1-(3,5-di-O-benzoyl-2-deoxy-2,4-difluoro-β-D-ribofuranosyl)uracil | 1612841-23-2

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 苯和取代衍生物
• 英文名称: 1-(3,5-di-O-benzoyl-2-deoxy-2,4-difluoro-β-D-ribofuranosyl)uracil
• 英文别名: ((2S,3S,4R,5R)-3-(benzoyloxy)-5-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)-2,4-difluorotetrahydrofuran-2-yl)methyl benzoate；[(2S,3S,4R,5R)-3-benzoyloxy-5-(2,4-dioxopyrimidin-1-yl)-2,4-difluorooxolan-2-yl]methyl benzoate
• CAS: 1612841-23-2
• 化学式: C₂₃H₁₈F₂N₂O₇
• 分子量: 472.402
• InChiKey: MNXZLXFJRVGWKI-ISJRUSPKSA-N

物化性质

• 密度：
  1.49±0.1 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  2.9
• 重原子数：
  34
• 可旋转键数：
  8
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.22
• 拓扑面积：
  111
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  9

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  1-(3,5-di-O-benzoyl-2-deoxy-2,4-difluoro-β-D-ribofuranosyl)uracil 在 1H-1,2,4-三唑 、 三乙胺 、 三氯氧磷 、 ammonium hydroxide 作用下， 以 乙腈 为溶剂， 反应 2.5h， 生成
  参考文献：
  名称：

  刚性的2'，4'-二氟核糖核苷：合成，构象分析以及通过HCV聚合酶掺入新生RNA

  摘要：

  我们报告了2'-deoxy-2'，4'-difluorouridine（2'，4'-diF-rU）和胞苷（2'，4'-diF-rC）核苷的合成和构象性质。NMR分析和量子力学计算表明，由两个氟诱导的强立体电子效应基本上“锁定”了假旋转循环北部区域中糖的构象。我们的研究还证明，NS5B HCV RNA聚合酶能够容纳2'，4'-diF-rU 5'-三磷酸酯（2'，4'-diF-rUTP）并将单磷酸酯连接至RNA引物链。2'，4'-diF-rUTP抑制了二核苷酸引发的反应中的RNA合成，尽管半数抑制浓度相对较高（IC 50> 50μM）。2'，4'-diF-rU / C代表缺乏双环结构的“锁定”核糖核苷类似物的罕见例子。

  DOI：

  10.1021/jo500794v
• 作为产物：
  描述：

  2'-氟-2'-脱氧尿苷 在 吡啶 、 4-二甲氨基吡啶 、 碘 、 sodium methylate 、 silver fluoride 、 三乙胺 、 间氯过氧苯甲酸 、 三苯基膦 作用下， 以 四氢呋喃 、 甲醇 、 二氯甲烷 、 水 、 乙腈 为溶剂， 反应 77.75h， 生成 1-(3,5-di-O-benzoyl-2-deoxy-2,4-difluoro-β-D-ribofuranosyl)uracil
  参考文献：
  名称：

  刚性的2'，4'-二氟核糖核苷：合成，构象分析以及通过HCV聚合酶掺入新生RNA

  摘要：

  我们报告了2'-deoxy-2'，4'-difluorouridine（2'，4'-diF-rU）和胞苷（2'，4'-diF-rC）核苷的合成和构象性质。NMR分析和量子力学计算表明，由两个氟诱导的强立体电子效应基本上“锁定”了假旋转循环北部区域中糖的构象。我们的研究还证明，NS5B HCV RNA聚合酶能够容纳2'，4'-diF-rU 5'-三磷酸酯（2'，4'-diF-rUTP）并将单磷酸酯连接至RNA引物链。2'，4'-diF-rUTP抑制了二核苷酸引发的反应中的RNA合成，尽管半数抑制浓度相对较高（IC 50> 50μM）。2'，4'-diF-rU / C代表缺乏双环结构的“锁定”核糖核苷类似物的罕见例子。

  DOI：

  10.1021/jo500794v

文献信息

• 2',4'-FLUORO NUCLEOSIDES FOR THE TREATMENT OF HCV
  申请人：IDENIX PHARMACEUTICALS, INC.

  公开号：US20140294769A1

  公开（公告）日：2014-10-02

  Provided herein are compounds, methods and pharmaceutical compositions for use in treatment of viral infections, including hepatitis C virus (HCV) infections, in hosts in need thereof. In certain embodiments, the compounds are 2′,4′-fluoro nucleosides according to Formula 1001: or a pharmaceutically acceptable salt, solvate, stereoisomeric form, tautomeric form, or polymorphic form thereof, wherein Base, R A , and PD are as described herein. In certain embodiments, 2′,4′-fluoro nucleosides are provided which display remarkable efficacy and bioavailability for the treatment of, for example, HCV infection in a human.

  本文提供了用于治疗病毒感染，包括丙型肝炎病毒（HCV）感染的化合物、方法和制药组合物，适用于需要治疗的宿主。在某些实施例中，化合物是按照公式1001的2′，4′-氟核苷，或其药学上可接受的盐、溶剂化物、立体异构体形式、互变异构体形式或多晶形式，其中Base、RA和PD如本文所述。在某些实施例中，提供了2′，4′-氟核苷，其在治疗人体中的HCV感染等方面表现出显著的疗效和生物利用度。
• Nitro-Activated Nucleobase Exchange in the Synthesis of 2′-Fluoro-2′-Deoxyribonucleosides
  作者：Yong Gong、Wei Zhang、Lu Chen、Ronghui Lin、Ronghui Zhou、Rhys Salter

  DOI：10.1021/acs.joc.2c01093

  日期：2022.7.15

  Functionalized nucleosides bearing pyrimidine or purine bases can be prepared by activation of accessible pyrimidine nucleosides and subsequent transglycosylation. Nitration of lumicitabine, a 2′-fluoro-2′-deoxycytidine class antiviral agent, and its 2′-fluoro-2′-deoxyuridine precursor produce the same 5-nitro-2′-fluoro-2′-deoxyuridine. Under Vorbrüggen conditions, 5-nitrouracil serves as the leaving

  带有嘧啶或嘌呤碱基的功能化核苷可以通过活化可接近的嘧啶核苷和随后的转糖基化来制备。lumicitabine（一种 2'-fluoro-2'-deoxycytidine 类抗病毒剂）及其 2'-fluoro-2'-deoxyuridine 前体的硝化产生相同的 5-nitro-2'-fluoro-2'-deoxyuridine。在 Vorbrüggen 条件下，5-硝基尿嘧啶作为离去核碱基，能够与嘧啶和嘌呤核碱基交换为异头 2'-氟-2'-脱氧核糖核苷，通常有利于 β-端基异构体。该策略也适用于 2'-fluoro-2'-deoxyuridines 的同位素标记。
• SUBSTITUTED NUCLEOSIDES, NUCLEOTIDES AND ANALOGS THEREOF
  申请人：Alios BioPharma, Inc.

  公开号：US20180044369A1

  公开（公告）日：2018-02-15

  Disclosed herein are nucleosides, nucleotides and nucleotide analogs, methods of synthesizing the same and methods of treating diseases and/or conditions such as a Picornavirus and/or Flaviviridae infection with one or more nucleosides, nucleotides and nucleotide analogs.
• US9187515B2
  申请人：——

  公开号：US9187515B2

  公开（公告）日：2015-11-17
• [EN] 2',4'-FLUORO NUCLEOSIDES FOR THE TREATMENT OF HCV<br/>[FR] 2',4'-FLUORONUCLÉOSIDES POUR LE TRAITEMENT DU VHC
  申请人：IDENIX PHARMACEUTICALS INC

  公开号：WO2014165542A1

  公开（公告）日：2014-10-09

  Provided herein are compounds, methods and pharmaceutical compositions for use in treatment of viral infections, including hepatitis C virus (HCV) infections, in hosts in need thereof. In certain embodiments, the compounds are 2',4'-fluoro nucleosides according to Formula 1001: (1001); or a pharmaceutically acceptable salt, solvate, stereoisomeric form, tautomeric form, or polymorphic form thereof, wherein Base, RA, and PD are as described herein. In certain embodiments, 2',4'-fluoro nucleosides are provided which display remarkable efficacy and bioavailability for the treatment of, for example, HCV infection in a human.