methyl shikimate 3,4-cyclic sulfite | 352533-24-5

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机氧化合物 - 有机含氧阴离子化合物
• 英文名称: methyl shikimate 3,4-cyclic sulfite
• 英文别名: (3R,4S,5R)-methyl 3,4-O-thionylshikimate；methyl (3aS,4R,7aR)-4-hydroxy-2-oxo-3a,4,5,7a-tetrahydro-1,3,2lambda4-benzodioxathiole-6-carboxylate；methyl (3aS,4R,7aR)-4-hydroxy-2-oxo-3a,4,5,7a-tetrahydro-1,3,2λ4-benzodioxathiole-6-carboxylate
• CAS: 352533-24-5
• 化学式: C₈H₁₀O₆S
• 分子量: 234.23
• InChiKey: KIVDRDXJMSJPPK-XCYWAPSCSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -0.3
• 重原子数：
  15
• 可旋转键数：
  2
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.62
• 拓扑面积：
  101
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  7

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  methyl shikimate 3,4-cyclic sulfite 在 吡啶 、 sodium azide 、 三乙胺 、 三苯基膦 作用下， 以 四氢呋喃 、 二氯甲烷 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 26.0h， 生成 methyl (3S,4R,5R)-3-acetamido-5-acetoxy-4-(methanesulfonyloxy)cyclohex-1-ene-1-carboxylate
  参考文献：
  名称：

  碳环唾液酸类似物的合成用于抑制流感病毒神经氨酸酶

  摘要：

  流感病毒神经氨酸酶（NA）对于病毒感染至关重要，并为抗病毒药物的开发提供了潜在的靶标。我们准备了一个碳环唾液酸类似物，它可能能够抑制NA。其结构类似于NA催化的反应的过渡态。选择奎宁酸作为起始原料是由于其易得性和适合目标结构的立体化学特征。首先将奎宁酸转化为sh草酸；然后将其转化为sh草酸。然后选择性地官能化该产物的三个羟基官能团中的两个，以获得目标分子（3R，4S，5R）-4-乙酰氨基-3-胍基-5-羟基环己-1-烯-1-羧酸。

  DOI：

  10.1016/s0008-6215(01)00079-9
• 作为产物：
  描述：

  methyl shikimate 在 氯化亚砜 、 三乙胺 作用下， 以 二氯甲烷 、 乙酸乙酯 为溶剂， 反应 13.0h， 以98%的产率得到methyl shikimate 3,4-cyclic sulfite
  参考文献：
  名称：

  通过环亚硫酸盐中间体新颖有效地合成四个有用的ki草酸衍生的环氧手性构建基

  摘要：

  4,5-环氧-3-羟基-环己基-1-烯-羧酸甲酯（1a - 1d）的所有四个立体异构体都是有用的手性结构单元。本文介绍了通过环状亚硫酸盐中间体从自然丰富的（-）-草酸（2）合成这四种环氧手性结构单元的新颖有效的方法。目标化合物（3 R，4 R，5 S）-1a是由（-）-ki草酸分四步合成的，总收率为79％。其他三种目标化合物（3 S，4 R，5 S）-1b，（3 S，4 S，5 R） - 1C和（3 - [R，4小号，5 - [R ）- 1D） - -莽草酸，56％分别为64％和65％总产率，分别通过从（七个步骤合成。

  DOI：

  10.1002/cjoc.201201000

文献信息

• Mycobacterium tuberculosis Shikimate Kinase Inhibitors: Design and Simulation Studies of the Catalytic Turnover
  作者：Beatriz Blanco、Verónica Prado、Emilio Lence、José M. Otero、Carmela Garcia-Doval、Mark J. van Raaij、Antonio L. Llamas-Saiz、Heather Lamb、Alastair R. Hawkins、Concepción González-Bello

  DOI：10.1021/ja405853p

  日期：2013.8.21

  Shikimate kinase (SK) is an essential enzyme in several pathogenic bacteria and does not have any counterpart in human cells, thus making it an attractive target for the development of new antibiotics. The key interactions of the substrate and product binding and the enzyme movements that are essential for catalytic turnover of the Mycobacterium tuberculosis shikimate kinase enzyme (Mt-SK) have been investigated by structural and computational studies. Based on these studies several substrate analogs were designed and assayed. The crystal structure of Mt-SK in complex with ADP and one of the most potent inhibitors has been solved at 2.15 angstrom. These studies reveal that the fixation of the diaxial conformation of the C4 and C5 hydroxyl groups recognized by the enzyme or the replacement of the C3 hydroxyl group in the natural substrate by an amino group is a promising strategy for inhibition because it causes a dramatic reduction of the flexibility of the LID and shikimic acid binding domains. Molecular dynamics simulation studies showed that the product is expelled from the active site by three arginines (Arg117, Arg136, and Arg58). This finding represents a previously unknown key role of these conserved residues. These studies highlight the key role of the shikimic acid binding domain in the catalysis and provide guidance for future inhibitor designs.
• Novel and Efficient Syntheses of Four Useful Shikimate-derived Epoxy Chiral Building Blocks via Cyclic Sulfite Intermediates
  作者：Na Quan、Liangdeng Nie、Xiaoxin Shi、Ruiheng Zhu、Xia Lü

  DOI：10.1002/cjoc.201201000

  日期：2012.12

  All of the four stereoisomers of methyl 4,5‐epoxy‐3‐hydroxy‐cyclohex‐1‐ene‐carboxylate (1a–1d) are useful chiral building blocks. Novel and efficient syntheses of these four epoxy chiral building blocks from naturally abundant (−)‐shikimic acid (2) via cyclic sulfite intermediates are described in this article. The targeted compound (3R,4R,5S)‐1a was synthesized via four steps from (−)‐shikimic acid

  4,5-环氧-3-羟基-环己基-1-烯-羧酸甲酯（1a - 1d）的所有四个立体异构体都是有用的手性结构单元。本文介绍了通过环状亚硫酸盐中间体从自然丰富的（-）-草酸（2）合成这四种环氧手性结构单元的新颖有效的方法。目标化合物（3 R，4 R，5 S）-1a是由（-）-ki草酸分四步合成的，总收率为79％。其他三种目标化合物（3 S，4 R，5 S）-1b，（3 S，4 S，5 R） - 1C和（3 - [R，4小号，5 - [R ）- 1D） - -莽草酸，56％分别为64％和65％总产率，分别通过从（七个步骤合成。
• Synthesis of a carbocyclic sialic acid analogue for the inhibition of influenza virus neuraminidase
  作者：Armandodoriano Bianco、Mario Brufani、Fedele Manna、Cristiana Melchioni

  DOI：10.1016/s0008-6215(01)00079-9

  日期：2001.5

  The influenza virus neuraminidase (NA) is essential for viral infection and offers a potential target for antiviral drug development. We prepared a carbocyclic sialic acid analogue, potentially able to inhibit NA. Its structure is an analogue of the transition-state of the reaction catalysed by NA. As starting material, quinic acid was selected owing to its ready availability and its stereochemical

  流感病毒神经氨酸酶（NA）对于病毒感染至关重要，并为抗病毒药物的开发提供了潜在的靶标。我们准备了一个碳环唾液酸类似物，它可能能够抑制NA。其结构类似于NA催化的反应的过渡态。选择奎宁酸作为起始原料是由于其易得性和适合目标结构的立体化学特征。首先将奎宁酸转化为sh草酸；然后将其转化为sh草酸。然后选择性地官能化该产物的三个羟基官能团中的两个，以获得目标分子（3R，4S，5R）-4-乙酰氨基-3-胍基-5-羟基环己-1-烯-1-羧酸。