6-(6-Oxo-4-propyl-1,6-dihydro-pyrimidin-2-ylsulfanyl)-hexanoic acid | 912956-74-2

• 分子结构分类: 有机化合物 - 脂质和类脂质分子 - 脂肪酰基
• 英文名称: 6-(6-Oxo-4-propyl-1,6-dihydro-pyrimidin-2-ylsulfanyl)-hexanoic acid
• 英文别名: 6-[(6-oxo-4-propyl-1H-pyrimidin-2-yl)sulfanyl]hexanoic acid
• CAS: 912956-74-2
• 化学式: C₁₃H₂₀N₂O₃S
• 分子量: 284.379
• InChiKey: JWNBBHYGKISMDE-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  2
• 重原子数：
  19
• 可旋转键数：
  9
• 环数：
  1.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.62
• 拓扑面积：
  104
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  5

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  6-(6-Oxo-4-propyl-1,6-dihydro-pyrimidin-2-ylsulfanyl)-hexanoic acid 在 氯甲酸乙酯 、 三乙胺 、 O-(2-甲氧基异丙基)羟胺 、 amberlyst-15 作用下， 以 四氢呋喃 、 甲醇 为溶剂， 反应 2.17h， 以60%的产率得到6-(6-Oxo-4-propyl-1,6-dihydro-pyrimidin-2-ylsulfanyl)-hexanoic acid hydroxyamide
  参考文献：
  名称：

  新型，含尿嘧啶的组蛋白脱乙酰基酶抑制剂的合成和生物学性质。

  摘要：

  测试了一系列新的化合物，其中包含尿嘧啶部分作为苯基/苯基烷基部分与N-羟基-聚亚甲基铝酰胺或-亚甲基肉桂酰胺基之间的连接单元（基于尿嘧啶的异羟肟酸，UBHA）对玉米组蛋白脱乙酰基酶（HDACs）和小鼠的抑制作用HDAC1。最有效的抑制剂是在尿嘧啶-C6位置具有苯基/苄基环且带有4-5个碳单元以及间-或对-亚甲基肉桂基部分作为间隔基的化合物。在基于细胞的人类HDAC1和HDAC4分析中，测试的两个UBHA抑制了HDAC1，但没有抑制HDAC4的免疫沉淀活性。在人白血病U937细胞中进行测试时，一些UBHA会导致细胞周期的G1期停滞。此外，1j显示出高抗增殖和剂量依赖性的粒细胞分化特性。

  DOI：

  10.1021/jm0605536
• 作为产物：
  描述：

  丙硫氧嘧啶 在 氢氧化钾 、 potassium carbonate 作用下， 以 乙醇 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 19.0h， 生成 6-(6-Oxo-4-propyl-1,6-dihydro-pyrimidin-2-ylsulfanyl)-hexanoic acid
  参考文献：
  名称：

  新型，含尿嘧啶的组蛋白脱乙酰基酶抑制剂的合成和生物学性质。

  摘要：

  测试了一系列新的化合物，其中包含尿嘧啶部分作为苯基/苯基烷基部分与N-羟基-聚亚甲基铝酰胺或-亚甲基肉桂酰胺基之间的连接单元（基于尿嘧啶的异羟肟酸，UBHA）对玉米组蛋白脱乙酰基酶（HDACs）和小鼠的抑制作用HDAC1。最有效的抑制剂是在尿嘧啶-C6位置具有苯基/苄基环且带有4-5个碳单元以及间-或对-亚甲基肉桂基部分作为间隔基的化合物。在基于细胞的人类HDAC1和HDAC4分析中，测试的两个UBHA抑制了HDAC1，但没有抑制HDAC4的免疫沉淀活性。在人白血病U937细胞中进行测试时，一些UBHA会导致细胞周期的G1期停滞。此外，1j显示出高抗增殖和剂量依赖性的粒细胞分化特性。

  DOI：

  10.1021/jm0605536

文献信息

• Exploring the connection unit in the HDAC inhibitor pharmacophore model: Novel uracil-based hydroxamates
  作者：Antonello Mai、Silvio Massa、Dante Rotili、Riccardo Pezzi、Patrizia Bottoni、Roberto Scatena、Joachim Meraner、Gerald Brosch

  DOI：10.1016/j.bmcl.2005.07.081

  日期：2005.11

  Starting from the pharmacophore model for HDAC inhibitor design, a novel series of hydroxamates bearing a uracil moiety as connecting unit (CU) has been prepared and tested. Almost all compounds exhibited HDAC inhibiting activity at low nanomolar concentrations, the N-hydroxy-6-(3,4-dihydro-4-oxo-6-benzyl- and -6-phenyl-2-pyrimidinylthio)hexanamides 1d and 11 being more potent than SAHA in enzymatic assays. Such compounds also caused hyperacetylation in NIH3T3 cell core histones and were endowed with interesting antiproliferative and cytodifferentiating effects in human leukemia (HL-60) cells. (c) 2005 Elsevier Ltd. All rights reserved.
• Synthesis and Biological Properties of Novel, Uracil-Containing Histone Deacetylase Inhibitors
  作者：Antonello Mai、Silvio Massa、Dante Rotili、Silvia Simeoni、Rino Ragno、Giorgia Botta、Angela Nebbioso、Marco Miceli、Lucia Altucci、Gerald Brosch

  DOI：10.1021/jm0605536

  日期：2006.10.1

  A novel series of compounds containing a uracil moiety as the connection unit between a phenyl/phenylalkyl portion and a N-hydroxy-polymethylenealkanamide or -methylenecinnamylamide group (uracil-based hydroxamic acids, UBHAs) was tested against maize histone deacetylases (HDACs) and mouse HDAC1. Compounds with a phenyl/benzyl ring at the uracil-C6 position and bearing 4-5 carbon units as well as a

  测试了一系列新的化合物，其中包含尿嘧啶部分作为苯基/苯基烷基部分与N-羟基-聚亚甲基铝酰胺或-亚甲基肉桂酰胺基之间的连接单元（基于尿嘧啶的异羟肟酸，UBHA）对玉米组蛋白脱乙酰基酶（HDACs）和小鼠的抑制作用HDAC1。最有效的抑制剂是在尿嘧啶-C6位置具有苯基/苄基环且带有4-5个碳单元以及间-或对-亚甲基肉桂基部分作为间隔基的化合物。在基于细胞的人类HDAC1和HDAC4分析中，测试的两个UBHA抑制了HDAC1，但没有抑制HDAC4的免疫沉淀活性。在人白血病U937细胞中进行测试时，一些UBHA会导致细胞周期的G1期停滞。此外，1j显示出高抗增殖和剂量依赖性的粒细胞分化特性。