法去除这些保护基。事实证明，（乙酰氧基）甲基对于3'-O-保护来说太不稳定了，它的去除速度比磷酸酯保护基要快，这导致2'，5'-到3'，5'-异构化。核苷间磷酸酯键。另外，原料意外地转化为5'-O-乙酰化衍生物。（新戊酰氧基）甲基似乎更适合该目的。完全脱保护的2'，5'-ApA作为主要产物积累，尽管即使在这种情况下，也会发生原料的异构化。
• Oligonucleotide structural parameters that influence binding of 5'-O-triphosphoadenylyl-(2' .fwdarw. 5')-adenylyl-(2' .fwdarw. 5')-adenosine to the 5'-O-triphosphoadenylyl-(2' .fwdarw. 5')-adenylyl-(2' .fwdarw. 5')-adenosine dependent endoribonuclease: chain length, phosphorylation state, and heterocyclic base
  作者：Paul F. Torrence、Jiro Imai、Krystyna Lesiak、Jean Claude Jamoulle、Hiroaki Sawai

  DOI：10.1021/jm00372a004

  日期：1984.6

  higher core oligomers but approximately 100 times more effectively than the trimer core, A2'p5'A2'p5'A. (4) Base-modified analogues, such as p5'C2'p5'C2'p5'C, p5'U2'p5'U2'p5'U, or p5'I2'p5'I2'p5'I, were at least 2000 times less effectively bound to the endonuclease than p5'A2'p5'A2'p5'A. (5) The triphosphate ppp5 'I2'p5'I2'p5'I was 10 000 times less active than 2-5A as an inhibitor of translation. These

  制备了许多2'，5'-连接的寡腺苷酸及其类似物，并评估了它们与5'-O-三磷酸腺苷基-（2'---- 5'）-腺苷基-（2'-小鼠L细胞的--5'）-腺苷（2-5A）依赖性核糖核酸内切酶。测定寡核苷酸拮抗2-5A作用，从2-5A依赖性核酸酶置换放射性标记的探针或在无细胞系统中抑制翻译的能力。这些实验证明了以下内容：（1）需要5'-磷酸化的寡核苷酸中的三个AMP残基才能最大程度地与核酸内切酶相互作用，并且更高的寡聚体（大于或等于4个AMP残基）没有显示出明显更高的结合力。（2）为了获得最佳的结合活性，需要第三个（2'-末端）腺苷残基。（3）5' -寡核苷酸的磷酸化对于最大程度地结合核酸内切酶是必需的，但是较高的未磷酸化或核心寡聚体如A2'p5'A2'p5'A2'p5'A的第一个（从5'末端开始）核苷酸间磷酸可能部分替代5'-单磷酸酯部分的要求；与此相一致，5'pA2'p5'A2'p5'A的5
• 745. Polynucleotides. Part II. Homopolymers of cytidylic and pseudouridylic acid, copolymers with repeating subunits, and the stepwise synthesis of polyribonucleotides
  作者：A. M. Michelson

  DOI：10.1039/jr9590003655

  日期：——