3',5'-bis-O-tetrahydropyranyl-araU | 157024-75-4

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘧啶核苷
• 英文名称: 3',5'-bis-O-tetrahydropyranyl-araU
• 英文别名: 9-<3,5-di-O-(tetrahydropyran-2-yl)-β-D-arabinofuranosyl>uracil；1-(2-hydroxy-3,5-di(O-tetrahydropyran-2-yl)β-D-arabinofuranosyl)uracil；1-[(2R,3S,4S,5R)-3-hydroxy-4-(oxan-2-yloxy)-5-(oxan-2-yloxymethyl)oxolan-2-yl]pyrimidine-2,4-dione
• CAS: 157024-75-4
• 化学式: C₁₉H₂₈N₂O₈
• 分子量: 412.44
• InChiKey: MKSDSGIDYCYKAY-VNYZSGJOSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  0.3
• 重原子数：
  29
• 可旋转键数：
  6
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.79
• 拓扑面积：
  116
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  8

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  3',5'-bis-O-tetrahydropyranyl-araU 在 吡啶 、 乙醇 、 二乙胺基三氟化硫 、 4-甲基苯磺酸吡啶 作用下， 以 二氯甲烷 为溶剂， 反应 29.0h， 生成 2'-氟-2'-脱氧尿苷
  参考文献：
  名称：

  Synthesis and Hypnotic and Anti-Human Immunodeficiency Virus-1 Activities of N3-Substituted 2'-Deoxy-2'-fluorouridines.

  摘要：

  9-[3, 5-二-O-(四氢吡喃-2-基)-β-D-阿拉伯呋喃糖基]尿嘧啶 (2) 与二乙氨基三氟化硫在吡啶存在下反应，得到 2'-脱氧-2'-氟核苷 3a ，由此以良好的产率合成了 2'-脱氧-2'-氟胞苷 (4b)。将化合物3a脱保护，随后用各种苄基卤或2-氯-4-氟苯乙酮处理，得到相应的N3-取代的2'-脱氧-2'-氟尿苷5a-c和6。化合物5a-c以及6，对小鼠表现出较弱的催眠活性。化合物4b对人类免疫缺陷病毒1表现出中等的抗病毒活性，但3b、5a-c和6实际上没有活性。

  DOI：

  10.1248/cpb.42.595
• 作为产物：
  描述：

  2,2'-脱水尿苷 在 对甲苯磺酸 、 potassium hydroxide 作用下， 以 乙醇 、 乙腈 为溶剂， 反应 20.0h， 生成 3',5'-bis-O-tetrahydropyranyl-araU
  参考文献：
  名称：

  含有 C5-丙炔基修饰的阿拉伯核酸的寡核苷酸：合成、生物物理和反义特性

  摘要：

  含有 C5 -丙炔基修饰的阿拉伯核酸的寡核苷酸：很少有寡核苷酸修饰支持 RNA 的 RNase H 裂解，限制了 gapmer 设计的候选者。阿拉伯核酸 (ANA)/RNA 双链体是 RNase H 底物，但热稳定性较差。合成了含有 ANA 核心和 C5-丙炔基核碱基的寡核苷酸，与 RNA 形成稳定的双链体，带有 MOE 翼的 gapmer 引发大肠杆菌RNase H 裂解——这些发现有助于反义治疗设计。

  DOI：

  10.1002/cbic.202300068

文献信息

• 3-甲基尿苷及4-甲基胞苷核苷类化合物、合成 方法及其药物用途
  申请人：河南省科学院高新技术研究中心

  公开号：CN103709220B

  公开（公告）日：2016-02-17

  本发明公开了3-甲基尿苷和4-甲基胞苷核苷类化合物、合成方法及其药物用途，属药物化学领域。该类化合物具有如下结构通式：，该类化合物对糖环和碱基同时进行修饰，增加了化合物的活性和减小毒性，为此类药物的开发提供了较好的应用前景，可以应用于抗HBV药物的制备。合成方法简单易行，为大量合成此类化合物提供了条件。
• Novel Interactions of Fluorinated Nucleotide Derivatives Targeting Orotidine 5′-Monophosphate Decarboxylase
  作者：Melissa Lewis、Maria Elena Meza-Avina、Lianhu Wei、Ian E. Crandall、Angelica Mara Bello、Ewa Poduch、Yan Liu、Christopher J. Paige、Kevin C. Kain、Emil F. Pai、Lakshmi P. Kotra

  DOI：10.1021/jm101642g

  日期：2011.4.28

  antiviral, anticancer, and other biological activities. However, their direct interactions at target binding sites are not well understood. A new class of 2′-deoxy-2′-fluoro-C6-substituted uridine and UMP derivatives were synthesized and evaluated as inhibitors of orotidine 5′-monophosphate decarboxylase (ODCase or OMPDCase). These compounds were synthesized from the key intermediate, fully protected 2′-de

  氟化核苷和核苷酸因其抗病毒、抗癌和其他生物活性而引起药物化学家的极大兴趣。然而，它们在目标结合位点的直接相互作用尚不清楚。合成了一类新的 2'-脱氧-2'-氟-C6-取代的尿苷和 UMP 衍生物，并将其作为乳清酸 5'-单磷酸脱羧酶（ODCase 或 OMPDCase）的抑制剂进行评估。这些化合物是由关键中间体、完全保护的 2'-脱氧-2'-氟尿苷合成的。在合成的化合物中，2'-deoxy-2'-fluoro-6-iodo-UMP 以 0.62 ± 0.02 M -1 s -1的二级速率常数共价抑制人 ODCase. 有趣的是，6-cyano-2'-fluoro 衍生物与 ODCase 共价相互作用，打破了传统思维，其核糖基衍生物通过 ODCase 转化为 BMP。这证实了 2'-氟部分影响核苷酸 C6 位置的化学反应，从而影响 ODCase 活性位点的相互作用。将 2'-氟化核苷酸的分子相互作用与
• 一种2’-氟-2’-脱氧尿苷的合成方法及其中间体
  申请人：上海皓鸿生物医药科技有限公司

  公开号：CN113683648A

  公开（公告）日：2021-11-23

  本发明涉及一种2’‑氟‑2’‑脱氧尿苷的合成方法及其中间体，通过如下式方法实施，本发明合成路线新颖，操作简便，收率高，安全性好，不需要柱层析，适合工业化生产。其中R为羟基保护基，最优选四氢吡喃基团(THP基团)作为羟基保护基；其中R’为本领域羟基常规保护基，优选的，R’为四氢吡喃基(THP)、甲氧基甲基醚、硅烷基(例如：叔丁基二甲基硅烷基)或酰基(例如：乙酰基)，优选乙酰基。
• Novel selective human mitochondrial kinase inhibitors: Design, synthesis and enzymatic activity
  作者：Nunzia Ciliberti、Stefano Manfredini、Angela Angusti、Elisa Durini、Nicola Solaroli、Silvia Vertuani、Lisa Buzzoni、Maria Cruz Bonache、Efrat Ben-Shalom、Anna Karlsson、Ann Saada、Jan Balzarini

  DOI：10.1016/j.bmc.2007.01.049

  日期：2007.4

  Selective and effective TK2 inhibitors can be obtained by introduction of bulky lipophilic chains (acyl or alkyl entities) at the 2' position of araT and BVaraU, nucleoside analogues naturally endowed with a low TK2 affinity. These derivatives showed a competitive inhibitory activity against TK2 in micromolar range. BVaraU nucleoside analogues, modified on the 2'-O-acyl chain with a terminal N-Boc amino-group, conserved or increased the inhibitory activity against TK2 (71 and 7m IC50: 6.4 and 3.8 mu M, respectively). The substitution of an ester for a carboxamide moiety at the 2' position of araT afforded a consistent reduction of the inhibitory activity (25, IC50: 480 mu M). On the contrary, modifications at 2'-OH position of araC and araG, have provided inactive derivatives against TK2 and dGK, respectively. The biological activity of a representative compound, 2'-O-decanoyl-BVaraU, was also investigated in normal human fibroblasts and was found to impair mitochondrial function due to TK2 inhibition. (c) 2007 Published by Elsevier Ltd.
• Design, Synthesis and Enzymatic Activity of Highly Selective Human Mitochondrial Thymidine Kinase Inhibitors
  作者：Stefano Manfredini、Pier G Baraldi、Elisa Durini、Luca Porcu、Angela Angusti、Silvia Vertuani、Nicola Solaroli、Erik De Clercq、Anna Karlsson、Jan Balzarini

  DOI：10.1016/s0960-894x(01)00207-4

  日期：2001.5

  Highly selective arabinofuranosyl nucleosides, which inhibit the mitochondrial thymidine kinase (TK-2) without affecting the closely related herpes simplex virus type 1 thymidine kinase (HSV-1 TK), varicella-zoster virus thymidine kinase (VZV-TK), cytosolic thymidine kinase (TK-1) or the multifunctional Drosophila melanogaster deoxyribonucleoside kinase (Dm-dNK), have been obtained. SAR studies indicate a close relation between the length of the substituent at the 2' position of the arabinofuranosyl moiety and the inhibitory activity. (C) 2001 Elsevier Science Ltd. All rights reserved.